; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0018856 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0018856
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationchr5:35463533..35466329
RNA-Seq ExpressionLag0018856
SyntenyLag0018856
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A067L5E9 Uncharacterized protein7.1e-10295Show/hide
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A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein7.5e-10497.51Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X17.5e-10497.01Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like1.4e-10295.52Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like1.4e-10295.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM15.2e-8679.23Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC14.7e-8778.71Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM21.6e-8779.7Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c6.2e-8779.1Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 53.1e-8677.23Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E2.0e-6458.94Show/hide
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +A ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T ++   ++I  Q           
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        EKS+CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein7.7e-9383.17Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C4.4e-8879.1Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A2.4e-8678.11Show/hide
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        S
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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