; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0019764 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0019764
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionclassical arabinogalactan protein 1-like
Genome locationchr5:45211714..45212085
RNA-Seq ExpressionLag0019764
SyntenyLag0019764
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044959 - Classical arabinogalactan protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030900.1 hypothetical protein SDJN02_04937, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-3083.05Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIR FVVM++VAMLI S IAQSP+ASPS+SP+KSPSKAPS SPSV+SPKSSPAAAPTP+SLKSPPSPPA+SPS SPSP  SPSSISSPPADAPAPSGN 
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYA
        AASISFS+ GSVA  LYA
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYA

XP_022922765.1 classical arabinogalactan protein 1-like [Cucurbita moschata]1.2e-2982.93Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIRSFVVMILVA+LIGS IAQSPAASPS+SP KSPSKAPSASPSVKSPKSSP AAPT          PASSPS+SPSPA SPSSISSPPADAPAPSG+G
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASISFSV GSVAV LYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

XP_022942993.1 classical arabinogalactan protein 1-like [Cucurbita moschata]2.8e-3182.93Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIR FVVM+ VAMLI S IAQSP+ASPS+SP+KSPSKAPS SPSV+SPKSSPAAAPTP+SLKSPPSPPA+SPS SPSP  SPSSISSPPADAPAPSGN 
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASISFS+ GSVA  LYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

XP_023542663.1 classical arabinogalactan protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-3281.3Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIR FVVM++VAMLI S IAQSP+ASPS+SP+KSPSKAPS SPSV+SPKSSPAAAPTP+SL+SPPSPPA+SPS SPSP+ SPSSISSPPADAPAPSGN 
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASIS S+ GSVA  LYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

XP_038877310.1 classical arabinogalactan protein 1 [Benincasa hispida]1.2e-3284.25Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSP----SPATSPSSISSPPADAPAP
        MAIRSFV MILVA+LIGS IAQSP ASP  SPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPP++SP++SP    SPATSPS ISSPPADAPAP
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSP----SPATSPSSISSPPADAPAP

Query:  SGNGAASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        SGNGAASISFSV GSVAV LY  VL+I
Subjt:  SGNGAASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZB8 Uncharacterized protein8.4e-2978.05Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAI S V +I V+  I S  AQSPAASPS+SP+KSPSKAPS +    SPKSSPA APTPSSLKSPPSPP+SSPS+SPSPA+SP+SISSPPADAPAPSGNG
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASI+FSV GSVAVALYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

A0A6J1E9Q3 classical arabinogalactan protein 1-like5.8e-3082.93Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIRSFVVMILVA+LIGS IAQSPAASPS+SP KSPSKAPSASPSVKSPKSSP AAPT          PASSPS+SPSPA SPSSISSPPADAPAPSG+G
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASISFSV GSVAV LYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

A0A6J1FW49 classical arabinogalactan protein 1-like1.4e-3182.93Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIR FVVM+ VAMLI S IAQSP+ASPS+SP+KSPSKAPS SPSV+SPKSSPAAAPTP+SLKSPPSPPA+SPS SPSP  SPSSISSPPADAPAPSGN 
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASISFS+ GSVA  LYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

A0A6J1J6X2 classical arabinogalactan protein 1-like7.6e-3082.93Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MAIRSFVVMILVA+LIGS IAQSPAASPS+SP KSPSKAP ASPSVKSPKSSP AAPT          PASSPS+SPSPA SPSSISSPPADAPAPSGNG
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASISFSV GSVAV LYA VLMI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

A0A6J1JSK4 classical arabinogalactan protein 1-like3.8e-2979.67Show/hide
Query:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG
        MA R FVVM+ VAMLI S IAQSP+ASPS+SP+KSPSKAPS SPSV+SPKSSPAAAPTP+SLKSPPSPPA+SPS SPSP  SPSSISSPPADAPAPSGN 
Subjt:  MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNG

Query:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        AASIS S+ GSVA  L+A V MI
Subjt:  AASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LCN5 Classical arabinogalactan protein 12.9e-1051.56Show/hide
Query:  RSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPS------MSPSKSPSK--APSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPA
        +S V ++L A+LI S +AQSPA +PS      +SP+ SP K  AP+ +P V SP  SPAAA TP S  SPPSPP +   ++ SPA SPS+IS  P +AP 
Subjt:  RSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPS------MSPSKSPSK--APSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPA

Query:  PSGNGAASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        P+  GA S  F+  GSVAV L AAVL+I
Subjt:  PSGNGAASISFSVIGSVAVALYAAVLMI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64310.1 arabinogalactan protein 12.0e-1151.56Show/hide
Query:  RSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPS------MSPSKSPSK--APSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPA
        +S V ++L A+LI S +AQSPA +PS      +SP+ SP K  AP+ +P V SP  SPAAA TP S  SPPSPP +   ++ SPA SPS+IS  P +AP 
Subjt:  RSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPS------MSPSKSPSK--APSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPA

Query:  PSGNGAASISFSVIGSVAVALYAAVLMI
        P+  GA S  F+  GSVAV L AAVL+I
Subjt:  PSGNGAASISFSVIGSVAVALYAAVLMI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGATTAGAAGCTTCGTCGTGATGATTTTGGTGGCGATGTTGATCGGCTCCACAATCGCCCAATCGCCGGCGGCATCTCCGTCAATGTCTCCAAGCAAATCGCCGTC
GAAGGCTCCGTCGGCTTCTCCGTCTGTGAAGTCTCCGAAATCATCTCCCGCGGCGGCGCCTACTCCGTCCTCTCTGAAGTCTCCGCCATCTCCTCCTGCTTCTTCTCCGT
CCTCGTCTCCATCTCCTGCGACTTCTCCGTCCTCGATCTCCTCGCCTCCAGCCGACGCTCCGGCTCCGTCCGGTAATGGCGCCGCTTCGATATCTTTCTCGGTGATCGGA
TCTGTGGCCGTTGCGCTATACGCCGCCGTTTTGATGATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGATTAGAAGCTTCGTCGTGATGATTTTGGTGGCGATGTTGATCGGCTCCACAATCGCCCAATCGCCGGCGGCATCTCCGTCAATGTCTCCAAGCAAATCGCCGTC
GAAGGCTCCGTCGGCTTCTCCGTCTGTGAAGTCTCCGAAATCATCTCCCGCGGCGGCGCCTACTCCGTCCTCTCTGAAGTCTCCGCCATCTCCTCCTGCTTCTTCTCCGT
CCTCGTCTCCATCTCCTGCGACTTCTCCGTCCTCGATCTCCTCGCCTCCAGCCGACGCTCCGGCTCCGTCCGGTAATGGCGCCGCTTCGATATCTTTCTCGGTGATCGGA
TCTGTGGCCGTTGCGCTATACGCCGCCGTTTTGATGATCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIRSFVVMILVAMLIGSTIAQSPAASPSMSPSKSPSKAPSASPSVKSPKSSPAAAPTPSSLKSPPSPPASSPSSSPSPATSPSSISSPPADAPAPSGNGAASISFSVIG
SVAVALYAAVLMI