; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0018478 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0018478
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr5:28051858..28055459
RNA-Seq ExpressionLag0018478
SyntenyLag0018478
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG9334510.1 hypothetical protein JZ751_007593 [Albula glossodonta]1.3e-1829.59Show/hide
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        P   S  T  +++T  CS   L HH +LQH  C   LL    PL  +  +   AP      TP  ++   CS   L   H  QH    + L   + P  +
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         P LS       P    T   +STS+   +  L HH + QH  C   LL    PL  +  L    P    T   +ST++   +  L H+P LQH    + 
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        L   +PP  +A      P    TT  +STS+   +  L H P+LQH    + H   +          +PP  + P LS       P    T P +STS+ 
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Query:  TCSFDLCHHPAFQH-ECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSLYLCHYPILQHEYRDMFLKLVSPPHLSARVQGHAPWTCVTTLPF
          +  L HHP+ QH  C   LL    PL  +  L    P    T P +STS+   +  L H+P LQH    + L   +PP  +A      P    TT  +
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Query:  STSAGTCSLDLCHRPALQH
        STS+   +  L H  ++QH
Subjt:  STSAGTCSLDLCHRPALQH

ROT63252.1 hypothetical protein C7M84_018873 [Penaeus vannamei]3.8e-0721.94Show/hide
Query:  STTTGTCSLDLCHRPAFQ----HDTSTGTCSLDLCHHSALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPFSTSAG--------------TCSFDL
        ST+   C++++ H P+        TS   C++++CH    QH         +  L PS      AP T  +  P ++  G               C+ ++
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Query:  CSRHVFQHEYRDMFLKLVSRPRLSLPRLSQRMQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSFDLCHHPAFQHECN-----DMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTA
        C R   QH      L  +          +  +  H+          STSA      L  H    H C       +   +   +++  RL  H+   C+  
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Query:  PPFSTSAGT---------CSLYLCHYPILQHEYRDMFLKLVSPPHLSARVQGHAPWTCVTTLPFSTSAGTCSLDLCHRPALQHECRDIRHAFQHEYRDMF
           S SA T         C++ +CH    QH +R   + +    H       H P          +SA  C++++C    +      I H   H++    
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            S    ++    +    H+P     AP  STSA  C+ ++CH    QH       +   +   HL +  Q H           + + AP    S   
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Query:  --AGTCSFTSTGTCSLDLCHHS-------ALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPFSTSAGTCSFDLCSRHVFQHEYRDMFLKLVSRPRL
          + + +      C++++CH +       ++ H C   +  L     PS   Q H P      T  STSA      L  +H     +R     L S P  
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        S     Q +    P T  +  P                STS   C+ ++CH    QH         +G    +  S     H P   V AP  STSA   
Subjt:  SLPRLSQRMQGHVPWTCVTAPPF---------------STSAGTCSFDLCHHPAFQH---ECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTC

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          TS   C++++CH  H  + H     L      L PS    G     C+AA     S +  T +     +H+    ++ +     S   +  P     +
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            P         STSA  C+      P+            V+  HL +    H+P     AP  STSA  C     H        I+ H    +    
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Query:  VSPPHLSARVQGHAPWT----CVTTLPFSTSA---GTCSLDLCHRPALQH----------------ECRDIRHAFQHEYRDMFLKLVSPPRLSLP---RL
         S   +   +  HAP T    C     F+TSA     C++++CHR   QH                 C  + H          L  V+P   ++     +
Subjt:  VSPPHLSARVQGHAPWT----CVTTLPFSTSA---GTCSLDLCHRPALQH----------------ECRDIRHAFQHEYRDMFLKLVSPPRLSLP---RL

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          R+   H+P  C T    STSA  C+ ++CH H    H            LH+++      P T   A P STSA  C++ +CH             H 
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Query:  YRDMFLKLVSPPHLSARVQGHAPWTCVTTLPFSTSAGTCSLDLCHRPALQHECTSAGTCSFDLCRRHAFQH
                +   HL    Q       + ++  STSA  C++++CHR   QH  + A + S   C  H  +H
Subjt:  YRDMFLKLVSPPHLSARVQGHAPWTCVTTLPFSTSAGTCSLDLCHRPALQHECTSAGTCSFDLCRRHAFQH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A423SGD6 Uncharacterized protein1.9e-0721.94Show/hide
Query:  STTTGTCSLDLCHRPAFQ----HDTSTGTCSLDLCHHSALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPFSTSAG--------------TCSFDL
        ST+   C++++ H P+        TS   C++++CH    QH         +  L PS      AP T  +  P ++  G               C+ ++
Subjt:  STTTGTCSLDLCHRPAFQ----HDTSTGTCSLDLCHHSALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPFSTSAG--------------TCSFDL

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        C R   QH      L  +          +  +  H+          STSA      L  H    H C       +   +   +++  RL  H+   C+  
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           S SA T         C++ +CH    QH +R   + +    H       H P          +SA  C++++C    +      I H   H++    
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            S    ++    +    H+P     AP  STSA  C+ ++CH    QH       +   +   HL +  Q H           + + AP    S   
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Query:  --AGTCSFTSTGTCSLDLCHHS-------ALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPFSTSAGTCSFDLCSRHVFQHEYRDMFLKLVSRPRL
          + + +      C++++CH +       ++ H C   +  L     PS   Q H P      T  STSA      L  +H     +R     L S P  
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Query:  SLPRLSQRMQGHVPWTCVTAPPF---------------STSAGTCSFDLCHHPAFQH---ECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTC
        S     Q +    P T  +  P                STS   C+ ++CH    QH         +G    +  S     H P   V AP  STSA   
Subjt:  SLPRLSQRMQGHVPWTCVTAPPF---------------STSAGTCSFDLCHHPAFQH---ECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTC

Query:  SFTSTGTCSLDLCH--HSALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPF--STSAGTCSFDLCSRHVFQHEYRDMFLKLVSRPRLSLPRLSQRM
          TS   C++++CH  H  + H     L      L PS    G     C+AA     S +  T +     +H+    ++ +     S   +  P     +
Subjt:  SFTSTGTCSLDLCH--HSALQHECRDMLLGLVSPLCPSARVQGHAPLTCVAATPF--STSAGTCSFDLCSRHVFQHEYRDMFLKLVSRPRLSLPRLSQRM

Query:  QGHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSFDLCHHPAFQHECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSLYLCHY------PILQHEYRDMFLKL
            P         STSA  C+      P+            V+  HL +    H+P     AP  STSA  C     H        I+ H    +    
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Query:  VSPPHLSARVQGHAPWT----CVTTLPFSTSA---GTCSLDLCHRPALQH----------------ECRDIRHAFQHEYRDMFLKLVSPPRLSLP---RL
         S   +   +  HAP T    C     F+TSA     C++++CHR   QH                 C  + H          L  V+P   ++     +
Subjt:  VSPPHLSARVQGHAPWT----CVTTLPFSTSA---GTCSLDLCHRPALQH----------------ECRDIRHAFQHEYRDMFLKLVSPPRLSLP---RL

Query:  SQRMQ-GHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSFDLCH-HPAFQHECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSLYLCHYPIL--------QHE
          R+   H+P  C T    STSA  C+ ++CH H    H            LH+++      P T   A P STSA  C++ +CH             H 
Subjt:  SQRMQ-GHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSFDLCH-HPAFQHECKDMLLGLVSPLHLSARLQGHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSLYLCHYPIL--------QHE

Query:  YRDMFLKLVSPPHLSARVQGHAPWTCVTTLPFSTSAGTCSLDLCHRPALQHECTSAGTCSFDLCRRHAFQH
                +   HL    Q       + ++  STSA  C++++CHR   QH  + A + S   C  H  +H
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTACAGAGACATGTTCCCTGGACTTGTGTCAC
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CAGCACGACACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCTGCCCTTC
AGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTTGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTTGACTTGTGTAGCCGTCACGTCTTTCAGCACG
AGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCGGCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCT
TTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACTTGTGTCACCACCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAATGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGC
ACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTGTACTTGTGTCACTACCCCATCCTTCAGCACGAGT
ACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCTCACCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGG
ACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCC
GCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACT
TGTGTCACCACCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAAGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGCACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTC
ACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACAT
GCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTTGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCT
TTGACTTGTGTAGCCGTCACGTCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCGGCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGG
CATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACTTGTGTCACCACCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAAGGACATGCT
CCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGCACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTCA
CGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCTGCCCTTCAGCACGAGTG
CAGGGACATGCTCCTTTGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTTGACTTGTGTAGCCGTCACGTCTTTCAGCACGAGTACAGGGA
CATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCGGCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGA
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GGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTGTACTTGTGTCACTACCCCATCCTTCAGCACGAGTACAGGGACAT
GTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCTCACCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCT
TGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCACGTCTT
TCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACTTGTGTCACCA
CCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAAGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGCACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGC
CTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTGTACTTGTGTCACTACCCCATCCTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCTCACCTTTCA
GCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCCTTCAGCACGA
GTGTACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTTGACTTGTGTCGCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCACGTCTTTCAGCAC
GAGTACAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TGACCCGCCTTTCACAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAATCGCCCCGCCTTACAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACTTGTGTCACCACCCC
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CAGCACGACACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCTGCCCTTC
AGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTTGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTTGACTTGTGTAGCCGTCACGTCTTTCAGCACG
AGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCGGCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCT
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ACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTGTACTTGTGTCACTACCCCATCCTTCAGCACGAGT
ACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCTCACCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGG
ACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCC
GCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACT
TGTGTCACCACCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAAGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGCACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTC
ACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACAT
GCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTTGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCT
TTGACTTGTGTAGCCGTCACGTCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCGGCCACGTCTTTCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGG
CATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACTTGTGTCACCACCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAAGGACATGCT
CCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGCACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTCA
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CAGGGACATGCTCCTTTGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTTGACTTGTGTAGCCGTCACGTCTTTCAGCACGAGTACAGGGA
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GGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTGTACTTGTGTCACTACCCCATCCTTCAGCACGAGTACAGGGACAT
GTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCTCACCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCT
TGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCACGTCTT
TCACTGCCCCGCCTTTCGCAACGAATGCAGGGGCATGTTCCTTGGACTTGTGTAACCGCCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTCGACTTGTGTCACCA
CCCCGCCTTTCAGCACGAGTGCAAGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCTCCACCTTTCAGCACGACTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGC
CTTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTGTACTTGTGTCACTACCCCATCCTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCTCACCTTTCA
GCACGAGTACAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCACTCTGCCCTTCAGCACGAGTGCAGGGACATGCTCCTTGGACTTGTGTCACCGCCCCGCCCTTCAGCACGA
GTGTACGAGTGCAGGGACATGTTCCTTTGACTTGTGTCGCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTACAGGGACATGTTCCTTAAACTTGTGTCGCCGCCACGTCTTTCAGCAC
GAGTACAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFRPAFQHEYRDMFLGLVSPPRLSARVQRHVPWTCVTDPPFTTNAGACSLDLCNRPALQHECRDMLLRLVSPPRLSARVQGHAPWTCVTAPPFSTTTGTCSLDLCHRPAF
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GHVPWTCVTAPPFSTSAGTCSLYLCHYPILQHEYRDMFLKLVSPPHLSARVQGHAPWTCVTTLPFSTSAGTCSLDLCHRPALQHECRDIRHAFQHEYRDMFLKLVSPPRL
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