CuGenDBv2

Gene ID	Lag0017162
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Peptide methionine sulfoxide reductase MrsB
Genome location	chr5:658228..658608
RNA-Seq Expression	Lag0017162
Synteny	Lag0017162
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR011057 - Mss4-like superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004146165.1 uncharacterized protein At4g08330, chloroplastic [Cucumis sativus]

1.8e-65

93.65

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSCTECG NLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFS IDSTKFR EKEDKLRPFFET+NYWGIQRKRTK+KCN+CG LVGYVYDDGPPLTDSPGQ+H
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

XP_022923554.1 uncharacterized protein LOC111431209 [Cucurbita moschata]

4.5e-64

92.86

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIY C ECGANLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFR EKEDKLRPFFETVNYWGIQR RTKIKCN+C RLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIK LRI+SES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

XP_022965337.1 uncharacterized protein LOC111465232 isoform X2 [Cucurbita maxima]

3.1e-65

94.44

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSC ECGANLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFR EKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCN+C RLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIK LRI+SES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

XP_023551931.1 uncharacterized protein LOC111809759 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.4e-64

92.86

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIY C ECGANLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFR EKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCN+C RLVGYVYDDGPPLT+SPGQYH
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIK LRI+SES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

XP_038903300.1 uncharacterized protein LOC120089928 [Benincasa hispida]

9.0e-65

92.86

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSC ECG NLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFS IDSTKFR EKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTK+KCN+CG LVGY+YDDGPPLTDSPGQYH
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L4W0 Uncharacterized protein

8.8e-66

93.65

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSCTECG NLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFS IDSTKFR EKEDKLRPFFET+NYWGIQRKRTK+KCN+CG LVGYVYDDGPPLTDSPGQ+H
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

A0A1S3BJW2 uncharacterized protein LOC103490667

1.1e-63

89.68

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSC+ECG NLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFS IDSTKFR EKEDKLRPFFET+NYWGIQRKRTK+KC +CG LVGY+YDDGPPLTDSPGQ+H
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSE+
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

A0A2R6Q219 Uncharacterized protein

1.2e-62

87.3

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSCTECG+NLNL++THLFPPDFYFEAGNKGTLSF+ +D+TKF+FEKE+K+RPFFETV+YWGIQRKRTKIKC++CGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQ+H
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFK KALRITSE+
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

A0A6J1E6R2 uncharacterized protein LOC111431209

2.2e-64

92.86

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIY C ECGANLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFR EKEDKLRPFFETVNYWGIQR RTKIKCN+C RLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIK LRI+SES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

A0A6J1HK24 uncharacterized protein LOC111465232 isoform X2

1.5e-65

94.44

Show/hide

Query:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
        MASIYSC ECGANLNLNS+HLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFR EKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCN+C RLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH
Subjt:  MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYH

Query:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        FGPSQVIPRAPRYRFKIK LRI+SES
Subjt:  FGPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9STN5 Uncharacterized protein At4g08330, chloroplastic

2.3e-07

30.08

Show/hide

Query:  YSCTECGANLNLNSTHLFPPDF---YFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHF
        YSC  CG  LNL+ST+         Y ++   G +SF  ID  +F    E +  P F   + WG+ R RTK+ C  C   +G    +  P      Q   
Subjt:  YSCTECGANLNLNSTHLFPPDF---YFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHF

Query:  GPSQVIPRAPRYRFKIKALRITS
          S  I    +Y  +I++L+ +S
Subjt:  GPSQVIPRAPRYRFKIKALRITS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G17705.1 unknown protein

1.8e-55

72.8

Show/hide

Query:  ASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHF
        ++IY+C ECG++LNLN   LFPPDFYFEAGNKGTLSF+ +D+ KFRFEKEDK+ PFFET+NYWGIQRKRTKIKC +C  L+GY+YDDGPPLT   GQY F
Subjt:  ASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHF

Query:  GPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES
        GPSQVIPRAPRYRFK KA++++S++
Subjt:  GPSQVIPRAPRYRFKIKALRITSES

AT4G08330.1 unknown protein

1.7e-08

30.08

Show/hide

Query:  YSCTECGANLNLNSTHLFPPDF---YFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHF
        YSC  CG  LNL+ST+         Y ++   G +SF  ID  +F    E +  P F   + WG+ R RTK+ C  C   +G    +  P      Q   
Subjt:  YSCTECGANLNLNSTHLFPPDF---YFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHF

Query:  GPSQVIPRAPRYRFKIKALRITS
          S  I    +Y  +I++L+ +S
Subjt:  GPSQVIPRAPRYRFKIKALRITS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTCCATCTATTCCTGTACTGAATGCGGAGCAAATCTGAATCTGAATTCCACTCATCTCTTCCCGCCGGATTTCTACTTCGAGGCCGGCAACAAGGGCACCCTTTC
GTTTTCCTTGATCGACTCCACGAAATTCAGGTTCGAGAAGGAGGACAAGCTCCGACCGTTCTTCGAGACCGTCAACTACTGGGGAATCCAGCGGAAACGCACCAAGATCA
AGTGCAATGCATGTGGACGTCTCGTCGGCTACGTTTACGACGATGGGCCTCCTCTTACCGATAGTCCAGGTCAGTACCACTTCGGACCTAGCCAGGTCATTCCCCGAGCT
CCTAGGTACAGATTCAAGATCAAGGCTCTCCGGATTACCTCAGAGAGTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASIYSCTECGANLNLNSTHLFPPDFYFEAGNKGTLSFSLIDSTKFRFEKEDKLRPFFETVNYWGIQRKRTKIKCNACGRLVGYVYDDGPPLTDSPGQYHFGPSQVIPRA
PRYRFKIKALRITSES

Lag0017162 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome