; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0015139 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0015139
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionmultiprotein bridging factor 1B
Genome locationchr12:8034144..8037118
RNA-Seq ExpressionLag0015139
SyntenyLag0015139
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572392.1 Sec1 family domain-containing protein MIP3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-6497.18Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022148069.1 multiprotein-bridging factor 1a [Momordica charantia]2.5e-6395.77Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022952433.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita moschata]5.0e-6497.18Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022969265.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita maxima]1.9e-6397.18Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET +KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_038888605.1 multiprotein-bridging factor 1b [Benincasa hispida]1.9e-6397.18Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        M GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENL H+RVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D2X2 multiprotein-bridging factor 1a1.2e-6395.77Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1EWB8 multiprotein-bridging factor 1a3.5e-6395.77Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+HE+VPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1GKJ7 multiprotein-bridging factor 1b-like2.4e-6497.18Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1HZG6 multiprotein-bridging factor 1b-like9.2e-6497.18Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET +KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1JEK2 multiprotein-bridging factor 1a3.5e-6395.77Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+HE+VPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.8e-2755.64Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK  AG NK      + NT KLD ETE L H+RVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQ+I +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.0e-2754.89Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK    + + NT KLD ETE L H+RVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQ+I +YE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c9.3e-2948.92Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    +RV  E++  I +AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b6.0e-6085.92Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAG+NKAASS TSLNT+KLDD+TENL+H+RVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a3.5e-6086.62Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAGTNKAASS TSLNT+ LDD+TENLTHERVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A2.5e-6186.62Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAGTNKAASS TSLNT+ LDD+TENLTHERVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C6.6e-3048.92Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    +RV  E++  I +AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C3.4e-1041.57Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQAR
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    +RV  E++  + + R
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B4.2e-6185.92Show/hide
Query:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAG+NKAASS TSLNT+KLDD+TENL+H+RVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATTGGACCGATTTCTCAAGATTGGGAACCCGTTGTCATCAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCCGTAAACGCCGCCCGCCG
CGCCGGTGCTGAGATCGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAACAAAGCTGCCTCCAGCAGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGACGATGAGACAGAAAACC
TCACTCATGAACGGGTACCGACTGAGCTGAAGAAGGCAATTATGCAGGCCCGTACTGAGAAGAAACTTACCCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAA
ATCATTCAGGAATATGAGTCTGGAAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATCACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAGCCAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGAATTGGACCGATTTCTCAAGATTGGGAACCCGTTGTCATCAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCCGTAAACGCCGCCCGCCG
CGCCGGTGCTGAGATCGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAACAAAGCTGCCTCCAGCAGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGACGATGAGACAGAAAACC
TCACTCATGAACGGGTACCGACTGAGCTGAAGAAGGCAATTATGCAGGCCCGTACTGAGAAGAAACTTACCCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAATGAGAAGCCACAA
ATCATTCAGGAATATGAGTCTGGAAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATCACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAGCCAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEKPQ
IIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK