; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0015202 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0015202
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRibonuclease Z
Genome locationchr12:8611379..8617442
RNA-Seq ExpressionLag0015202
SyntenyLag0015202
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR001279 - Metallo-beta-lactamase
IPR036866 - Ribonuclease Z/Hydroxyacylglutathione hydrolase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589282.1 tRNase Z TRZ2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.4e-18594.52Show/hide
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A0A0A0KHX0 Lactamase_B domain-containing protein1.7e-18192.73Show/hide
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A0A1S3BN27 ribonuclease Z, chloroplastic4.1e-18392.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9DNT1 Ribonuclease Z6.7e-1328.63Show/hide
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        HI +++   +   +K  LL H S+RY+L DI    ++LQ++
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P60193 Nuclear ribonuclease Z (Fragment)1.2e-5962.72Show/hide
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        +++EGY +EGIS+GG ETCVI P    AFDIGRCP RA+ Q+F+FI+HAHLDHIGGLPMYVA+RGLY L PPT+FVP  ++E VE+L ++HR+M Q EL 
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          LV LD+G+ YE+R +L  RAF+T H IPSQGYVIYSV++KLK+ Y+ L G +I++LK SGVEIT+T+
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Q58897 Ribonuclease Z1.5e-1229.31Show/hide
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        N +FITH H DHI G+P  + S G +       +F P   KE +E  L++     +  ++V  +      T     N    A+ T+H IPS  Y+   ++
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        K      K KK  + + G  ++KLK       I   I+ PE           +A++GDT    DF    +    L   +LI EATF D   + + A+++ 
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        H+ I + +  A+    KA++LTH S+RY  E+
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Q8L633 tRNase Z TRZ2, chloroplastic2.5e-13770.09Show/hide
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        MQ+S +  P+  P+IFP    H+P + + +       +    ++ ++ SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y+IEGISVGG ETCVI+PE
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Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQVELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFE
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +FVPP IKEDVEKLLEIHR+MGQVEL V+L+ L VG+TYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQVELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFE

Query:  TKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIF
        T HVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTT+++MLDPRNADALRAK+LITEATFLDE  S EHA+  GHTHI 
Subjt:  TKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIF

Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGFK
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E+IR+AV KLQSKV+AKV+PLTEGF+
Subjt:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGFK

Q8LGU7 tRNase Z TRZ12.0e-9458.12Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQV
        +K + +EGY IEG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ VP  IKE VE L E+HR +   
Subjt:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQV

Query:  ELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFETKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAK
        EL+ +LV LD+G+ + +R +L  +AF+T HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTT+DF++D  NADAL+AK
Subjt:  ELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFETKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAK

Query:  ILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGF
        +L+ E+TFLD+ VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY +++I  AVS L   +  +V  LT+GF
Subjt:  ILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74700.1 tRNAse Z11.4e-9558.12Show/hide
Query:  RKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPEFKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQV
        +K + +EGY IEG+S+GG ETC+I P  + AFDIGRCP RAI Q+F+FI+H+H+DHIGGLPMYVA+RGLY + PPT+ VP  IKE VE L E+HR +   
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Query:  ELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFETKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAK
        EL+ +LV LD+G+ + +R +L  +AF+T HVI SQGYV+YS + KLKK+Y+ L G +I+ LK SGVEITD+I++PEVAFTGDTT+DF++D  NADAL+AK
Subjt:  ELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFETKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAK

Query:  ILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGF
        +L+ E+TFLD+ VS+EHAR +GH HI EI+ +A+   NKAILL HFS+RY +++I  AVS L   +  +V  LT+GF
Subjt:  ILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIFEIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGF

AT2G01730.1 cleavage and polyadenylation specificity factor 73 kDa subunit-II2.4e-0525Show/hide
Query:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQVELEV---------DLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFETKHVIPS
        + ITH H+DH+G LP +       G   +S PT  + P + ED  +++   R  G+ EL            ++A+D+  T ++  +L  RA+   HV+ +
Subjt:  VFITHAHLDHIGGLPMYV---ASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQVELEV---------DLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFETKHVIPS

Query:  QGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGD--TTTDFMLDPRNADALRAKILITEATF
           ++Y+                     K G           + +TGD   TTD  L     D L+  +LI+E+T+
Subjt:  QGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGD--TTTDFMLDPRNADALRAKILITEATF

AT2G04530.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein1.8e-13870.09Show/hide
Query:  MQISMAISPLRAPQIFP---FHQPILQSPKPQGIALQSHVSPLNSLRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPE
        MQ+S +  P+  P+IFP    H+P + + +       +    ++ ++ SG  S+I      EEEYR+AR+ VNRKGV+LE Y+IEGISVGG ETCVI+PE
Subjt:  MQISMAISPLRAPQIFP---FHQPILQSPKPQGIALQSHVSPLNSLRDSGLLSTIG----VEEEYRRARSQVNRKGVDLEGYSIEGISVGGQETCVIIPE

Query:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQVELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFE
         KC FDIGRCPSRAIQQ F+FITHAHLDHIGGLPMYVASRGLY+L PP +FVPP IKEDVEKLLEIHR+MGQVEL V+L+ L VG+TYE+RN++V R F 
Subjt:  FKCAFDIGRCPSRAIQQNFVFITHAHLDHIGGLPMYVASRGLYSLSPPTVFVPPCIKEDVEKLLEIHRSMGQVELEVDLVALDVGDTYEMRNNLVCRAFE

Query:  TKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIF
        T HVIPSQGYVIYSVRKKL+KQY HLKGKQIEK+KKSGVEITDTILSPE+AFTGDTT+++MLDPRNADALRAK+LITEATFLDE  S EHA+  GHTHI 
Subjt:  TKHVIPSQGYVIYSVRKKLKKQYMHLKGKQIEKLKKSGVEITDTILSPEVAFTGDTTTDFMLDPRNADALRAKILITEATFLDEGVSIEHARQHGHTHIF

Query:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGFK
        +IIENA+WIR+K +LLTHFSSRYH+E+IR+AV KLQSKV+AKV+PLTEGF+
Subjt:  EIIENAQWIRNKAILLTHFSSRYHLEDIRKAVSKLQSKVTAKVVPLTEGFK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGTATTCAATCGAGGGAATTTCTGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATTATTCCGGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCATCTCGAGCCATTCAGCAG
AACTTTGTATTCATCACTCATGCCCATCTCGATCACATTGGTGGGCTACCAATGTATGTAGCTAGTCGTGGTTTATATAGTTTAAGTCCTCCTACAGTATTTGTGCCTCC
TTGTATTAAAGAAGATGTGGAGAAACTACTTGAGATTCACAGAAGCATGGGCCAGGTGGAGTTGGAAGTTGATCTGGTTGCATTAGATGTAGGAGACACATATGAAATGC
GAAATAACCTCGTCTGCAGAGCATTTGAAACTAAGCATGTGATACCGAGCCAGGGTTATGTCATTTATTCAGTAAGAAAAAAATTGAAGAAGCAATACATGCATCTTAAG
GGGAAACAGATTGAGAAGCTAAAGAAATCTGGTGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCCCCAGAGGTGGCCTTCACGGGAGATACAACGACAGATTTTATGCTTGATCC
ACGTAATGCCGATGCATTGAGAGCAAAAATTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTAGATGAAGGTGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATGGCCATACTCACATATTTG
AGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTCACTCATTTTTCATCCCGATACCATTTAGAGGACATCCGTAAAGCAGTATCAAAGTTGCAGTCG
AAGGTGACGGCAAAAGTGGTTCCTCTCACTGAAGGTTTCAAGAGATGGAGGGAAATTCCCAGTTTTAGCCTCTGTGGTCTGAAGGTTTTGCTTGCTTACATCATTCTTGT
TGAGTACAGTATCAATATACTGCATATCATAAAAGTGATAGGAGACATCACTGTGACAAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GAGTCCTCTAAACTCCTTGAGAGATTCGGGTCTTTTATCCACTATCGGCGTCGAAGAAGAGTACCGGAGAGCGCGGTCACAGGTTAATCGAAAAGGGGTGGATTTAGAAG
GGTATTCAATCGAGGGAATTTCTGTTGGTGGGCAAGAAACTTGTGTTATTATTCCGGAATTCAAGTGTGCATTTGATATTGGGAGGTGCCCATCTCGAGCCATTCAGCAG
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GGGAAACAGATTGAGAAGCTAAAGAAATCTGGTGTTGAGATTACAGACACCATATTGTCCCCAGAGGTGGCCTTCACGGGAGATACAACGACAGATTTTATGCTTGATCC
ACGTAATGCCGATGCATTGAGAGCAAAAATTCTTATAACTGAGGCAACTTTTCTAGATGAAGGTGTTAGCATAGAACATGCACGGCAACATGGCCATACTCACATATTTG
AGATCATTGAAAATGCACAGTGGATTCGAAATAAGGCTATTCTTCTCACTCATTTTTCATCCCGATACCATTTAGAGGACATCCGTAAAGCAGTATCAAAGTTGCAGTCG
AAGGTGACGGCAAAAGTGGTTCCTCTCACTGAAGGTTTCAAGAGATGGAGGGAAATTCCCAGTTTTAGCCTCTGTGGTCTGAAGGTTTTGCTTGCTTACATCATTCTTGT
TGAGTACAGTATCAATATACTGCATATCATAAAAGTGATAGGAGACATCACTGTGACAAAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KVTAKVVPLTEGFKRWREIPSFSLCGLKVLLAYIILVEYSINILHIIKVIGDITVTK