CuGenDBv2

Gene ID	Lag0019204
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	GDP-mannose 4,6 dehydratase 1-like
Genome location	chr5:39801029..39805880
RNA-Seq Expression	Lag0019204
Synteny	Lag0019204
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6600576.1 hypothetical protein SDJN03_05809, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7031216.1 hypothetical protein SDJN02_05256 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.4e-85

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XP_022942738.1 uncharacterized protein LOC111447685 [Cucurbita moschata]

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XP_022982715.1 uncharacterized protein LOC111481498 [Cucurbita maxima]

1.4e-85

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XP_023548268.1 uncharacterized protein LOC111806950 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A1S3BSD9 uncharacterized protein LOC103493183

1.3e-84

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A0A5A7TU92 Uncharacterized protein

3.2e-83

87.37

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A0A5D3CYS3 Uncharacterized protein

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A0A6J1FVK8 uncharacterized protein LOC111447685

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A0A6J1J3L4 uncharacterized protein LOC111481498

6.9e-86

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G66290.1 unknown protein

5.9e-61

65.79

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        EDIENKIEV DALA KLLQR N S SA++T +QHLS+VH L+VE+GELKGRLTEVISNCD LC+RI SEGPESLRS++ PF + + DS S
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGGGCTTCAGAATCCGCACTTTCGAGCTCTATCTCTGCGAGGCCAGCTGATGCAATCTCCACCGTATCGGAGCGATCGGAAGCTGTTGATCCCATCTTAGAGAGGCT
CAAGTCGCTTAAAACCACAACGCCGATACTGCAGACACCCCCTACGGAAGGTAGCTTGACAGATATCTTAGTAAGGAAACTGCCCTCTTCTTCAACTGCTGTTACTGTGG
ATCCCCAAGTGCTTTTGGAGCTCTTCTCAATGTACAATAATTGGCAGGATGAAAGGGTCCAAAAGATTAACAAGAATCAGGAAGATATCGAAAACAAGATTGAAGTCACA
GATGCTTTGGCGGTTAAACTTCTTCAACGCTTAAACTTTTCTGCTTCTGCGGTGAAGACAGCTTCTCAACATCTATCAGAAGTTCACGCACTGGAAGTGGAAATCGGTGA
GCTTAAGGGAAGACTGACAGAAGTTATTAGTAATTGCGATGCATTATGCAGAAGAATTGCTTCAGAGGGACCAGAGTCTCTTCGGTCATCTATCAAGCCATTTGTCGTCG
TCACCGCAGACTCGGGGTCTTCCTGTAACTCATCTTCTCAGCAAGCTTACAGCAGTGTTCCAAAATCTAGGACAGTTGACCGCAGTAACCCTTTCAAAGAGTGGGCTCCC
ACTAAGGACTTTCCTCCTTTGGCCCTTTCATCCCAGGGAGTTCTCCACCGACTTAGCCTTCACCCTTTGCACGTTAAGATCCATATTCCAGAGCCTGAACACACCACGTG
A

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGASESALSSSISARPADAISTVSERSEAVDPILERLKSLKTTTPILQTPPTEGSLTDILVRKLPSSSTAVTVDPQVLLELFSMYNNWQDERVQKINKNQEDIENKIEVT
DALAVKLLQRLNFSASAVKTASQHLSEVHALEVEIGELKGRLTEVISNCDALCRRIASEGPESLRSSIKPFVVVTADSGSSCNSSSQQAYSSVPKSRTVDRSNPFKEWAP
TKDFPPLALSSQGVLHRLSLHPLHVKIHIPEPEHTT

Lag0019204 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome