; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0019925 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0019925
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic
Genome locationchr5:46750514..46752863
RNA-Seq ExpressionLag0019925
SyntenyLag0019925
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR038789 - Protein LOW PSII ACCUMULATION 2 like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600161.1 Protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-8286.57Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQIIHH SPSSFT KPYHLP  PLHF SK KF IKSQNPSESEKPISK VDD+P         +SSAQGFGS SSQSTT+SKSSPKA  SKGKQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEA KEQ +NESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPE+WDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  K
        K
Subjt:  K

XP_022941727.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic [Cucurbita moschata]9.7e-8586.83Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQIIHH SPSSFT KPYHLP  PLHF SK KF IKSQNPSESEKPISK VDD+P         +SSAQGFGS SSQSTT+SKSSPKA  SKGKQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEA KEQ +NESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPE+WDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        KGDKS
Subjt:  KGDKS

XP_022973018.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic [Cucurbita maxima]4.1e-8385.85Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQIIHH SPSSFT KPYHLP TPL+F SK KF IKSQ+PSESEKPISK VDD       +   +SSAQGFGS SSQSTT+SKSSPKA  SKGKQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEA KEQ +NESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPE WDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        KGDKS
Subjt:  KGDKS

XP_023554492.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-8587.32Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQIIHH SPSSFT KPYHLP TPLHF SK KF IKSQNPSESEKPISK VDD+P         +SSAQGFGS SSQSTT+SKSSPKA  SKGKQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEA KEQ +NESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPE+WDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        KGDKS
Subjt:  KGDKS

XP_038899637.1 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic [Benincasa hispida]2.0e-8286.83Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQI+HH SPSSFT KPYHLP+  L+F SK KF I SQNPSESEKPISK VDD+ P+ATSSK SSSS QGFGSSSSQSTTTSKSSPKA     KQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVG+VDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGV KYLQNEK+
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        K +KS
Subjt:  KGDKS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AXX6 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic6.4e-8284.39Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQI+HH SPSSFT KPYHLP+  LHFSSK KF IKSQNPSESEKPISKIVDD+ P+ATSSK S+SS QGFGSSS QST+TSKS+PK+     KQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDE+ AKEQSRNESYFLLTWLGLG VILVEGIVLAASGFLPEEWD+ FVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGV KYLQNEK+
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        K +KS
Subjt:  KGDKS

A0A5A7VJY0 Protein LOW PSII ACCUMULATION 21.9e-8183.9Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQI+HH SPSSFT KPYHLP+  LHFSSK KF IKSQNPSESEKPISKIVDD+ P+ATSSK  +SS+QGFGSSS QST+TSKS+PK+     KQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDE+ AKEQSRNESYFLLTWLGLG VILVEGIVLAASGFLPEEWD+ FVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGV KYLQNEK+
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        K +KS
Subjt:  KGDKS

A0A6J1CH98 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic5.0e-7985.51Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQN--PSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKG
        MALQII H SPSSFT KPY LP  PL F SKR F IKSQN   SESEK ISK+VDD+  VATSSKASSSSAQGFGSS +QS  TSK SPKA PSKGKQKG
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQN--PSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKG

Query:  KRQRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNE
        KRQRASIIRRSPVEKPVFVG+VDEEAAKEQ RNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKF VKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGV KYLQNE
Subjt:  KRQRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNE

Query:  KLKGDKS
        K KG+KS
Subjt:  KLKGDKS

A0A6J1FNA7 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic4.7e-8586.83Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQIIHH SPSSFT KPYHLP  PLHF SK KF IKSQNPSESEKPISK VDD+P         +SSAQGFGS SSQSTT+SKSSPKA  SKGKQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEA KEQ +NESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPE+WDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        KGDKS
Subjt:  KGDKS

A0A6J1IBT8 protein LOW PSII ACCUMULATION 2, chloroplastic2.0e-8385.85Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQIIHH SPSSFT KPYHLP TPL+F SK KF IKSQ+PSESEKPISK VDD       +   +SSAQGFGS SSQSTT+SKSSPKA  SKGKQKGKR
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEA KEQ +NESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPE WDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDKS
        KGDKS
Subjt:  KGDKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4KDA6 Protein LPA23.3e-4355.39Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQI   +SP SF+T+PYHL  T    +   +F IK QN        S+I  D+    + SK SSSS  GFGS +S S+   K S   A + G +KGK 
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        +R  + RR+PVEKPVF+ E     A+EQ +NE+ FLLTWLGLG VIL+EGI+LAASGFLPEE DK FVKY+YP FTP+V LFVAGT AYGV KY+QNEK+
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDK
        KG +
Subjt:  KGDK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G51545.1 low psii accumulation22.3e-4455.39Show/hide
Query:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR
        MALQI   +SP SF+T+PYHL  T    +   +F IK QN        S+I  D+    + SK SSSS  GFGS +S S+   K S   A + G +KGK 
Subjt:  MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKR

Query:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL
        +R  + RR+PVEKPVF+ E     A+EQ +NE+ FLLTWLGLG VIL+EGI+LAASGFLPEE DK FVKY+YP FTP+V LFVAGT AYGV KY+QNEK+
Subjt:  QRASIIRRSPVEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKL

Query:  KGDK
        KG +
Subjt:  KGDK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCTACAAATAATCCACCATTATTCTCCTTCTTCTTTCACCACAAAACCCTATCATCTTCCCCACACACCTCTCCATTTCTCCTCAAAACGCAAATTCTTCATCAA
ATCGCAGAACCCATCGGAATCGGAGAAGCCCATTTCCAAAATTGTTGATGATTCTCCTCCAGTTGCGACCTCATCCAAGGCGTCGAGCTCATCTGCTCAAGGTTTCGGCT
CTTCGTCGTCTCAATCGACGACTACGAGCAAATCAAGTCCAAAGGCTGCACCCTCTAAGGGAAAGCAGAAGGGTAAGCGGCAGAGGGCATCGATTATTCGGCGCTCGCCA
GTGGAGAAACCGGTGTTTGTTGGAGAAGTAGATGAAGAAGCAGCTAAGGAGCAGAGCAGGAACGAGAGCTATTTTCTTCTTACTTGGTTGGGTCTTGGTGCGGTGATTCT
CGTCGAGGGGATTGTGCTTGCGGCATCCGGTTTCTTACCAGAAGAGTGGGATAAGTTCTTTGTCAAATATTTGTATCCATCCTTTACACCAACCGTCTCTTTGTTTGTTG
CTGGAACTGTTGCATACGGAGTTTCGAAGTATCTTCAGAATGAGAAACTTAAAGGTGATAAATCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGCTACAAATAATCCACCATTATTCTCCTTCTTCTTTCACCACAAAACCCTATCATCTTCCCCACACACCTCTCCATTTCTCCTCAAAACGCAAATTCTTCATCAA
ATCGCAGAACCCATCGGAATCGGAGAAGCCCATTTCCAAAATTGTTGATGATTCTCCTCCAGTTGCGACCTCATCCAAGGCGTCGAGCTCATCTGCTCAAGGTTTCGGCT
CTTCGTCGTCTCAATCGACGACTACGAGCAAATCAAGTCCAAAGGCTGCACCCTCTAAGGGAAAGCAGAAGGGTAAGCGGCAGAGGGCATCGATTATTCGGCGCTCGCCA
GTGGAGAAACCGGTGTTTGTTGGAGAAGTAGATGAAGAAGCAGCTAAGGAGCAGAGCAGGAACGAGAGCTATTTTCTTCTTACTTGGTTGGGTCTTGGTGCGGTGATTCT
CGTCGAGGGGATTGTGCTTGCGGCATCCGGTTTCTTACCAGAAGAGTGGGATAAGTTCTTTGTCAAATATTTGTATCCATCCTTTACACCAACCGTCTCTTTGTTTGTTG
CTGGAACTGTTGCATACGGAGTTTCGAAGTATCTTCAGAATGAGAAACTTAAAGGTGATAAATCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALQIIHHYSPSSFTTKPYHLPHTPLHFSSKRKFFIKSQNPSESEKPISKIVDDSPPVATSSKASSSSAQGFGSSSSQSTTTSKSSPKAAPSKGKQKGKRQRASIIRRSP
VEKPVFVGEVDEEAAKEQSRNESYFLLTWLGLGAVILVEGIVLAASGFLPEEWDKFFVKYLYPSFTPTVSLFVAGTVAYGVSKYLQNEKLKGDKS