; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0018629 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0018629
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionPentraxin 4, long
Genome locationchr5:31207097..31207681
RNA-Seq ExpressionLag0018629
SyntenyLag0018629
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
WP_053484569.1 hypothetical protein [Lysinibacillus sp. FJAT-14745]3.8e-0632Show/hide
Query:  FLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTP
        FLGLP  F     R PG    L ER   FLGL + FP    R+ G      +    FLGLP+ FP       G+     +    FL LP+ FP    R  
Subjt:  FLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTP

Query:  RMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGLSKFLQA
         +     +  E FLGLP+ FP    + P  + +L+ +L+     + F+ A
Subjt:  RMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGLSKFLQA

WP_171268814.1 glycosyltransferase [Aeromonas media]2.9e-0621.97Show/hide
Query:  LEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFP
        L+ER G   GL     +      G    + +R G   GL +   ++     G+N  + ER G   GL +   ++     G N  + ER G   GL +   
Subjt:  LEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFP

Query:  QKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSL
        ++     G+N  + ER G  + L +   ++      +N  + ER     GL     ++ ++   +   ++K L
Subjt:  QKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSL

XP_014053877.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X1 [Salmo salar]2.1e-0422.65Show/hide
Query:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL
        T++ +++G  LGL  +         G  T +  ++G  LGL  +   K     G+  ++ +++G  LGLL +   K     G  T + +++G  LGL  +
Subjt:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL

Query:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL
                 G+ T + +++G  L L  +   K      + T++ +++   LGL  +   K         M+   + G LGL
Subjt:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL

XP_014053879.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106604057 isoform X3 [Salmo salar]2.7e-0422.65Show/hide
Query:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL
        T++ +++G  LGL  +         G  T +  ++G  LGL  +   K     G+  ++ +++G  LGLL +   K     G  T + +++G  LGL  +
Subjt:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL

Query:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL
           K     G+ T + +++G  L L  +          + T++ +++   LGL  +   K         M+   + G LGL
Subjt:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL

XP_032924805.1 proline-rich protein 36-like [Catharus ustulatus]1.4e-0827.33Show/hide
Query:  LFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCTPGMNTTL
        + P+NS+ TP T T L +          + P+ S+ TP    VL E          + P  S+ TP T T L E          + P  S+ TP   T L
Subjt:  LFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCTPGMNTTL

Query:  EERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAP
         E          + P+ S+ TP   TVL E          + P+ S+  P
Subjt:  EERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0M0WVL3 Uncharacterized protein1.9e-0632Show/hide
Query:  FLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTP
        FLGLP  F     R PG    L ER   FLGL + FP    R+ G      +    FLGLP+ FP       G+     +    FL LP+ FP    R  
Subjt:  FLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTP

Query:  RMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGLSKFLQA
         +     +  E FLGLP+ FP    + P  + +L+ +L+     + F+ A
Subjt:  RMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGLSKFLQA

A0A1S3RPX7 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X11.0e-0422.65Show/hide
Query:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL
        T++ +++G  LGL  +         G  T +  ++G  LGL  +   K     G+  ++ +++G  LGLL +   K     G  T + +++G  LGL  +
Subjt:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL

Query:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL
                 G+ T + +++G  L L  +   K      + T++ +++   LGL  +   K         M+   + G LGL
Subjt:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL

A0A1S3RPY0 uncharacterized protein LOC106604057 isoform X61.3e-0422.65Show/hide
Query:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL
        T++ +++G  LGL  +         G  T +  ++G  LGL  +   K     G+  ++ +++G  LGLL +   K     G  T + +++G  LGL  +
Subjt:  TVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKL

Query:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL
           K     G+ T + +++G  L L  +          + T++ +++   LGL  +   K         M+   + G LGL
Subjt:  FPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGL

A0A674AJW3 Pentraxin 4, long6.0e-0527.92Show/hide
Query:  LPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCT---P
        +P L PQ  V T      + +R+     +P L PQ+ V+T  +  ++ +R+     +  L PQ+ V+T      + +R+     +P L PQ+ V T   P
Subjt:  LPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCT---P

Query:  GMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVR
        G    L  R+    V+P L PQ+ V+T  +  ++ +R+     +P L PQ+ V+
Subjt:  GMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVR

A0A7D9EWT5 Uncharacterized protein6.0e-0527.95Show/hide
Query:  MNTVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLP
        M T L E   N   +P   P+     P   T L +   N L +P   P+     P M   L E   N   +    P+     P   T L E   N   +P
Subjt:  MNTVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLP

Query:  KLFPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQ
           P+     P M T L E   N LV+P   P+     P M T L E   N   +P   P+
Subjt:  KLFPQKSVCTPGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACACAGTGCTTGAAGAGAGACTCGGAAACTTCTTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAACAGTGTATACACCCCTGGGACGAATACGACGCTTGAAAAGAGGCT
CGGGAACTTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGAACATAGTGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAACTTCCTAGGCCTCCTCAAGC
TTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGACGAACACGACGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAACTTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTATGCACC
CCTGGGATGAACACGACGCTTGAAGAGAGGCTCGGAAACTTCCTAGTCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTAGGATGAACACAGTGCTTGAAGA
GAGGCTCGAGAACTTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCGCCCCTAGGAGGACGGCGATGCTTGAAAAAAGTCTTTGGGGCTTCCTGGGCCTCT
CCAAATTTCTCCAGGCGGTGCAGCAAGGATGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACACAGTGCTTGAAGAGAGACTCGGAAACTTCTTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAACAGTGTATACACCCCTGGGACGAATACGACGCTTGAAAAGAGGCT
CGGGAACTTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGATGAACATAGTGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAACTTCCTAGGCCTCCTCAAGC
TTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTGGGACGAACACGACGCTTGAAGAGAGGCTCGGGAACTTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTATGCACC
CCTGGGATGAACACGACGCTTGAAGAGAGGCTCGGAAACTTCCTAGTCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCACCCCTAGGATGAACACAGTGCTTGAAGA
GAGGCTCGAGAACTTCCTAGGCCTCCCCAAGCTTTTTCCCCAGAAGAGTGTACGCGCCCCTAGGAGGACGGCGATGCTTGAAAAAAGTCTTTGGGGCTTCCTGGGCCTCT
CCAAATTTCTCCAGGCGGTGCAGCAAGGATGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTVLEERLGNFLGLPKLFPQNSVYTPGTNTTLEKRLGNFLGLPKLFPQKSVRTPGMNIVLEERLGNFLGLLKLFPQKSVRTPGTNTTLEERLGNFLGLPKLFPQKSVCT
PGMNTTLEERLGNFLVLPKLFPQKSVRTPRMNTVLEERLENFLGLPKLFPQKSVRAPRRTAMLEKSLWGFLGLSKFLQAVQQGC