CuGenDBv2

Gene ID	Lag0019436
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Serine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome location	chr5:42159938..42161296
RNA-Seq Expression	Lag0019436
Synteny	Lag0019436
Gene Ontology terms	GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6577068.1 hypothetical protein SDJN03_24642, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_022931532.1 homeobox protein prospero-like [Cucurbita moschata]

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XP_022985085.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucurbita maxima]

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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein

4.0e-193

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        T  ++SSSSYFSEANSKAL+YFLHRSSKSSLSSS DSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPN+ NP
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like

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A0A6J1FVC0 uncharacterized protein LOC111447620

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        LFL+GKLVP QVSSVKPSVN LKS RCVS PETAAQSRR VE ECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQ  SN   K ENHKTT     S SY S
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        E NPRSTMDHHPTATRVGRSP+R  PGES TRLA+RGVSVDSPR+NS GKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK K+RG ERSYSANVR+TPVL+VPVCSSLR
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A0A6J1IXV4 uncharacterized protein LOC111480206

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A0A6J1JAD5 uncharacterized serine-rich protein C215.13

1.1e-200

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Query:  SSSYFSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNNTNPPRIRQV
        SSSYFSEANSKAL+YFLHR+SKSSL+SSFDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCEN PN NPISLHRNPN+ NPPR+R V
Subjt:  SSSYFSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNNTNPPRIRQV

Query:  KPRPKSETNPR--STMDHHPTATRVGRSPIRRTPGE-STTRL-AIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKHRGMERSYSANVRVTPV
        KPRPKSETNPR  ST+DHHPTA RVGRSP+RRTPGE S++RL  IRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFK+RGMERSYSANVRVTPV
Subjt:  KPRPKSETNPR--STMDHHPTATRVGRSPIRRTPGE-STTRL-AIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKHRGMERSYSANVRVTPV

Query:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNRPTARRIIETDGGGKLH
        LNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG LF+GTG     RSHQSSSSSSSTNR T RRI ETDGGGK+H
Subjt:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNRPTARRIIETDGGGKLH

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G56020.1 unknown protein

4.8e-66

46.07

Show/hide

Query:  MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADE
        MASACV + G+S + F          SYGW SPR+S +R   DD   SSS+    S P P         EI+D      PV +FEF L+DPV  ML ADE
Subjt:  MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADE

Query:  LFLDGKLVPLQVSSVKPSVNDLKSTRCVSSPE-----TAAQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSS
        LF DGKLVPL+ S  K +     +T   ++ E        +S RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L      N  E  ++  +SSSSSS
Subjt:  LFLDGKLVPLQVSSVKPSVNDLKSTRCVSSPE-----TAAQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSS

Query:  YFSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHR-NPNNTNPPRIRQV
          +   + + + FLHR SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD + KP+ NP +  R +  N N PRIR  
Subjt:  YFSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHR-NPNNTNPPRIRQV

Query:  KPRPKSETNPRSTMDHHPTATRVGRSPIRRTPGESTTRLAIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-HRGMERSYSANVRVTPVL
        KPR           +H P+   V  S        S+  +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ K H GM RSYSANVR+TPVL
Subjt:  KPRPKSETNPRSTMDHHPTATRVGRSPIRRTPGESTTRLAIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-HRGMERSYSANVRVTPVL

Query:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNRPTARRIIETDG
        NVPVCS   G         FGQLFS            SSSSSSS+  P  +  ++++G
Subjt:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNRPTARRIIETDG

AT1G79060.1 unknown protein

1.2e-72

48.43

Show/hide

Query:  MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADE
        MAS CVNN+ +S D            +YG  +PR SFSRD  D    S S+A  + K                 +   V   +FEFRL++    MLPADE
Subjt:  MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADE

Query:  LFLDGKLVPLQVSSVKPSVNDLKSTRCVSSPETAAQSRR----RVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSSY
        LF DGKLV  Q                  + E   + RR     +E     D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+   S N +K+ +  TT++++  SS 
Subjt:  LFLDGKLVPLQVSSVKPSVNDLKSTRCVSSPETAAQSRR----RVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSSY

Query:  FSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNNTNPP--RIRQV
             + +L+ FLHRSS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD E +PN N I ++ N N T  P    R +
Subjt:  FSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNNTNPP--RIRQV

Query:  KPRPKSETNPRSTMDHHPTA----TRVGRSPIRRTPGESTTRLAIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKHRGMERSYSANVRVTP
         P P     PR  + +H T+     RVGRSP+RR+ GE T+ +  RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   ++HRGMERSYS+NVRVTP
Subjt:  KPRPKSETNPRSTMDHHPTA----TRVGRSPIRRTPGESTTRLAIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKHRGMERSYSANVRVTP

Query:  VLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSS
        VLNVPVC S+RG S       FGQ FS +   +SS+++++ +++++
Subjt:  VLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSS

AT3G12970.1 unknown protein

1.5e-56

44.44

Show/hide

Query:  MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADE
        MAS CV N+G S           P HS  W S ++S +R+               S+P  PA        + + D    PV +FEF L+DPV  ML ADE
Subjt:  MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADE

Query:  LFLDGKLVPLQVSSVK-PSVNDLKSTRCVSSPETAAQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSSYF
        LF DGKLVPL+ S V  P    + S        TA +  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L       K +   + SSSS  SS  
Subjt:  LFLDGKLVPLQVSSVK-PSVNDLKSTRCVSSPETAAQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSSYF

Query:  SEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNT-NPISL-----HRNPNNTNPP
            + + R+FL+RSSKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD +NKP T NP +      H +  N N P
Subjt:  SEANSKALRYFLHRSSKSSLSSSFDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNT-NPISL-----HRNPNNTNPP

Query:  RIRQVKPRPKSETNPRSTMDHHPTATRVGRSPIRRTPGESTTRLAIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-HRGMERSYSANVRVT
        R    KPR  ++ +  +                     ES+    +  V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K H GM RS+SANVR+T
Subjt:  RIRQVKPRPKSETNPRSTMDHHPTATRVGRSPIRRTPGESTTRLAIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-HRGMERSYSANVRVT

Query:  PVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNR
        PVLNVPV SSLR   KS  +F FGQLF+         S  +SSSSSS NR
Subjt:  PVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNR

Sequences

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CDS sequence

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ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAACATCGGAATGTCGTCGGACAACTTCCTCGACTGTTCTTCCTCTGCTCCTTGCCATTCCTACGGCTGGCTCAGCCCTCGCATCTCCTT
CAGCCGCGACTTCTCCGACGACACTCCGCCTTCTTCCAGCCTCGCCGGACCTATGTCTAAGCCTCCGCCGCCTGCCGCTGACCCGGCCGGAGAGTCCGAGATTCGAGATC
CGGATCCTGAACTGGTTCCGGTCAGCGAGTTCGAGTTCCGCCTTCAAGATCCCGTCGCCTTGATGCTCCCTGCGGATGAGCTGTTTCTGGATGGGAAACTGGTCCCGCTT
CAGGTCTCGTCTGTTAAACCCTCGGTCAACGATTTAAAGTCGACGAGGTGCGTTTCGTCGCCAGAGACTGCGGCTCAGTCCCGCAGGAGAGTTGAGGAAGAATGCAGTAC
GGATCCGTATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGAGAGCTTTTAGGGCTCAAGAAGCTCTACCAGAGCAACAATGGCAACAAAAACGAAAATC
ACAAAACGACGTCGTCCTCCTCCTCCTCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCAAATTCAAAGGCGCTGAGGTATTTCCTCCATCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCTTCTTCG
TTCGATTCATCGCTGAGCCTTCCATTGCTGAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCGCTGTCTTCTTCCCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGCCACGAACACGA
AGATCTTCACAGACTCTCGCTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATCGGAACCCTAACAATACCAATCCCCCGCGGATTAGGCAGGTGAAAC
CTCGGCCTAAATCGGAGACCAATCCGAGATCAACAATGGATCATCATCCGACGGCGACGAGAGTAGGAAGAAGCCCGATACGGCGTACACCGGGAGAATCAACCACAAGA
TTAGCGATCCGAGGAGTATCCGTAGACAGTCCACGAATGAACTCCTCAGGTAAAATCGTATTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAGCAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGG
ACCGAAATTCAAACACAGAGGAATGGAACGGTCATACTCAGCAAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGCTCTTCCCTGAGAGGATCCTCAAAATCCG
TCTCTGTATTCGGATTCGGTCAGTTATTCTCCGGCACCGGCATCGGCACAAGCAGCAGAAGCCACCAGAGTAGTAGTAGTAGTAGTAGTACTAACCGGCCGACGGCACGG
CGGATCATCGAAACAGACGGCGGAGGAAAACTCCATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

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MASACVNNIGMSSDNFLDCSSSAPCHSYGWLSPRISFSRDFSDDTPPSSSLAGPMSKPPPPAADPAGESEIRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVALMLPADELFLDGKLVPL
QVSSVKPSVNDLKSTRCVSSPETAAQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSNNGNKNENHKTTSSSSSSSSYFSEANSKALRYFLHRSSKSSLSSS
FDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNNTNPPRIRQVKPRPKSETNPRSTMDHHPTATRVGRSPIRRTPGESTTR
LAIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKHRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGQLFSGTGIGTSSRSHQSSSSSSSTNRPTAR
RIIETDGGGKLH

Lag0019436 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome