| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6597332.1 Nuclear transport factor 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.1e-121 | 82.87 | Show/hide |
Query: ISTTMAAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEV
+S + ATAAGAS FTT K WLSD+LL TPS M PILSRSLAIESA L AFSERWRP LG SAAVVQ +AAVT G EEGVA+ETAEEGEG+
Subjt: ISTTMAAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEV
Query: VDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPE
VDGGSPVESG TKLY GNLPYSVDSSQLA IVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGR+LRVNFSDKPKPK LYP+
Subjt: VDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPE
Query: TEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
+EY+L+V NLSWSVTSESL QAFQEYGNVVGARVIY+ ETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL A NE+ELEGRVIRVSLA+GKQAQG
Subjt: TEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| XP_004134038.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis sativus] | 4.4e-126 | 86.83 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAA A GASFF T LR SRSKHWLSDSLLATPSTQ+LPILSRSLAIES L A SE+WRPV+ SAAVVQGE AVTVG EEGV EET V+GGS
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
PVESG+TKLY GNLPYSVDSSQLAAIVQDYG+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Subjt: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Query: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
FVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIY+GETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL +NE+ELEGRVIRVSLAEGKQA G
Subjt: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| XP_016898952.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein [Cucumis melo] | 5.4e-124 | 89.3 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAA A GASFFTTPLR SRSKHW SDSLLATPSTQ+LPILSRSL IES L A SERWRPVL SAAVVQGE AV VG EEGV EETA V+GGS
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
PVESG+TKLY GNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Subjt: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Query: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRV
FVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL ALNEVELEGRVIRV
Subjt: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRV
|
|
| XP_022157973.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Momordica charantia] | 5.1e-122 | 84.1 | Show/hide |
Query: AAATAAGASF--FTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDG
AAA G+SF T + RSKHWLSDSLLA PSTQMLP+LSR LA+ESASL AFSE+WRPVLG SAAVVQGE AVT EEGVAE E+G GE V G
Subjt: AAATAAGASF--FTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDG
Query: GSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY
GSPVE+G+TKLY GNLPYSVDSSQLA IVQ++GV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPKEPLYPETEY
Subjt: GSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY
Query: KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTK EME AL ALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
Subjt: KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| XP_023539751.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.9e-122 | 84.27 | Show/hide |
Query: STTMA-AATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEV
S TMA AA AAGAS FTT K WLSD+LL TPS M PILSRSLAIESA L AFSERWRP LG SAAVVQ +AAVT G EEGVA+ETAEEGEG+V
Subjt: STTMA-AATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEV
Query: VDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPE
VDGGSPVESG TKLY GNLPYSVDSSQLA IVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGR+LRVNFSDKPKPK LYP+
Subjt: VDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPE
Query: TEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
+EY+L+V NLSWSVTSESL QAFQEYGNVVGARVIY+ ETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL A NE+ELEGRVIRVSLA+GKQAQG
Subjt: TEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L496 Uncharacterized protein | 2.1e-126 | 86.83 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAA A GASFF T LR SRSKHWLSDSLLATPSTQ+LPILSRSLAIES L A SE+WRPV+ SAAVVQGE AVTVG EEGV EET V+GGS
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
PVESG+TKLY GNLPYSVDSSQLAAIVQDYG+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Subjt: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Query: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
FVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIY+GETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL +NE+ELEGRVIRVSLAEGKQA G
Subjt: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| A0A1S4DSH7 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein | 2.6e-124 | 89.3 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAA A GASFFTTPLR SRSKHW SDSLLATPSTQ+LPILSRSL IES L A SERWRPVL SAAVVQGE AV VG EEGV EETA V+GGS
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
PVESG+TKLY GNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Subjt: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Query: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRV
FVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL ALNEVELEGRVIRV
Subjt: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRV
|
|
| A0A5D3CZH4 Putative G3BP-like protein | 3.0e-120 | 89.31 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAA A GASFFTTPLR SRSKHW SDSLLATPSTQ+LPILSRSL IES L A SERWRPVL SAAVVQGE AVTVG EEGV EETA V+GGS
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
PVESG+TKLY GNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Subjt: PVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKL
Query: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEV
FVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL ALNEV
Subjt: FVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEV
|
|
| A0A6J1DUT6 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.4e-122 | 84.1 | Show/hide |
Query: AAATAAGASF--FTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDG
AAA G+SF T + RSKHWLSDSLLA PSTQMLP+LSR LA+ESASL AFSE+WRPVLG SAAVVQGE AVT EEGVAE E+G GE V G
Subjt: AAATAAGASF--FTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDG
Query: GSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY
GSPVE+G+TKLY GNLPYSVDSSQLA IVQ++GV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPKEPLYPETEY
Subjt: GSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY
Query: KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTK EME AL ALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
Subjt: KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| A0A6J1FA65 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic-like | 5.5e-122 | 82.87 | Show/hide |
Query: ISTTMAAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEV
+S + ATAAGAS FTT K WLSD+LL TPS M PILSRSLAIESA L AFSERWRP LG SAAVVQ +AAVT G EEGVA+ETAEEGEG+
Subjt: ISTTMAAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEV
Query: VDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPE
VDGGSPVESG TKLY GNLPYSVDSSQLA IVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGR+LRVNFSDKPKPK LYP+
Subjt: VDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPE
Query: TEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
+EY+L+V NLSWSVTSESL QAFQEYGNVVGARVIY+ ETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL A NE+ELEGRVIRVSLA+GKQAQG
Subjt: TEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19683 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 1.6e-38 | 41.55 | Show/hide |
Query: EEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVES-----GNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYM
EEG E + GE + V+ E + KL+VGNLPY VDS LA + + GV E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+ K +E +
Subjt: EEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVES-----GNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYM
Query: GRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIR
GR+L VN + ++P+ + P E Y+++VGN+ W + L Q F E+G VV ARV+Y+ ETG+SRG+GFV+ ++++EM A+ L+ L+GR IR
Subjt: GRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIR
Query: VSLAEGK
V++AE +
Subjt: VSLAEGK
|
|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 2.8e-38 | 40.08 | Show/hide |
Query: LGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVA---------EETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAF
L T A+V G V EE VA EE E E E V+GG +LYVGNLP+S+ SSQL+ I + G +E++YDR T +SRGFAF
Subjt: LGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVA---------EETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAF
Query: VTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRG
VTM S+E+ + I DG+ GR ++VNF + P+ E + ++ +KL+V NLSW++TS+ L AF + + A+VIY+ +G+SRG
Subjt: VTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRG
Query: YGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGK
+GF+++S+ M +AL +NEVELEGR +R+++A K
Subjt: YGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGK
|
|
| P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 3.6e-38 | 41.81 | Show/hide |
Query: IAFSERWRPVLGTSAAVVQGEA----AVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKS
+A + W G++ AV++GE+ AV+ G E V++E EG G KL+VGNLPY VDS +LA I GV E+ EV+Y+R T +S
Subjt: IAFSERWRPVLGTSAAVVQGEA----AVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKS
Query: RGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY----KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGF
RGF FVTMS++E+ K +E L+G GR L VN P+ P ++ +++VGNL W V + L Q F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GF
Subjt: RGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY----KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGF
Query: VSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAE
V+ S++SE+ A+ AL+ L+GR +RV++AE
Subjt: VSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAE
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 5.8e-36 | 34.59 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAATA+ A+ F PL S S L TP + L + I +++ R+ T A+ E +V EE V EE +EGE EV +
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNT--KLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE--------
++ +LYVGNLPY++ SS+L+ I + G ++++YD+ T +SRGF FVTM SIE+ + ++ + + GR ++VNF + P+ E
Subjt: PVESGNT--KLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE--------
Query: ----PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
Y ++ +K++ GNL W++TS+ L AF + V+GA+VIY TG+SRG+GF+S+ + +++AL +N VE+EGR +R++LA ++
Subjt: ----PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
|
|
| Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic | 5.8e-36 | 36.36 | Show/hide |
Query: SRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIES--ASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLP
S H + SL + P L + S++L S + ++ + W A +GE ++G +E+ E +G G P KL+VGNLP
Subjt: SRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIES--ASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLP
Query: YSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTS
Y VDS LA + + G E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+ K +E + GR L VN + +P+ ++P + ++++VGNL W V S
Subjt: YSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTS
Query: ESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAE
L + F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV S ++E+ A+ AL+ LEGR I+V++AE
Subjt: ESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.7e-71 | 67.18 | Show/hide |
Query: EETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSD
EE ++G V+D P + NTKLY GNLPY+VDS+ LA I+QD+ EL+EVLY+R+TG+SRGFAFVTMS++EDCN +I+NLDGT Y+GR L+VNF+D
Subjt: EETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSD
Query: KPKP-KEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
KPKP KEPLYPETE+KLFVGNLSW+VTSESL AF+E G+VVGARV+++G+TG+SRGYGFV YS+K+EMETAL +L+ ELEGR IRV+LA+GK+
Subjt: KPKP-KEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
|
|
| AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.7e-36 | 35.88 | Show/hide |
Query: PILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIE
P LS L +S S + + +W + A+ A+T F E E+G +V S + KL+VGNLP++VDS+QLA + + G E++E
Subjt: PILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIE
Query: VLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLY---PETEY-------------------KLFVGNLSWSVTSESLT
V+YD+ TG+SRGF FVTMSS+ + + +G GR LRVN P +E + P + + +++VGNLSW V +L
Subjt: VLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLY---PETEY-------------------KLFVGNLSWSVTSESLT
Query: QAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGK
F E G VV ARVIY+ ++G+S+G+GFV+Y + E++ A+ +L+ +L+GR IRVS AE +
Subjt: QAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGK
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 4.1e-37 | 34.59 | Show/hide |
Query: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
AAATA+ A+ F PL S S L TP + L + I +++ R+ T A+ E +V EE V EE +EGE EV +
Subjt: AAATAAGASFFTTPLRCSRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIESASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGS
Query: PVESGNT--KLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE--------
++ +LYVGNLPY++ SS+L+ I + G ++++YD+ T +SRGF FVTM SIE+ + ++ + + GR ++VNF + P+ E
Subjt: PVESGNT--KLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE--------
Query: ----PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
Y ++ +K++ GNL W++TS+ L AF + V+GA+VIY TG+SRG+GF+S+ + +++AL +N VE+EGR +R++LA ++
Subjt: ----PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
|
|
| AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein | 1.6e-36 | 40.72 | Show/hide |
Query: SAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGG------SPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSI
S V +G+ + E V+E +E EG+V +G P S KL+VGNL Y V+S LA + + G E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMSS+
Subjt: SAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGG------SPVESGNTKLYVGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSI
Query: EDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMET
++ +E + GR+L VN + +P+ + P E ++++VGNL W V + L Q F E+G VV ARV+Y+ ETG+SRG+GFV+ S E+
Subjt: EDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMET
Query: ALGALNEVELEGRVIRVSLAE
A+ AL+ LEGR IRV++AE
Subjt: ALGALNEVELEGRVIRVSLAE
|
|
| AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B | 4.1e-37 | 36.36 | Show/hide |
Query: SRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIES--ASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLP
S H + SL + P L + S++L S + ++ + W A +GE ++G +E+ E +G G P KL+VGNLP
Subjt: SRSKHWLSDSLLATPSTQMLPILSRSLAIES--ASLIAFSERWRPVLGTSAAVVQGEAAVTVGFEEGVAEETAEEGEGEVVDGGSPVESGNTKLYVGNLP
Query: YSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTS
Y VDS LA + + G E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+ K +E + GR L VN + +P+ ++P + ++++VGNL W V S
Subjt: YSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTS
Query: ESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAE
L + F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV S ++E+ A+ AL+ LEGR I+V++AE
Subjt: ESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALGALNEVELEGRVIRVSLAE
|
|
