; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0015669 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0015669
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr12:19449901..19450576
RNA-Seq ExpressionLag0015669
SyntenyLag0015669
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN34145.1 hypothetical protein [Cucumis melo subsp. melo]6.2e-3264.89Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG  P+SSS S P PMS  QY MDLGFT VTRSR+R   I   SP ESSTPPRPSVNL+RPSGGV+Q+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ
         +KRFVPRPEIKS+FQKS+ +  PIIEPE+Q
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ

KAA0043136.1 putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-3163.36Show/hide
Query:  KAKASSSKG-KSPASSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG + P+SS+SAP P+S DQYAMDLGFT VTR  +R+ GI   SP ESSTPPRPS NL+RPS GVVQ+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKG-KSPASSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ
        P+KRFVPRPEIKS+FQK + +  PIIE E+Q
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ

KAA0056175.1 hypothetical protein E6C27_scaffold697G00720 [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-2963.49Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG  P+SSS SA  PM+ DQYAMDL FT VTRSR+R+  IR  SP ESSTPPRP  NL+RPSGGVVQ+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII
        P+KRFVPRP+IKS+FQK + +  PII
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII

KAA0066384.1 hypothetical protein E6C27_scaffold21G004590 [Cucumis melo var. makuwa]7.5e-3060.45Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG   +SSS SAP P   DQYAM++GFT VTRSR+R+  IR  S  ES+TPPRPSVNL+ PS GVVQ+RPP S  S   SS PS ++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQVEA
        P+KRFVPRPEIKS+FQK + +  PIIE E+Q+ A
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQVEA

TYK11076.1 hypothetical protein E5676_scaffold73G00620 [Cucumis melo var. makuwa]7.5e-3063.49Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG  P+SSS SAP PMS DQY MDLGFT V RSR+R+  IR  SP ESSTPPRP  NL+RPSG VVQ+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII
        P+KRFVPRP+IKS+FQK + +  PII
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TM80 Putative Retrotransposon protein1.5e-3163.36Show/hide
Query:  KAKASSSKG-KSPASSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG + P+SS+SAP P+S DQYAMDLGFT VTR  +R+ GI   SP ESSTPPRPS NL+RPS GVVQ+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKG-KSPASSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ
        P+KRFVPRPEIKS+FQK + +  PIIE E+Q
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ

A0A5A7URC1 Uncharacterized protein8.1e-3063.49Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG  P+SSS SA  PM+ DQYAMDL FT VTRSR+R+  IR  SP ESSTPPRP  NL+RPSGGVVQ+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII
        P+KRFVPRP+IKS+FQK + +  PII
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII

A0A5D3BPD3 Uncharacterized protein3.7e-3060.45Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG   +SSS SAP P   DQYAM++GFT VTRSR+R+  IR  S  ES+TPPRPSVNL+ PS GVVQ+RPP S  S   SS PS ++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQVEA
        P+KRFVPRPEIKS+FQK + +  PIIE E+Q+ A
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQVEA

A0A5D3CKX1 Uncharacterized protein3.7e-3063.49Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG  P+SSS SAP PMS DQY MDLGFT V RSR+R+  IR  SP ESSTPPRP  NL+RPSG VVQ+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII
        P+KRFVPRP+IKS+FQK + +  PII
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPII

E5GCE6 Uncharacterized protein3.0e-3264.89Show/hide
Query:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT
        +  ++SSKG  P+SSS S P PMS  QY MDLGFT VTRSR+R   I   SP ESSTPPRPSVNL+RPSGGV+Q+RPP S  S   SS P P++YSQ VT
Subjt:  KAKASSSKGKSPASSS-SAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVT

Query:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ
         +KRFVPRPEIKS+FQKS+ +  PIIEPE+Q
Subjt:  PEKRFVPRPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGGAAATAAGGCAAAAGCCTCCTCTTCAAAGGGCAAAAGCCCAGCTTCCTCTTCTTCAGCACCTCCACCTATGAGTGTTGATCAATATGCTATGGATTTAGGGTT
TACTCCTGTAACCCGATCTAGAGCAAGAACGGACGGCATACGTCCAATGTCTCCAATGGAGTCATCCACTCCACCAAGGCCTTCGGTCAACCTAGTCCGTCCTTCTGGCG
GTGTTGTTCAATTGAGACCTCCAGTCTCACTAGATTCTAGGATAGGGTCATCACCCCCGTCACCTTCTTCCTATTCTCAGGTTGTTACTCCAGAAAAGAGGTTTGTACCT
CGACCTGAGATCAAATCACATTTTCAAAAATCTCTGGATATCACTAAACCCATCATTGAACCAGAATTTCAAGTGGAGGCGTACGTTCTAGGCAATAACCACTGCTTGAC
AAAGTTGAGCCAAGTGTTAGCCTCACACTTCAGGTATGCTGACTGGAATGTTCTTGCCCTCATCCTAGACAACCTCCACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGGAAATAAGGCAAAAGCCTCCTCTTCAAAGGGCAAAAGCCCAGCTTCCTCTTCTTCAGCACCTCCACCTATGAGTGTTGATCAATATGCTATGGATTTAGGGTT
TACTCCTGTAACCCGATCTAGAGCAAGAACGGACGGCATACGTCCAATGTCTCCAATGGAGTCATCCACTCCACCAAGGCCTTCGGTCAACCTAGTCCGTCCTTCTGGCG
GTGTTGTTCAATTGAGACCTCCAGTCTCACTAGATTCTAGGATAGGGTCATCACCCCCGTCACCTTCTTCCTATTCTCAGGTTGTTACTCCAGAAAAGAGGTTTGTACCT
CGACCTGAGATCAAATCACATTTTCAAAAATCTCTGGATATCACTAAACCCATCATTGAACCAGAATTTCAAGTGGAGGCGTACGTTCTAGGCAATAACCACTGCTTGAC
AAAGTTGAGCCAAGTGTTAGCCTCACACTTCAGGTATGCTGACTGGAATGTTCTTGCCCTCATCCTAGACAACCTCCACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGNKAKASSSKGKSPASSSSAPPPMSVDQYAMDLGFTPVTRSRARTDGIRPMSPMESSTPPRPSVNLVRPSGGVVQLRPPVSLDSRIGSSPPSPSSYSQVVTPEKRFVP
RPEIKSHFQKSLDITKPIIEPEFQVEAYVLGNNHCLTKLSQVLASHFRYADWNVLALILDNLH