| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA3464598.1 reverse transcriptase [Gossypium australe] | 2.6e-20 | 47.71 | Show/hide |
Query: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
S + EL++P S+ E+ AVKS+ P KA G + LFFQKYW I+G ++S+ CL +L +M +NKT I LIPK RPK + +++PI LCNV+YKI
Subjt: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
Query: IVKAITMRL
I KA+ R+
Subjt: IVKAITMRL
|
|
| XP_008237273.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103336015 [Prunus mume] | 2.0e-20 | 49.55 | Show/hide |
Query: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
S L P S+ E+ A+ SI P KA GP+ LF+QKYW IVG EVS LCL VLN + N T ++LIPK P ++ EY+PI LCNV+YKI
Subjt: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
Query: IVKAITMRLKK
I K + RLKK
Subjt: IVKAITMRLKK
|
|
| XP_012477795.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC105793429 [Gossypium raimondii] | 2.4e-21 | 47.62 | Show/hide |
Query: IGDPVH---------SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKM
+GDP H S N L K + E+ AVK + KA G + TLFFQKYW IVGE++ CLEVLN GKD+K LN T I+LIPK P +
Subjt: IGDPVH---------SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKM
Query: EEYKPIRLCNVVYKIIVKAITMRLKK
+++PI LC V+YKII KAI RL++
Subjt: EEYKPIRLCNVVYKIIVKAITMRLKK
|
|
| XP_023891716.1 uncharacterized protein LOC112003738 [Quercus suber] | 5.2e-21 | 49.12 | Show/hide |
Query: PVHSKNDKRE-LSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNV
P D E LS+ L++ EV A+K I+P KA GP+ +F+QKYW IVG V+ + L VLN M +NKT ISLIPK+ PKKM +++PI LCNV
Subjt: PVHSKNDKRE-LSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNV
Query: VYKIIVKAITMRLK
+YK+I K + RLK
Subjt: VYKIIVKAITMRLK
|
|
| XP_042974784.1 uncharacterized protein LOC122306423 [Carya illinoinensis] | 1.2e-20 | 38.56 | Show/hide |
Query: SLLSELSRKFRDSRNWVPTNPNLKHLIARLLYWWCPIGDPVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEV
+L++E + + +WV L + AR+ + +L KP EV A+K ++P KA GPN LFFQKYWG++G ++ L
Subjt: SLLSELSRKFRDSRNWVPTNPNLKHLIARLLYWWCPIGDPVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEV
Query: LNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKIIVKAITMRLKK
LN G K LN TFI+LIPK P K+ +++PI LCNV+YKI+ K I RLK+
Subjt: LNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKIIVKAITMRLKK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A803P912 Uncharacterized protein | 1.3e-22 | 47.32 | Show/hide |
Query: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
S+ L+ P +K EV+ A+++I+PHKA G + LF++K+W I+GEEV+ CL +LNEGK ++ +N T I LIPK +P +M E++PI LCNVVYKI
Subjt: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
Query: IVKAITMRLKKS
+ K + R+K S
Subjt: IVKAITMRLKKS
|
|
| A0A803PRV5 Uncharacterized protein | 8.7e-22 | 50.48 | Show/hide |
Query: LSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKIIVKAITM
L +P +K EV A++ I+P KA G LF++KYW I+GEEVS +CL +LNEG +K +N T I LIPK +P +M E++PI LCNV+YKII K +
Subjt: LSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKIIVKAITM
Query: RLKKS
R+K S
Subjt: RLKKS
|
|
| A0A803PS53 Uncharacterized protein | 1.5e-21 | 39.01 | Show/hide |
Query: LKHLIARLLYWWCPIGDPVHSKND----------KRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNK
L L+A+ +W D +H+ D L++P + EVV A+ S++P K+ G + +F+Q YW IVG+ V+++ L +LNEG DM LNK
Subjt: LKHLIARLLYWWCPIGDPVHSKND----------KRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNK
Query: TFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKIIVKAITMRLKK
+ I+LIPK P + +Y+PI LCNV+YK+I K I +R +K
Subjt: TFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKIIVKAITMRLKK
|
|
| A0A803Q138 Uncharacterized protein | 5.1e-22 | 47.32 | Show/hide |
Query: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
S+ L P +K +V+ A++ I+PHKA G + LF++K+W I+GEEV+ +CL +LNEGK ++ +N T I LIPK +P M E++PI LCNVVYKI
Subjt: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
Query: IVKAITMRLKKS
+VK + R+K S
Subjt: IVKAITMRLKKS
|
|
| A0A803Q852 Uncharacterized protein | 3.9e-22 | 47.32 | Show/hide |
Query: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
S+ L P +K +VV A++ I+PHKA G + LF++K+W I+GEEV+ +CL +LNEGK ++ +N T I LIPK +P +M E++PI LCNVVYKI
Subjt: SKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCNVVYKI
Query: IVKAITMRLKKS
+ K + R+K S
Subjt: IVKAITMRLKKS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O00370 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 2.5e-05 | 26.56 | Show/hide |
Query: PVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQR-PKKMEEYKPIRLCNV
P ++ + L++P++ E+V + S+ K+ GP+ F+Q+Y + + KL + EG + I LIPK R K E ++PI L N+
Subjt: PVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQR-PKKMEEYKPIRLCNV
Query: VYKIIVKAITMRLKKSPRFSHFSDSISF
KI+ K + R+++ + D + F
Subjt: VYKIIVKAITMRLKKSPRFSHFSDSISF
|
|
| P08548 LINE-1 reverse transcriptase homolog | 8.4e-06 | 27.27 | Show/hide |
Query: PVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTF----ISLIPK-SQRPKKMEEYKPIR
P S+ + L++P+S E+ ++++ K+ GP+ + F+Q + EE+ + L + + L TF I+LIPK + P + E Y+PI
Subjt: PVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTF----ISLIPK-SQRPKKMEEYKPIR
Query: LCNVVYKIIVKAITMRLKKSPRFSHFSDSISF
L N+ KI+ K +T R+++ + D + F
Subjt: LCNVVYKIIVKAITMRLKKSPRFSHFSDSISF
|
|
| P11369 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 5.0e-06 | 26.56 | Show/hide |
Query: PVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQR-PKKMEEYKPIRLCNV
P +++ L+ P+S E+ + S+ K+ GP+ F+Q + + + KL ++ EG + I+LIPK Q+ P K+E ++PI L N+
Subjt: PVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQR-PKKMEEYKPIRLCNV
Query: VYKIIVKAITMRLKKSPRFSHFSDSISF
KI+ K + R+++ + D + F
Subjt: VYKIIVKAITMRLKKSPRFSHFSDSISF
|
|
| P14381 Transposon TX1 uncharacterized 149 kDa protein | 2.8e-09 | 28.7 | Show/hide |
Query: GDPVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCN
G PV S+ K L P++ E+ A++ + +K+ G + FFQ +W +G + ++ E +G+ + +SL+PK + ++ ++P+ L +
Subjt: GDPVHSKNDKRELSKPLSKLEVVWAVKSINPHKALGPNRAHTLFFQKYWGIVGEEVSKLCLEVLNEGKDMKPLNKTFISLIPKSQRPKKMEEYKPIRLCN
Query: VVYKIIVKAITMRLK
YKI+ KAI++RLK
Subjt: VVYKIIVKAITMRLK
|
|
