; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0016920 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0016920
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionReverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase
Genome locationchr12:42368537..42368911
RNA-Seq ExpressionLag0016920
SyntenyLag0016920
Gene Ontology termsGO:0044237 - cellular metabolic process (biological process)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060627.1 Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-2251.38Show/hide
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KAA0066132.1 putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-2352.38Show/hide
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KAA0067279.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold418G001000 [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-2253.33Show/hide
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TYK02246.1 uncharacterized protein E5676_scaffold18G00450 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-2251.38Show/hide
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XP_016900937.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991116 [Cucumis melo]9.3e-2253.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DY80 uncharacterized protein LOC1079911164.5e-2253.33Show/hide
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A0A5A7V1E0 Reverse transcriptase, RNA-dependent DNA polymerase9.0e-2351.38Show/hide
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A0A5A7VCS1 Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase8.2e-2452.38Show/hide
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A0A5A7VPY0 Uncharacterized protein4.5e-2253.33Show/hide
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A0A5D3BVJ1 Uncharacterized protein9.0e-2351.38Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAGCGCCAACTCTACCGGATTTTCAGCCTTGCCCACCGGAACTACCTACTTCAGTAGTCCACCTCTCAATCAACTACTCAATCAGATAACAACTACAAAGTTGGA
TCGAAGCAACTTCCTCCTATGGAAGAATTTAGCCCTTCCTATATTGCGGAGCTACAAATTGGAGGGACATTTATCGGGAAAGAATCCCTGTCCTCCTCAGTTCATTCAGT
CCTCAATCGTGGATTCAACTACACCGACAGAGGGTGGGGTAACCAGCGTTGGAGTGGTTACCAGTGAAGCATCTGGTTCTTCTTCAACACCAGCTGCTACATTCAATCCG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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