; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0019137 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0019137
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotein indeterminate-domain 1-like
Genome locationchr5:39012288..39012755
RNA-Seq ExpressionLag0019137
SyntenyLag0019137
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044762.1 protein indeterminate-domain 1-like [Cucumis melo var. makuwa]4.8e-5281.58Show/hide
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XP_008453721.1 PREDICTED: protein indeterminate-domain 1-like [Cucumis melo]4.8e-5281.58Show/hide
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XP_022136443.1 protein indeterminate-domain 1-like [Momordica charantia]2.4e-5180Show/hide
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XP_038877290.1 zinc finger protein ENHYDROUS-like [Benincasa hispida]5.3e-5182.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWK7 C2H2-type domain-containing protein1.3e-5080.26Show/hide
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A0A1S3BXQ7 protein indeterminate-domain 1-like2.3e-5281.58Show/hide
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A0A5A7TN61 Protein indeterminate-domain 1-like2.3e-5281.58Show/hide
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A0A5D3CXM3 Protein indeterminate-domain 1-like2.3e-5281.58Show/hide
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A0A6J1C7K5 protein indeterminate-domain 1-like1.2e-5180Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LVQ7 Zinc finger protein ENHYDROUS5.8e-0840.13Show/hide
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Q9SCQ6 Zinc finger protein GAI-ASSOCIATED FACTOR 11.4e-0639.6Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G50700.1 indeterminate(ID)-domain 21.0e-0739.6Show/hide
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AT5G66730.1 C2H2-like zinc finger protein4.1e-0940.13Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTGCCGGAAAATCCTCCGCCGCCGCCAGGAGAGGCACCGAGCAAAACTGTCCAAACTGGCAGCTCCGGCAGCAGCAGCACCACCATCGGCAGCAGCAATGCTAC
CGTATTGGCTAGCTTGTTTGCTTCCTCCGCCGCATCACTGAGCTTACAGACGCCGCAGCCGCCGGCTTTTTGCGACTTATTACGAGCGATGGCGCGGCCTAATCGGCAGG
CCGAAATTGCACCGCCGCTGATGTTTGAACCTCTTTCTCTATGTCTATCGACCCACACCGGATCGTCGCTTTTCGGAGCCGGAATCCAAGAGCACCGCCAATATGCTCCG
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TTCTTCTGCTCAACAGGGGAGTTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTTGCCGGAAAATCCTCCGCCGCCGCCAGGAGAGGCACCGAGCAAAACTGTCCAAACTGGCAGCTCCGGCAGCAGCAGCACCACCATCGGCAGCAGCAATGCTAC
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TTCTTCTGCTCAACAGGGGAGTTTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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