; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0018828 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0018828
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr5:35077961..35080905
RNA-Seq ExpressionLag0018828
SyntenyLag0018828
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAE1311162.1 unnamed protein product [Sepia pharaonis]2.1e-0430.77Show/hide
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        SS SS   HF  F F F    +S++ +SSSSF  HF    F F +S        S+SS S      S F   F  F ++     +S++ SS+SSF  HF 
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           F F     SI+ +SSS      S F F     S    S P S           +S F   +F       I S  + +  SSS+ SSS     F  + 
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         +F   S+PSS +  S F F FSS                        ++ F+ F F F  S   ++      F   +F F   S   F F     SI+ 
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        SSSS      S F+F  L       S P S    F   SF +    F  F +       S+I SSSSSS+  +SS     L H     F F     +++ 
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Query:  SSSSSSFARSSSS--FHHFKYFKFKFKVS
        SSSSSS + SSSS    HF  F F F  S
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ORY24421.1 hypothetical protein LY90DRAFT_630457, partial [Neocallimastix californiae]2.3e-0627.94Show/hide
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        S++S S +S  + +    S SS     S+F F + S  + S  +F +F        +F  S +  SS SF +  +S F    S+ S S LSF  F +S F
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        S  F C  +S   F  S +S SN SF  F +    F   S   ++ SF  F +S   F  L  S  S SSF  S +S F + SF +         +F  S
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        I + + +SSS  S      SS    SF +   + L+ S  S              S+++ S F F    FSS  +       F+  +F F   S  +L  
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Query:  QIWGFACI---MFKFELSSLRVFKFKFKLCSILS-SSSSFHQFKYSKFMFGALLVSSYS-SSFPRSEYPNFKRHSFQVQVRVFRHFKYPEF---------
         I+ F+ +    F F   S     F    CSILS S+ SF  F +S F       S++S S+F  S   NF   +    +  F  F +            
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Query:  -------KFGVSLIS-SSSSSSNF-----LASSIPRTSLHHIKYSKFKFGALLISS-SSSSFARSSSSFHHFKYFKFKFKVSLGFDFKLMTTPVGNYSYQ
               +F   ++S S+ SSSNF       +S  R S  ++ +S F F  L  SS S S+F+ S+ SF  F +    F +     F      + ++S+ 
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Query:  S
        +
Subjt:  S

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1Y2APF0 Uncharacterized protein (Fragment)1.1e-0627.94Show/hide
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        S++S S +S  + +    S SS     S+F F + S  + S  +F +F        +F  S +  SS SF +  +S F    S+ S S LSF  F +S F
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Query:  SSRFPCFKYSKFMFEASLVSSSNSSFPHFEYLKFKFKLCSILSTSSSFHQFKYSKFKFGVLLVSSYS-SSFPRSEYSKFEHHSFQVQ------VRVFIIS
        S  F C  +S   F  S +S SN SF  F +    F   S   ++ SF  F +S   F  L  S  S SSF  S +S F + SF +         +F  S
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Query:  IQARAFISSSTLS------SSLGLCSFQVTVQAFLAPSTPS--------------SSVTRSKFKF---EFSSLQVLQVQIWGFARFKFKFELSSLQVLLV
        I + + +SSS  S      SS    SF +   + L+ S  S              S+++ S F F    FSS  +       F+  +F F   S  +L  
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         I+ F+ +    F F   S     F    CSILS S+ SF  F +S F       S++S S+F  S   NF   +    +  F  F +            
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               +F   ++S S+ SSSNF       +S  R S  ++ +S F F  L  SS S S+F+ S+ SF  F +    F +     F      + ++S+ 
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Query:  S
        +
Subjt:  S

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAAGAAAAAGAAGGAAGATGATGAAGTGGAGAAGAAGAGGAAAATCTCTACTGCTCCAAAGTCTTCTCCACCATCGCAAAATAAATTGGAAAACCTTTCATGCTT
GGCTATCGTTGTCTCCAGTTTGGTCTCTGGTTCCTTTATCTCCAAGGATGATCGTGCAAGCTGCTGTTTGAGTGTGTCCTCTAGGGTTCTACTTGTCTCAAAGTTCAAGT
TCAAGCTTTCATCAAGTTACAGTTCAAGCTTTCATCACTTCAAATACTTCAAATTCAAATTTGGGGCTTCGCTCGTTCCAACTTCAAGTTCAAGCTTTCCTCACTTCAAG
TACTCCCAGTTTAAGTTCGGGGCCTCGCTCATTTCAACTTCAAGTTTGAGCTTTCCTCACTTCAAGTACTCCAAGTTCAGTTCGAGATTTCCTTGCTTCAAGTACTCCAA
GTTCATGTTCGAGGCTTCACTCGTATCAAGTTCAAATTCGAGCTTTCCTCACTTCGAGTACCTCAAGTTCAAGTTCAAGCTTTGCTCAATTCTAAGTACAAGCTCGAGCT
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GTTCAAGTTCGAGTTTTCATCATTTCAATTCAAGCTCGAGCTTTCATCAGTTCAAGTACTCTAAGTTCAAGTTTGGGACTTTGCTCGTTTCAAGTTACAGTTCAAGCATT
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AAGCTTTGCTCAATTCTAAGTTCAAGCTCGAGCTTTCATCAGTTCAAGTACTCTAAGTTCATGTTTGGGGCTTTGCTCGTTTCAAGTTACAGTTCGAGCTTTCCTCGCTC
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TCACTGCAAATGAAGTTGATGACGACCGTTGTAGACAAGTCTGGTGACCACCCCTGTAGGAAACTACAGTCATCAAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GGCTATCGTTGTCTCCAGTTTGGTCTCTGGTTCCTTTATCTCCAAGGATGATCGTGCAAGCTGCTGTTTGAGTGTGTCCTCTAGGGTTCTACTTGTCTCAAAGTTCAAGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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