| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0035480.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.0e-37 | 46.81 | Show/hide |
Query: ADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSS
A +EKP C C H G L GTR CF+C +EGH A + P + + NQ + +G AT +A + VV GTL VLGHY VLF SGSS
Subjt: ADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSS
Query: HSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
HSF+S+ +V +++E++PL L VSTP G L++EKVK C++ ++D ++ V+L+V++M +FDVILGMDWL NHA IDC KEV+F
Subjt: HSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| KAA0036553.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-36 | 44.84 | Show/hide |
Query: AEISPRVSAPHIFFR----FLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGST
AE P V P FR F RF K V A + KP C C +H G YL GTR CF+C +EGH A K P + + NQ + +G
Subjt: AEISPRVSAPHIFFR----FLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGST
Query: HATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDV
AT +A + VV GTL VLGHY VLF SGSSHSF+S+ +V +++E++PL L VSTP G L++EKVK C++ ++ ++ V+L+V++M +FDV
Subjt: HATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDV
Query: ILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
ILGMDWL NHA IDC KEV F
Subjt: ILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| KAA0040651.1 gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-36 | 46.52 | Show/hide |
Query: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQAS-TRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
+E P C C H G LAG+ +CFRC + GH A P+ + F + + +Q+G +ATT ++A + VV GTL +LGHY VLF SGSSH
Subjt: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQAS-TRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
Query: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
SF+S+++V+ +E++PLG L VSTP G L++E++K CRV +++R+L+V+L+V++M++FDVILGMDWL NHA IDC KEV+F
Subjt: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| KAA0047212.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.0e-37 | 44.44 | Show/hide |
Query: FFRFLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVI
F+RF + P K V + KP C C H G L GTR CF+C KEGH A + P + NQ + +G AT +A + VVI
Subjt: FFRFLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVI
Query: GTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDC
GTLLVLGHY VLF+S SSHSF+S+ +V +++E++PL L VSTP G L++EKVK C++ ++ ++ V+L+V++M +F+VILGMDWL NHA IDC
Subjt: GTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDC
Query: HWKEVLF
KEV F
Subjt: HWKEVLF
|
|
| KAA0056645.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.3e-37 | 47.59 | Show/hide |
Query: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYP-KGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
+E P CP C H G L G+ +CFRC + GH A P K + + F+S Q+G +TT ++A + +VV GTL +LGHY VLFYSGSSH
Subjt: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYP-KGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
Query: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
SF+S+++V+ +E++ LG L VSTP G L++EK+K CRV +++ +L+V+L+V++MR+FDVILGMDWL NHA IDC KEV+F
Subjt: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SWR6 Reverse transcriptase | 4.4e-37 | 46.81 | Show/hide |
Query: ADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSS
A +EKP C C H G L GTR CF+C +EGH A + P + + NQ + +G AT +A + VV GTL VLGHY VLF SGSS
Subjt: ADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSS
Query: HSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
HSF+S+ +V +++E++PL L VSTP G L++EKVK C++ ++D ++ V+L+V++M +FDVILGMDWL NHA IDC KEV+F
Subjt: HSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| A0A5A7T0Y9 Reverse transcriptase | 9.7e-37 | 44.84 | Show/hide |
Query: AEISPRVSAPHIFFR----FLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGST
AE P V P FR F RF K V A + KP C C +H G YL GTR CF+C +EGH A K P + + NQ + +G
Subjt: AEISPRVSAPHIFFR----FLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGST
Query: HATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDV
AT +A + VV GTL VLGHY VLF SGSSHSF+S+ +V +++E++PL L VSTP G L++EKVK C++ ++ ++ V+L+V++M +FDV
Subjt: HATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDV
Query: ILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
ILGMDWL NHA IDC KEV F
Subjt: ILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| A0A5A7TG66 Gag protease polyprotein | 9.7e-37 | 46.52 | Show/hide |
Query: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQAS-TRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
+E P C C H G LAG+ +CFRC + GH A P+ + F + + +Q+G +ATT ++A + VV GTL +LGHY VLF SGSSH
Subjt: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQAS-TRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
Query: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
SF+S+++V+ +E++PLG L VSTP G L++E++K CRV +++R+L+V+L+V++M++FDVILGMDWL NHA IDC KEV+F
Subjt: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
| A0A5A7TUS7 Pol protein | 4.4e-37 | 44.44 | Show/hide |
Query: FFRFLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVI
F+RF + P K V + KP C C H G L GTR CF+C KEGH A + P + NQ + +G AT +A + VVI
Subjt: FFRFLRFPTKKNYVQPPINADKEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYPKGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVI
Query: GTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDC
GTLLVLGHY VLF+S SSHSF+S+ +V +++E++PL L VSTP G L++EKVK C++ ++ ++ V+L+V++M +F+VILGMDWL NHA IDC
Subjt: GTLLVLGHYTHVLFYSGSSHSFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDC
Query: HWKEVLF
KEV F
Subjt: HWKEVLF
|
|
| A0A5A7UT01 Reverse transcriptase | 2.6e-37 | 47.59 | Show/hide |
Query: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYP-KGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
+E P CP C H G L G+ +CFRC + GH A P K + + F+S Q+G +TT ++A + +VV GTL +LGHY VLFYSGSSH
Subjt: KEKPFCPKCKWRHEGYYLAGTRLCFRCGKEGHMAAKYP-KGKNSDSGRSFSSNQASTRNQKGSTHATTSKKASDSSVVVIGTLLVLGHYTHVLFYSGSSH
Query: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
SF+S+++V+ +E++ LG L VSTP G L++EK+K CRV +++ +L+V+L+V++MR+FDVILGMDWL NHA IDC KEV+F
Subjt: SFVSNIYVKQSKIELDPLGFNLLVSTPVGVEFLAREKVKTCRVLVSDRLLNVSLIVVEMRNFDVILGMDWLVENHAIIDCHWKEVLF
|
|
