CuGenDBv2

Gene ID	Lag0016471
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Transmembrane protein
Genome location	chr12:38121263..38121742
RNA-Seq Expression	Lag0016471
Synteny	Lag0016471
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7026129.1 hypothetical protein SDJN02_12628 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_008460715.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499480 [Cucumis melo]

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XP_038907133.1 uncharacterized protein LOC120092944 [Benincasa hispida]

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A0A0A0LKI3 Uncharacterized protein

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A0A1S3CD27 uncharacterized protein LOC103499480

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A0A5A7SNV9 Uncharacterized protein

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A0A6J1HKD0 uncharacterized protein LOC111464344

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT2G33250.1 unknown protein

5.2e-07

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AT3G04310.1 unknown protein

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        LD    + ++      VR K+Q      R    WR K  + PLLLR+LIA FPFLGSWT++L
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCATTAGCCCTTCCACTAGGCCAATCAATCATATCTCTGGCATTAGAGAAGTTGTGGGGAACTCCAGAAAGGAGGCCAAGGCGCAGAACCAGAAGTAAGACCAGGAA
GAGACCATTTTACAGCACTGAAAGTAGAGTTCAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGCAGCAGCAGAAGGAAGTGTTGGAGGGAAGGGGAAGATGGGCTATGGATATC
AGTCATGGGAAGTTGGTAGCAATGGTGGTGAAGTTAGAAAAGAGGGAAGAAGTGGAACAAGTTTTGGTGGATGGGAGGATCTTGATGGAGTTGGATCTGAGAGAAAGGCA
AAATCTGGGGTGAGAGGCAAAAAACAGAGCAGTTCATCAATGGAGAGGGGTAAGTTGAGTTGGAGAGAGAAGAAAAGTGATACTCCTTTGCTTTTGAGATTGTTAATTGC
TGTTTTCCCATTTTTGGGTTCATGGACTAGGATGCTTTAG

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

MALALPLGQSIISLALEKLWGTPERRPRRRTRSKTRKRPFYSTESRVQEEEEEEEAAAAEGSVGGKGKMGYGYQSWEVGSNGGEVRKEGRSGTSFGGWEDLDGVGSERKA
KSGVRGKKQSSSSMERGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTRML

Lag0016471 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome