| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_008438778.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo] | 4.6e-119 | 93.95 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSP RSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
R+DYSRSP+PK+NGRSPR+VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| XP_022137875.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Momordica charantia] | 5.4e-120 | 95.56 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDD+PRDRY ESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSP RSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSPSPKENGRSPR+VDI RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 9.3e-120 | 95.16 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSP RSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| XP_023527505.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.7e-119 | 94.76 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSP RSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRSPRA SRSPSGSRSRS+SP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida] | 9.3e-120 | 94.76 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M RYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKR+DD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSP RSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGAR+EYLSPARSRSISRSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSP+PKENGRSPR+VD ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.2e-119 | 93.95 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSP RSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
R+DYSRSP+PK+NGRSPR+VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.2e-118 | 94.29 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSP RSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSY
R+DYSRSP+PK+NGRSPR+VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSY
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.6e-120 | 95.56 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDD+PRDRY ESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSP RSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSPSPKENGRSPR+VDI RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 3.8e-119 | 94.35 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MA+YRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSP RSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSP+PKENGRSPR VD ARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.5e-120 | 95.16 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDD+PRDRYRESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSP RSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
RRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRSPRA SRSPSGSRSRSYSP+
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.7e-63 | 63.97 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR+ R++ Y RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
Query: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
PR+ R+Y N RSPR+ + + RS R +SRS S S SR
Subjt: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.2e-22 | 43.63 | Show/hide |
Query: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRS------S
+ L V NL P+ LR FE++G V DVY+P++ YT E RGF FV+F DA +A ++ V+ GRE+R+ A R P + + R
Subjt: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRS------S
Query: GRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRDRRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
G Y RRS RSPRRR RS SRS S +R SR+R +R + S RSRS S S+S RR S+S S + R +RSRSRSP VS+ S SRSR
Subjt: GRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRDRRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
Query: SYSP
S SP
Subjt: SYSP
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 8.1e-34 | 46.09 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
YSP RR RGR PR Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F A DA EA++
Subjt: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
Query: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS------------RSSGRSYRRR-SPGRSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRS
+N GREI +V A E+RK P+EMRV + RS GRS R S RSPRR RYRS S SP+P R RG DE S
Subjt: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS------------RSSGRSYRRR-SPGRSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRS
Query: ISRSRSPRDRRDYSRSPSPKENGRS---PRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRS
RS SP + +P NG + + A R R RAVSRSPSGSRSRS
Subjt: ISRSRSPRDRRDYSRSPSPKENGRS---PRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRS
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 1.3e-39 | 50.6 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P SPPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRDRR--
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R R+R Y SP R SRS SP+DRR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRDRR--
Query: -DYSRSPSPKENGRSPRDVDIAR--SRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
+ S S SP NG R R S SRSPR RS S ++RSY+P+
Subjt: -DYSRSPSPKENGRSPRDVDIAR--SRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.9e-38 | 50.19 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD-----R
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RR R+P RY S SRSP P R SR+R +Y SP R RS SPR+ R
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD-----R
Query: RDYSRSP-SPKENGRSPRDV---------DIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
R YSRSP S GRS V RS SRSPR SRSPS R+RS SP+
Subjt: RDYSRSP-SPKENGRSPRDV---------DIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.3e-39 | 50.19 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD-----R
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RR R+P RY S SRSP P R SR+R +Y SP R RS SPR+ R
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD-----R
Query: RDYSRSP-SPKENGRSPRDV---------DIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
R YSRSP S GRS V RS SRSPR SRSPS R+RS SP+
Subjt: RDYSRSP-SPKENGRSPRDV---------DIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 6.1e-37 | 49.56 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD-----R
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RR R+P RY S SRSP P R SR+R +Y SP R RS SPR+ R
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRD-----R
Query: RDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRS
R YSRSP+ +G R + R +SRS
Subjt: RDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 8.0e-37 | 47.21 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRGFG
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
Query: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISR
FV+F DAA+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R G +R R R RY S SRSP P R SR+R +Y SP R R
Subjt: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISR
Query: SRSPRD-----RRDYSRSP-SPKENGRSPRDV---------DIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
S SPR+ RR YSRSP S GRS V RS SRSPR SRSPS R+RS SP+
Subjt: SRSPRD-----RRDYSRSP-SPKENGRSPRDV---------DIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 9.1e-41 | 50.6 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P SPPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRDRR--
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R R+R Y SP R SRS SP+DRR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPRDRR--
Query: -DYSRSPSPKENGRSPRDVDIAR--SRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
+ S S SP NG R R S SRSPR RS S ++RSY+P+
Subjt: -DYSRSPSPKENGRSPRDVDIAR--SRSRSPRAVSRSPSGSRSRSYSPQ
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 1.2e-64 | 63.97 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDEPRDRYRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR+ R++ Y RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPGRSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
Query: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
PR+ R+Y N RSPR+ + + RS R +SRS S S SR
Subjt: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPRDVDIARSRSRSPRAVSRSPSGSRSR
|
|
