; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0016685 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0016685
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionGlycoprotein membrane precursor GPI-anchored
Genome locationchr12:40276604..40278923
RNA-Seq ExpressionLag0016685
SyntenyLag0016685
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593909.1 Peroxiredoxin-2F, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-9692.35Show/hide
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XP_004140158.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250 [Cucumis sativus]4.7e-8986.73Show/hide
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XP_022930455.1 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like [Cucurbita moschata]1.5e-9591.75Show/hide
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XP_022999885.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like [Cucurbita maxima]1.8e-9390.72Show/hide
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XP_023514801.1 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.7e-9491.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEV3 Uncharacterized protein2.3e-8986.73Show/hide
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A0A1S3BMB9 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like3.9e-8986.22Show/hide
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A0A6J1EWY1 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like7.3e-9691.75Show/hide
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A0A6J1H7X5 uncharacterized GPI-anchored protein At3g06035-like5.2e-8684.69Show/hide
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A0A6J1KGU8 uncharacterized GPI-anchored protein At5g19250-like8.9e-9490.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59833 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192504.3e-5357.51Show/hide
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         TRDG I+PACVPN  P LVLTNFT SQYS  LND+K+TGIGIG++D+W+VVVLTTST EGS+ PASN+        GL    L+FL+  F +
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Q84MC0 Uncharacterized GPI-anchored protein At3g060352.1e-5561.17Show/hide
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        G+IMPACVP    +LVLTNFTKSQYS  LND+K+TGIGIG EDDW+VVVLTT+T EGS+    P    +      IGL   L+  M S
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Q84VZ5 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192402.4e-3247.5Show/hide
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        L L L  +F+S +RPV  + D    L    N YR S+NLT L +N NAECLA+++ D+ +NQPCTNTTGS +V GT+P   ++PNLLAKC LN + TRDG
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         I+  C P       L++F  +  +  LND+K+TG G+G + D  W+V VLTT+T  GS+
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Q8GUL8 Uncharacterized GPI-anchored protein At5g192303.7e-2841.54Show/hide
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        ++K  L  LL + L+   +       +DD L    N YRT LNL  L +N+NAECLA+++ D+ KNQPCTNT  S  V G         NLLAKC+LN +
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          RDG IM  C P    +  L+NF  S     LND+K TGIGIG+ D WVVV+LTT+T EG + +  + N+G     +       FL L F   +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54860.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.3e-3641.05Show/hide
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        +  L+  L++   VSN+     +D+L +G+NSYRT+  +    +N+ A+C+A++IADK ++QPCTN T ++TV+     P+  +Y ++L++C ++ + TR
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Query:  DGTIMPACVPNRVPDLVLTNFTKSQYSGKLNDTKYTGIGIGTEDDWVVVVLTTSTSEGSF---VPASNNTGTLI----SKIGLFFQLLFL
        DG I+P C+PNR+P L LTN+T++ Y+  LND++Y G G+G+E +W+VVVLTTST  GSF   V A   T   +      +GL F  L L
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AT3G06035.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.5e-5661.17Show/hide
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        LPLL  L+ +   NRPV  D D+   L  GINSYRT+ NLT L +N+NAECLA++IAD+FKN+PCTN TGS TV GTEPQFA+YP +LAKC+LN+S+TRD
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Query:  GTIMPACVPNRVPDLVLTNFTKSQYSGKLNDTKYTGIGIGTEDDWVVVVLTTSTSEGSF---VPASNNTGTLISKIGLFFQLLFLMLS
        G+IMPACVP    +LVLTNFTKSQYS  LND+K+TGIGIG EDDW+VVVLTT+T EGS+    P    +      IGL   L+  M S
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AT5G19230.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored2.6e-2941.54Show/hide
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        ++K  L  LL + L+   +       +DD L    N YRT LNL  L +N+NAECLA+++ D+ KNQPCTNT  S  V G         NLLAKC+LN +
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          RDG IM  C P    +  L+NF  S     LND+K TGIGIG+ D WVVV+LTT+T EG + +  + N+G     +       FL L F   +
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AT5G19240.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored1.7e-3347.5Show/hide
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        L L L  +F+S +RPV  + D    L    N YR S+NLT L +N NAECLA+++ D+ +NQPCTNTTGS +V GT+P   ++PNLLAKC LN + TRDG
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         I+  C P       L++F  +  +  LND+K+TG G+G + D  W+V VLTT+T  GS+
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AT5G19250.1 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored3.1e-5457.51Show/hide
Query:  MAKTQLRFLLPLLLACIFVSNRPVKCDDDDLHRGINSYRTSLNLTALVENDNAECLAEKIADKFKNQPCTNTTGSNTVSGTEPQFADYPNLLAKCNLNIS
        ++K  L FLL + L+   +       ++D L  GINSYR SLNLT L+ N NAECLA++IAD+FKNQPCTNTTGS +V GT P F + PNLL+KC LN +
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Query:  NTRDGTIMPACVPNRVPDLVLTNFTKSQYSGKLNDTKYTGIGIGTEDDWVVVVLTTSTSEGSFVPASNNTGTLISKIGLF-FQLLFLMLSFVL
         TRDG I+PACVPN  P LVLTNFT SQYS  LND+K+TGIGIG++D+W+VVVLTTST EGS+ PASN+        GL    L+FL+  F +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCGTTGGGCTTTCAGTCGGTCCCAGTAGCCATTGAAGTAGCTTCTCATCTACTCTTACAAAAAGACCCATCCAACAACTCACTGAGAGCTACAAACTTCCTTCT
TTCTACCTGTTCCCTTGCATTTTGCAGAACCCATTTCGATCCCTTTTCTGTTTCTGCAACAATGGCGAAAACCCAGCTCCGTTTTCTTCTCCCTCTGCTTCTTGCTTGCA
TTTTCGTCTCGAATCGCCCTGTCAAATGTGACGATGATGATCTTCATAGAGGCATCAACAGTTATAGAACGTCCTTGAACTTGACAGCGCTGGTTGAGAACGACAATGCA
GAGTGCCTTGCTGAAAAAATTGCTGACAAATTCAAGAATCAACCTTGTACAAACACCACAGGTTCCAACACGGTATCTGGAACCGAACCTCAGTTCGCCGACTATCCAAA
CCTGCTAGCCAAATGCAATTTGAATATCTCCAACACAAGGGATGGAACCATAATGCCTGCTTGTGTTCCAAACCGAGTTCCTGATCTTGTTCTCACGAACTTCACGAAAT
CTCAGTACTCAGGGAAACTTAACGATACCAAGTACACAGGAATCGGCATTGGTACCGAAGATGACTGGGTTGTCGTTGTTCTTACCACCAGCACATCGGAAGGAAGTTTT
GTGCCAGCATCAAACAACACAGGCACTCTGATTTCTAAGATTGGTTTGTTCTTTCAGTTGCTGTTCTTGATGTTGTCTTTTGTCTTACTGTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTCGTTGGGCTTTCAGTCGGTCCCAGTAGCCATTGAAGTAGCTTCTCATCTACTCTTACAAAAAGACCCATCCAACAACTCACTGAGAGCTACAAACTTCCTTCT
TTCTACCTGTTCCCTTGCATTTTGCAGAACCCATTTCGATCCCTTTTCTGTTTCTGCAACAATGGCGAAAACCCAGCTCCGTTTTCTTCTCCCTCTGCTTCTTGCTTGCA
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GTGCCAGCATCAAACAACACAGGCACTCTGATTTCTAAGATTGGTTTGTTCTTTCAGTTGCTGTTCTTGATGTTGTCTTTTGTCTTACTGTTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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