; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0021441 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0021441
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionleucine-rich repeat extensin-like protein 3
Genome locationchr7:7771531..7772043
RNA-Seq ExpressionLag0021441
SyntenyLag0021441
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049526.1 Nutrient reservoir [Cucumis melo var. makuwa]9.9e-6782.95Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYS-PPPPAQPTYT
        ME  ISL+  ISLT  LLL     SSLPV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SG Y YYS PPPPAQPTYT
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYS-PPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        YSSPPPPRGII  GG+YQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA GRLT+    SVLTVALFSFLL L
Subjt:  YSSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

KGN57146.1 hypothetical protein Csa_010613 [Cucumis sativus]9.6e-7084.57Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        MET I L+F ISLTA LLLFP+ +SSLPV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG Y YYSPPPPAQP+YTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        SSPPPP GII  GG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAA  RLT+    SVLTVALFSFLLAL
Subjt:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

XP_022137790.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Momordica charantia]2.2e-6681.25Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L A LL+FPA L SLP   RRTSAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG YYYYSPPPPAQPT
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        YTYSSPPPPRGIIGG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA  LT+    SV T  LF+ LLAL
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

XP_022955565.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita moschata]1.3e-6683.43Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFFISLTA LL FPA  SSLP   RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

XP_038906774.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Benincasa hispida]2.1e-6985.63Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISL+FFISLTA LLLFPA  SSLPV  RR SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPP    PPPPVNCPPPPSPPSSG YYYYSPPPP QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGII-GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        SSPPPPRGI  GG+YQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA G LT+    SVLTVALFSFLL L
Subjt:  SSPPPPRGII-GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAN7 Nutrient reservoir4.6e-7084.57Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        MET I L+F ISLTA LLLFP+ +SSLPV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG Y YYSPPPPAQP+YTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        SSPPPP GII  GG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAA  RLT+    SVLTVALFSFLLAL
Subjt:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

A0A5A7U5R9 Nutrient reservoir4.8e-6782.95Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYS-PPPPAQPTYT
        ME  ISL+  ISLT  LLL     SSLPV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SG Y YYS PPPPAQPTYT
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYS-PPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        YSSPPPPRGII  GG+YQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA GRLT+    SVLTVALFSFLL L
Subjt:  YSSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

A0A6J1C7N8 leucine-rich repeat extensin-like protein 31.1e-6681.25Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L A LL+FPA L SLP   RRTSAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG YYYYSPPPPAQPT
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        YTYSSPPPPRGIIGG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA  LT+    SV T  LF+ LLAL
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

A0A6J1GVF6 leucine-rich repeat extensin-like protein 66.3e-6783.43Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFFISLTA LL FPA  SSLP   RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

A0A6J1IXZ9 leucine-rich repeat extensin-like protein 62.0e-6582.29Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFFISLTA LL F A  SSLP   RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP ++CPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFSFLLAL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P06599 Extensin6.6e-0543.14Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQ------PTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPP--NPIVPYFPFYYHTPPPGSSA
        Y SPPPP  SPPPP + PPPP       Y+Y SPPPP        P Y Y SPPPP       + PPP  ++ +PPPP  +P  P   + Y +PPP   +
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQ------PTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPP--NPIVPYFPFYYHTPPPGSSA

Query:  AA
         A
Subjt:  AA

Q9LUI1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 69.2e-0744.86Show/hide
Query:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF
        + Y I+C     C  P     SPPPPPP PPPP   PPPP PP         PPPP  P Y Y SPPPP      +  PPP   Y  PPPP+P     P+
Subjt:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF

Query:  YYHTPPP
         Y  PPP
Subjt:  YYHTPPP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 33.9e-0550Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA
        Y  PPPPPP PPPPV  PPPP PP       YSPPPP+ P      PPPP       Y PPP    P PPPP P+   P  P Y   PPP S A
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G06750.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein6.7e-2149.07Show/hide
Query:  FISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGI
        F +L+  L+L    L SLP++           + CTMCS+CDNPC    +P P   SPP     PPPPS    G  YYYSPPPP+        PP     
Subjt:  FISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGI

Query:  IGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFSFLLALV
         GG+Y PP Y NY  PPPPNPIVPYFPFYYHTPP G S +A RL +S+L  ALF+ LL  V
Subjt:  IGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFSFLLALV

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein6.5e-0844.86Show/hide
Query:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF
        + Y I+C     C  P     SPPPPPP PPPP   PPPP PP         PPPP  P Y Y SPPPP      +  PPP   Y  PPPP+P     P+
Subjt:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF

Query:  YYHTPPP
         Y  PPP
Subjt:  YYHTPPP

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein2.7e-0650Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA
        Y  PPPPPP PPPPV  PPPP PP       YSPPPP+ P      PPPP       Y PPP    P PPPP P+   P  P Y   PPP S A
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA

AT4G16140.1 proline-rich family protein1.9e-2354.48Show/hide
Query:  ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS--NYPAPPPPNPIVPY
        +CTMC++CDNPC    SPPPPP  PSPPPP      CPPPPS    G YYYY   PPA  + +Y   PPP    GG+Y PPP S  NYP  PPPNPIVPY
Subjt:  ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS--NYPAPPPPNPIVPY

Query:  FPFYYHTPPPGS----SAAAGRLTSSVLTVALFS
        FPFYY+ PPP S    S A  R +  V  + +FS
Subjt:  FPFYYHTPPPGS----SAAAGRLTSSVLTVALFS

AT5G49280.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein1.6e-2758.96Show/hide
Query:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS-NYPAPPPPNPIVPYFP
        + CTMCS+CDNPC    S  PPPPSPPPP      CPPPPSPPSSG    Y  PPP+Q       PPP  G   G+Y PPPYS NYP PPPPNPIVPYFP
Subjt:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS-NYPAPPPPNPIVPYFP

Query:  FYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFSFLLALV
        FYYHTPPPGS +     + S++  ALF+  L LV
Subjt:  FYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFSFLLALV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTGCCATTTCTCTGAAATTTTTCATCTCACTCACGGCGGCTCTCCTCCTTTTCCCGGCCGCATTATCGTCCCTTCCGGTCATCCACCGCCGCACCTCAGCCGG
CGCCAAGTACCAAATCGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGCGACAATCCCTGCGGTCAGTATCTCTCTCCGCCGCCGCCTCCGCCATCCCCTCCTCCGCCCGTCAACTGCC
CGCCGCCGCCTTCTCCTCCCAGCTCCGGTAACTACTACTATTACTCTCCTCCACCGCCCGCTCAACCCACCTACACATACTCCTCCCCGCCGCCGCCGCGTGGTATCATC
GGCGGATTCTACCAGCCGCCGCCGTACAGTAATTACCCAGCACCGCCGCCGCCGAACCCGATTGTGCCGTATTTCCCGTTTTACTACCACACCCCACCGCCGGGATCCTC
CGCCGCCGCCGGCCGCCTCACGAGCTCTGTTCTTACCGTTGCTCTGTTTTCCTTTTTACTTGCTTTGGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACTGCCATTTCTCTGAAATTTTTCATCTCACTCACGGCGGCTCTCCTCCTTTTCCCGGCCGCATTATCGTCCCTTCCGGTCATCCACCGCCGCACCTCAGCCGG
CGCCAAGTACCAAATCGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGCGACAATCCCTGCGGTCAGTATCTCTCTCCGCCGCCGCCTCCGCCATCCCCTCCTCCGCCCGTCAACTGCC
CGCCGCCGCCTTCTCCTCCCAGCTCCGGTAACTACTACTATTACTCTCCTCCACCGCCCGCTCAACCCACCTACACATACTCCTCCCCGCCGCCGCCGCGTGGTATCATC
GGCGGATTCTACCAGCCGCCGCCGTACAGTAATTACCCAGCACCGCCGCCGCCGAACCCGATTGTGCCGTATTTCCCGTTTTACTACCACACCCCACCGCCGGGATCCTC
CGCCGCCGCCGGCCGCCTCACGAGCTCTGTTCTTACCGTTGCTCTGTTTTCCTTTTTACTTGCTTTGGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METAISLKFFISLTAALLLFPAALSSLPVIHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGII
GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFSFLLALV