; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0015775 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0015775
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionReverse transcriptase domain-containing protein
Genome locationchr12:23651324..23651749
RNA-Seq ExpressionLag0015775
SyntenyLag0015775
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036691 - Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF5443558.1 hypothetical protein F2P56_036105, partial [Juglans regia]9.2e-2645.39Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWI-EWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        M+  K RL  T CF V   GRSGG++  W  D+   + SFS HHID  I + DG  W+    YG  E    + +WNL R+L    D PWLVGG+FN +L 
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWI-EWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN
          +K G R   EN+++AFR  + DCSL D+GF G  YTW N
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN

OMO59710.1 reverse transcriptase [Corchorus capsularis]2.3e-2439.29Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGK--RWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVL
        +D +++R    +CF VS++GRSGG+   W+  V   LISFS HHID W++ + +  +W++  FYG +++   H SW+L R+ +   +  W   G+FN +L
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGK--RWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVL

Query:  QHAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTW
          A+K G R   E ++ AFR AL DC L D+G+ G+++TW
Subjt:  QHAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTW

XP_015382608.1 uncharacterized protein LOC107175577 [Citrus sinensis]6.0e-2539.01Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEW-DGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        M++  ++L + +CF VS SGR GG+   WN +    + SFS HHID  ++  +G++ +  W YG  E     ++W L R+L+G S +PWL  G+FN +L 
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEW-DGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN
          +KSG      N +++FR AL+DC L+D+ + G  +TWSN
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN

XP_042950313.1 uncharacterized protein LOC122282426 [Carya illinoinensis]3.0e-2441.84Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKR-WQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        MD +K +LG+ +CF V S GRSGG+   WNSD+   L SFS +HID  I+ D    W+    YG  +++   ++WNL R L      PWLVGG+ N VL 
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKR-WQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN
          +K G R    ++++AFR  L +C L D+G+ G  +TW N
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN

XP_042980077.1 uncharacterized protein LOC122310261 [Carya illinoinensis]1.7e-2441.84Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKR-WQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        MD +K++LG+ +CF V S GRSGG+   WNSD+   L SFS +HID  I+ D    W+    YG  ++    ++WNL R L      PWLVGG+ N VL 
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKR-WQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN
          +K G R    ++++AFR  L +C L D+G+ G  +TW N
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1R3GNW3 Reverse transcriptase1.1e-2439.29Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGK--RWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVL
        +D +++R    +CF VS++GRSGG+   W+  V   LISFS HHID W++ + +  +W++  FYG +++   H SW+L R+ +   +  W   G+FN +L
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGK--RWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVL

Query:  QHAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTW
          A+K G R   E ++ AFR AL DC L D+G+ G+++TW
Subjt:  QHAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTW

A0A1R3K499 Reverse transcriptase4.2e-2438.03Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWI-EWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        M+ ++ R+GY  CF V S GRSGG+   WN+++  S++S+SN HID  +   D ++W+   FYG  E+N  H SW L R L   S+ PWL   +FN +L 
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWI-EWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSNR
        + +K G RM  + +++ FR  + +C  ++    G  +TWS R
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSNR

A0A2I4DZH7 uncharacterized protein LOC1089849032.4e-2439.58Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKR---WQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAV
        M+  K +LG+ +C  +SS GR GGI   W++++  S+I++S++H+D  I+    R   W +   YGF E++  H+SWNL + L   +D PWLV G+FN +
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKR---WQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAV

Query:  LQHAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSNR
        L   +KSG     E +L  FR  +  C L D+G+ G  +TWSNR
Subjt:  LQHAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSNR

A0A2N9EWI8 Uncharacterized protein3.2e-2439.01Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWI-EWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        ++ ++ RLG   CF V   G  GG+   W+  V   + S+S HHID W+    G+ W+   FYG   +    YSW L R+L G SD PWLV G+FN ++ 
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWI-EWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN
          +K G+      ++  FR AL DC L D+GF G  +TW+N
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN

A0A2N9GJ35 Uncharacterized protein8.1e-2842.55Show/hide
Query:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDG-WIEWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ
        ++ ++ RLG   C  V   G+ GG+   W+S V+ ++ S+S HHIDG  ++ DG RW++  FYG+ E++  H SW+L R L   SD PW++ G+FN + +
Subjt:  MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDG-WIEWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQ

Query:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN
          +K+G      N++ AFR AL DCSL DMGF+G  +TWSN
Subjt:  HAKKSGERMTVENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATATAGTGAAACAACGCTTGGGATACACGAGTTGTTTTATAGTGAGTAGCTCAGGCCGAAGTGGTGGTATAACTTTTTCGTGGAATTCAGATGTGGTGTTCAGCCT
GATATCTTTCTCTAATCATCATATTGATGGGTGGATAGAGTGGGACGGAAAACGTTGGCAGATCATTTGGTTTTATGGCTTCTCTGAATCTAATGCTCACCACTATTCAT
GGAACCTCTTTCGCAAATTGCTGGGCTCTTCGGACACACCTTGGTTGGTGGGTGGCAATTTTAATGCGGTCCTTCAACATGCGAAGAAATCTGGCGAGCGTATGACTGTG
GAAAACGAGTTGGATGCCTTCCGGTTGGCACTGAAGGATTGCTCGCTATCTGATATGGGTTTTTCGGGGGACATATATACGTGGTCTAATCGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATATAGTGAAACAACGCTTGGGATACACGAGTTGTTTTATAGTGAGTAGCTCAGGCCGAAGTGGTGGTATAACTTTTTCGTGGAATTCAGATGTGGTGTTCAGCCT
GATATCTTTCTCTAATCATCATATTGATGGGTGGATAGAGTGGGACGGAAAACGTTGGCAGATCATTTGGTTTTATGGCTTCTCTGAATCTAATGCTCACCACTATTCAT
GGAACCTCTTTCGCAAATTGCTGGGCTCTTCGGACACACCTTGGTTGGTGGGTGGCAATTTTAATGCGGTCCTTCAACATGCGAAGAAATCTGGCGAGCGTATGACTGTG
GAAAACGAGTTGGATGCCTTCCGGTTGGCACTGAAGGATTGCTCGCTATCTGATATGGGTTTTTCGGGGGACATATATACGTGGTCTAATCGATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIVKQRLGYTSCFIVSSSGRSGGITFSWNSDVVFSLISFSNHHIDGWIEWDGKRWQIIWFYGFSESNAHHYSWNLFRKLLGSSDTPWLVGGNFNAVLQHAKKSGERMTV
ENELDAFRLALKDCSLSDMGFSGDIYTWSNR