| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7990634.1 hypothetical protein I3843_02G035100 [Carya illinoinensis] | 6.7e-57 | 40.65 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRESKENHIQMANPNPEE-PKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDPNSHLKS
MR+ R ++P DPEIERTL +RR + MA + E P+ ++DY +PV S I+ PINANNFELK LI M + + GSP++DPN HL
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRESKENHIQMANPNPEE-PKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDPNSHLKS
Query: FLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGY
FL+IC TVK+NGV+ED I L LFPFSL+DKAR WLQS+ PGSI +W + + FL KFFPPAKT +LR+EIG F+Q E L+EAWER+K+L+R+CPQHG
Subjt: FLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGY
Query: PDWLQWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFSESSNRSKLEEAVIALN-------NTVNGHSAAIKNIETQLGQLAVSVHHEEETQLV
PDWLQ +G + + + L ++ + A A L+ S+N E +A + SA + + Q+ L + L
Subjt: PDWLQWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFSESSNRSKLEEAVIALN-------NTVNGHSAAIKNIETQLGQLAVSVHHEEETQLV
Query: EEDETTEPEELTGE-VEEGTTSNEAEKLNPEPSISSP
E + E V+ N + NP P+ P
Subjt: EEDETTEPEELTGE-VEEGTTSNEAEKLNPEPSISSP
|
|
| WP_217833153.1 retrotransposon gag domain-containing protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002] | 2.1e-74 | 53.38 | Show/hide |
Query: LVPFDPEIERTLSRIRRESKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVK
L+P DPEI+RT R R +MA E PK IRDYFQP Q GI+ PIN NNFELK GLIQMAR+ A+RG EDP+ HL+SFL+ICGTVK
Subjt: LVPFDPEIERTLSRIRRESKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVK
Query: LNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQ----
+NGVS DAI L LFPFSLQD+A+DWL++IPP SITTW+ L QAFL K+FPPAK+ +LRTEIGTF+Q DEQL+EAWER+K+LLR+CPQHGYPDWLQ
Subjt: LNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQ----
Query: -----------------------------------------WPSERSGPK-KIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFS
WP ER+ P AAG++E+D V++L+AQM+SL NA K +
Subjt: -----------------------------------------WPSERSGPK-KIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFS
|
|
| XP_021279280.1 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC110412945 [Herrania umbratica] | 1.8e-57 | 44.59 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
M++ L LVPFDP+IERT R RRE + N N PE + +RDY P+ Q I INANNFE+K IQM + +
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
Query: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
G P +DPNSHL +FL+IC T K NGV++DAI L LFPFSL+DKA+ WL S+P GSITTW+ L Q FL KFFPPAKT K+R +I +F Q E L+EAWE
Subjt: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
Query: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
RFKELLR+CP HG PDWL QWPSERSG +K A G +EID + L Q+++L+
Subjt: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
|
|
| XP_021279860.1 uncharacterized protein LOC110413413 [Herrania umbratica] | 2.3e-57 | 44.59 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
M++ L LVPFDP+IERT R RRE + N N PE + +RDY P+ Q I INANNFE+K IQM + +
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
Query: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
G P +DPNSHL +FL+IC T K NGV++DAI L LFPFSL+DKA+ WL S+P GSITTW+ L Q FL KFFPPAKT K+R +I +F Q E L+EAWE
Subjt: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
Query: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
RFKELLR+CP HG PDWL QWPSERSG +K A G +EID + L Q+++L+
Subjt: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
|
|
| XP_022843226.1 uncharacterized protein LOC111366761 [Olea europaea var. sylvestris] | 5.5e-59 | 43.32 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERT------LSRIRRES-KENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDP
MR+ R L L+ DPE ERT + R RE+ E ++ AN + ++ + IRDY +PV + SGI I A NFELK GLI M + + G+ +EDP
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERT------LSRIRRES-KENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDP
Query: NSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRK
N+HL SFL+IC TVK+NGV+EDAI L LF FSL+DKA+ W QS+P GSITTWD L Q FL K+FPP+K+ +LR EI F+Q E +EAWERFK+LLR+
Subjt: NSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRK
Query: CPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFSESSNR
CPQHG+ W+ QWPSERSG KK+ AG+ E+D ++AL AQ++SL N + + N+
Subjt: CPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFSESSNR
Query: SKLEEAV
++ +
Subjt: SKLEEAV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A3S3N117 Retrotrans_gag domain-containing protein | 2.6e-54 | 42.4 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRESK-ENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQM-ARDCAYRGSPMEDPNSHLK
MR+ + L LVP DPEIERTL R+++E K ++ ++ + + + DY P+ S I I ANNFE+K +IQM A + G P +DPN+H+
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRESK-ENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQM-ARDCAYRGSPMEDPNSHLK
Query: SFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHG
+FL++C T K NGV++DA+ L L PFSL+DKA+ WL S+P +ITTWD L + FL KFFPP KTVK+R +I TF Q E L+EAWER+KELLRKCP HG
Subjt: SFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHG
Query: YPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
P W+ QWPS+ KKI GV E+D++SAL AQ+++L+
Subjt: YPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
|
|
| A0A6J0ZX64 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC110412945 | 8.6e-58 | 44.59 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
M++ L LVPFDP+IERT R RRE + N N PE + +RDY P+ Q I INANNFE+K IQM + +
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
Query: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
G P +DPNSHL +FL+IC T K NGV++DAI L LFPFSL+DKA+ WL S+P GSITTW+ L Q FL KFFPPAKT K+R +I +F Q E L+EAWE
Subjt: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
Query: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
RFKELLR+CP HG PDWL QWPSERSG +K A G +EID + L Q+++L+
Subjt: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
|
|
| A0A6J0ZYV0 uncharacterized protein LOC110413413 | 1.1e-57 | 44.59 | Show/hide |
Query: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
M++ L LVPFDP+IERT R RRE + N N PE + +RDY P+ Q I INANNFE+K IQM + +
Subjt: MRKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRE--------------SKENHIQMANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCA-Y
Query: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
G P +DPNSHL +FL+IC T K NGV++DAI L LFPFSL+DKA+ WL S+P GSITTW+ L Q FL KFFPPAKT K+R +I +F Q E L+EAWE
Subjt: RGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWE
Query: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
RFKELLR+CP HG PDWL QWPSERSG +K A G +EID + L Q+++L+
Subjt: RFKELLRKCPQHGYPDWL---------------------------------------------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLA
|
|
| A0A6P6X8N4 uncharacterized protein LOC113740788 | 1.6e-51 | 50.91 | Show/hide |
Query: RKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRESKENHIQ------------------MANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDC
R RE+ L FDPEIERTL R RR + Q MA P + +RD+ P + Q+ I +NANNFE+K LIQM +
Subjt: RKVRELTLVPFDPEIERTLSRIRRESKENHIQ------------------MANPNPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDC
Query: AYRGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEA
Y G+ EDPNSHL +FL+IC T+K NGVSEDAI L LFPFSL+DK WLQS P + TTW L +AFL KFFPP KT KLR +I +F QQ E L+E
Subjt: AYRGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSIPPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEA
Query: WERFKELLRKCPQHGYPDWL
WER++EL RKCP HG PDWL
Subjt: WERFKELLRKCPQHGYPDWL
|
|
| A0A6P6XAQ1 Reverse transcriptase | 3.5e-51 | 42.28 | Show/hide |
Query: NPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSI
N + +RD+ P Q Q+ IV +NANNFE+K LIQM + Y G+ EDPNSHL +FL+IC T+K NGVSEDAI L LFPFSL+DKA+ WLQS
Subjt: NPEEPKPIRDYFQPVFQEQQSGIVYAPINANNFELKMGLIQMARDCAYRGSPMEDPNSHLKSFLDICGTVKLNGVSEDAICLHLFPFSLQDKARDWLQSI
Query: PPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWL----------------------------------
PP + TTWD L +AFL KFFPP KT KLR +I +F QQ E L+EAWER++EL R+CP HG PDWL
Subjt: PPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQFDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWL----------------------------------
Query: -----------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFSESSNRSKLEEAVIALNNTVNG
QW +ER G + AG+ E+D ++ L A+M ++ +K S + V+ + T+ G
Subjt: -----------QWPSERSGPKKIAAGVFEIDNVSALQAQMSSLANAFLKFSESSNRSKLEEAVIALNNTVNG
|
|
