; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0020982 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0020982
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptioncytochrome b5
Genome locationchr7:3688907..3691008
RNA-Seq ExpressionLag0020982
SyntenyLag0020982
Gene Ontology termsGO:0042761 - very long-chain fatty acid biosynthetic process (biological process)
GO:0043447 - alkane biosynthetic process (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001199 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
IPR018506 - Cytochrome b5, heme-binding site
IPR036400 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133998.1 cytochrome b5 [Cucumis sativus]7.5e-7097.76Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID+STIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_008438367.1 PREDICTED: cytochrome b5 [Cucumis melo]3.4e-7098.51Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_022147043.1 cytochrome b5-like [Momordica charantia]6.4e-6996.27Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWL+ISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID STIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_022936377.1 cytochrome b5-like [Cucurbita moschata]3.7e-6996.27Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID STIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_023521594.1 cytochrome b5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.9e-6995.52Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID ST+PKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L7Y9 Cytochrome b5 heme-binding domain-containing protein3.7e-7097.76Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID+STIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A1S3AWT9 cytochrome b51.6e-7098.51Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A5D3D383 Cytochrome b51.6e-7098.51Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A6J1F8A2 cytochrome b5-like1.8e-6996.27Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID STIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A6J1IHM0 cytochrome b5-like1.8e-6996.27Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWL+ISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMM+QYYVGEID STIPKKVAYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04354 Cytochrome b53.2e-5575.97Show/hide
Query:  KVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTS
        K+FTL EVA+HNN KDCWL+I+GKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFED+GHS +A+ M+++YYVG+ID+S+IP +V YTPPKQP YN DKT 
Subjt:  KVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTS

Query:  EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        EF+IKLLQFLVPL IL  A+ IRFYTK +
Subjt:  EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

O48845 Cytochrome b5 isoform B1.8e-6184.85Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MG   K+FTL EV+EHN   DCW+VI+GKVY+VTKFLEDHPGGDDVLLS+TGKDATDDFEDVGHS++AREMMEQYYVGEID +TIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAV IR YTK
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

P49098 Cytochrome b53.7e-5978.36Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MG   KVFTL EV++HNN KDCWLVISGKVYDVTKFL+DHPGGD+VLLSATGKDATDDFEDVGHS +AR M+++YYVG+ID++TIP K  YTPP QPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEF++KLLQFLVPL ILG+A  IRFYTKQ+
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

P49099 Cytochrome b5, seed isoform3.1e-5876.87Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MG   KVFTL EV+ HNN KDCWL+ISGKVY+VTKFLEDHPGG +VLLSATGKDATDDFED+GHS +AR M+++YYVG+ID+STIP KV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKT+EFI+KLLQFLVPL ILG+A  + FYTKQ+
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

P49100 Cytochrome b54.9e-5678.91Show/hide
Query:  EKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKT
        +KV+TL+EVA+HN+  DCWL+I GKVY+V+KFLEDHPGGDDVLLS+TGKDATDDFEDVGHS  AR MM++YYVG+ID STIP +  Y PPKQPHYNQDKT
Subjt:  EKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKT

Query:  SEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
         EFIIK+LQFLVPLAILGLAVAIR YTK
Subjt:  SEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26340.1 cytochrome B5 isoform A3.3e-3146.46Show/hide
Query:  KVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTS
        K+++++E A HN   DCW+VI GKVYDV+ ++++HPGGDDVLL+  GKDATDDFED GHS +ARE+ME+Y++GE+D S++P+      P+   Y +D+  
Subjt:  KVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTS

Query:  EFIIKLLQ-----FLVPLAILGLAVAI
        + + KL       ++VP++I+ ++VA+
Subjt:  EFIIKLLQ-----FLVPLAILGLAVAI

AT2G32720.1 cytochrome B5 isoform B1.2e-6284.85Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        MG   K+FTL EV+EHN   DCW+VI+GKVY+VTKFLEDHPGGDDVLLS+TGKDATDDFEDVGHS++AREMMEQYYVGEID +TIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAV IR YTK
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

AT2G46650.1 cytochrome B5 isoform C1.5e-3147.29Show/hide
Query:  VFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTS-
        + +  +VA+H    DCW++I GKVYD++ F+++HPGGD+VLL+ TGKDA+ DFEDV HS +A+E+M++Y +G++D ST+P    Y PP +      +T+ 
Subjt:  VFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTS-

Query:  -EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ
         E   KLL +L+PL ILG+A A+RFY  +
Subjt:  -EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ

AT5G48810.1 cytochrome B5 isoform D2.3e-4864.93Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPH--
        MG   KVFTL EV++H++ KDCW+VI GKVYDVTKFL+DHPGGD+V+L++TGKDATDDFEDVGHS  A+ M+++YYVG+ID +T+P K  + PP      
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPH--

Query:  YNQDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
          QDK+S+F+IKLLQFLVPL ILGLA  IR+YTK
Subjt:  YNQDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

AT5G53560.1 cytochrome B5 isoform E1.3e-5166.92Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN
        M S  KV + +EV++HN  KDCWL+ISGKVYDVT F++DHPGGD+VLLS+TGKDAT+DFEDVGHSD AR+MM++Y++GEID+S++P    Y  P+QP YN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ
        QDKT EFIIK+LQFLVP+ ILGLA+ +R YTK+
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTAGCGGAGAAAAGGTCTTCACCTTGAAGGAAGTCGCCGAGCACAACAATCACAAGGACTGCTGGCTCGTCATCAGTGGAAAGGTATATGATGTGACCAAATTCTT
AGAAGACCATCCTGGTGGTGATGATGTTTTGTTATCAGCTACAGGAAAAGATGCAACCGACGATTTCGAAGACGTTGGGCACAGTGACAATGCAAGAGAAATGATGGAGC
AATACTATGTTGGGGAGATTGATGCTTCAACAATTCCGAAGAAGGTCGCATACACACCTCCAAAACAGCCTCATTACAATCAGGACAAGACATCCGAGTTCATCATCAAG
CTTCTCCAATTCCTCGTTCCGCTTGCGATTTTGGGATTGGCAGTCGCAATACGCTTCTACACCAAACAAGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTAGCGGAGAAAAGGTCTTCACCTTGAAGGAAGTCGCCGAGCACAACAATCACAAGGACTGCTGGCTCGTCATCAGTGGAAAGGTATATGATGTGACCAAATTCTT
AGAAGACCATCCTGGTGGTGATGATGTTTTGTTATCAGCTACAGGAAAAGATGCAACCGACGATTTCGAAGACGTTGGGCACAGTGACAATGCAAGAGAAATGATGGAGC
AATACTATGTTGGGGAGATTGATGCTTCAACAATTCCGAAGAAGGTCGCATACACACCTCCAAAACAGCCTCATTACAATCAGGACAAGACATCCGAGTTCATCATCAAG
CTTCTCCAATTCCTCGTTCCGCTTGCGATTTTGGGATTGGCAGTCGCAATACGCTTCTACACCAAACAAGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSGEKVFTLKEVAEHNNHKDCWLVISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMEQYYVGEIDASTIPKKVAYTPPKQPHYNQDKTSEFIIK
LLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA