; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0021625 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0021625
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr7:10177528..10182559
RNA-Seq ExpressionLag0021625
SyntenyLag0021625
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027806 - Harbinger transposase-derived nuclease domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035620.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.8e-13170.66Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RW+WF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

KAA0046727.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-13170.98Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLHD LLKKP+PV   CTD RW+WF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

KAA0048361.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.2e-13070.35Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RWKWF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEG AADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGY NAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

KAA0051057.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-13070.03Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+ HDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RW+WF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHS ARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

KAA0065286.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-12869.72Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RW+ F+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+ YHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSA NVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD+LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TXW1 Retrotransposon protein6.3e-13270.98Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLHD LLKKP+PV   CTD RW+WF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

A0A5A7U476 Retrotransposon protein3.5e-13070.35Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RWKWF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEG AADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGY NAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

A0A5A7U9H2 Retrotransposon protein2.0e-13070.03Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+ HDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RW+WF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHS ARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

A0A5A7VG29 Retrotransposon protein1.1e-12869.72Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RW+ F+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+ YHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSA NVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD+LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

A0A5D3BDX0 Retrotransposon protein1.8e-13170.66Show/hide
Query:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG
        C+ ++  L  T+AGL++TEVVDVEEMVAMFLHI+AHDVKN+V++ +F RS ET+SRHFN +L AV+RLH+ LLKKP+PV   CTD RW+WF+NCLGALDG
Subjt:  CYRVV-KLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDG

Query:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA
        TYIKVNV   DR RYRTRKGE+ATN+L VCDTKGDF +VL GWEGSAADSR+LRDA+S+  R      YYYL +AGYPNAEGFLAPYRG+RYHL EWRG 
Subjt:  TYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGA

Query:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR
         NAP++ KEFFNMKHSSARNVIERAFG+LKGRWAILRGKSYYPV +Q RTI  CCLLHNLINREM + +I D +DEVDS   TT  ++I++IETS+EW +
Subjt:  GNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRR

Query:  WRDELAIQMFSNWELRN
        WRD LA +MF+ WELRN
Subjt:  WRDELAIQMFSNWELRN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43722.1 unknown protein2.6e-2934.63Show/hide
Query:  LSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPE-------PVTASCTDPRWKWFQNCLGALDGTYIKVNV
        L  T  + +EE VAMFL I  H+   + V  +F R+ ETV R F  +L A   L    ++ P        P         W +F   +GA+DGT++ V V
Subjt:  LSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPE-------PVTASCTDPRWKWFQNCLGALDGTYIKVNV

Query:  SVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR----THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGE-----RYHLSEWRGAG
            +  Y  R    + N++A+CD K  FT++  G  GS  D+ VL+ A              YYL ++GYPN +G LAPYR       RYH+S++   G
Subjt:  SVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR----THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGE-----RYHLSEWRGAG

Query:  NAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGR
          P +  E FN  H+S R+VIER F + K +
Subjt:  NAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGR

AT5G28730.1 unknown protein1.2e-1331.35Show/hide
Query:  GLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRL--HDVLLKKPEPVTASCT----DPR-WKWFQNCLGALDGTYIKVN
        GL ++  + ++E VA+FL I A +   + +  +F  + ET+ R F+ +L A+ RL    +  +K E + A       D R W +  + LG          
Subjt:  GLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRL--HDVLLKKPEPVTASCT----DPR-WKWFQNCLGALDGTYIKVN

Query:  VSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKRTH----SYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGE
                        + N+LA+CD    FT+   G  GS  D+RVL  AIS     H    S YYL ++GY N  G+LAPYR E
Subjt:  VSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKRTH----SYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGE

AT5G28950.1 unknown protein1.3e-1548.61Show/hide
Query:  WKWFQNCLGALDGTYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISK
        + +F++C+GA+D T+I   VS    P +R RKG+I+ NMLA C+   +F +VL GWEGSA DS+VL DA+++
Subjt:  WKWFQNCLGALDGTYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISK

AT5G35695.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)2.6e-2940.99Show/hide
Query:  FTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKRTHSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGAGNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRG
        F +VL GWEGSA DSRVL DA+ K       +YL + G+ N   FLAP+RG RYHL E+ G    P +P E FN++H S RNVIER FG+ K R+AI + 
Subjt:  FTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKRTHSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGAGNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRG

Query:  KSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINRE--MGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDE
           +  + Q   + TC  LHN + +E    + + PDE+   +   +  +G  +N  E  +E
Subjt:  KSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINRE--MGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDE

AT5G41980.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative harbinger transposase-derived nuclease (InterPro:IPR006912)3.6e-3930.06Show/hide
Query:  YRVVKLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRL-HDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDGT
        Y++  L  T   L +T  + +E  +A+FL I+ H+++ + V+  F  S ET+SRHFN +L+AV+ +  D         T    DP   +F++C+G +D  
Subjt:  YRVVKLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRL-HDVLLKKPEPVTASCTDPRWKWFQNCLGALDGT

Query:  YIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGAG
        +I V V V ++  +R   G +  N+LA       F +VL GWEGSA+D +VL  A+++  +       YY+ +  YPN  GF+APY G          + 
Subjt:  YIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKR---THSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEWRGAG

Query:  NAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGD----REIPDE--LDEVDSASITTDGENINFI---
        N+    KE FN +H      I R FG LK R+ IL     YP++ Q + +   C LHN +  E  D    R   +E   +  +   +  + E +  +   
Subjt:  NAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGD----REIPDE--LDEVDSASITTDGENINFI---

Query:  -----ETSDEWRRWRDELAIQMFSNW
             E  ++  R RDE+A ++++++
Subjt:  -----ETSDEWRRWRDELAIQMFSNW


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGTTCGATTTTCGGTTTTCAGATCGGTGTTTTTCACCAGATCTGAAACCCTCTTTTCTTTTATTCTCCCTCACCGCTCCGAAACATTGTTCCTCCTCTTGCGCATT
CCTATTCATCTATTTGATGCTGCATGTTGGATTCGATGGGTTAATTTGCTTGGTAGGGGTTAATGGAGCATGTCGCGAGCCTGGTGGGGGAAGGCAGCCTCATCTCTTCT
TCCCTTCATCTACCTACAAGTGGGTTAGTCTCTTCTCTCTACCTCCCTTTTCCTCAACTACTTCTAAAGATGAGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAAACCTGCAC
ACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAGGAGCAAGAGGAGAGAGTAGAGAATATAGAATAGTGCT
TAGGGATAGAATTCGGAGTCCCCTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGCTCATCCTCCTCGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGA
ATCGAGGCGGCAAAGGCGGTGGGACAACGCATCGAATGGACTCGGCCGCGCGAGCGGCCGAGGCGACCATGTGCTCGCCTCGCCCTGTCGGGCCAAAAACCGACCCCTTC
GATCTTGGCCCGTCCATTTGCCGGTTTTGCCTCCTTGGTCCATCTTTCAGTCCGATTTCTCCCGGTTATCTCGTCAGCTCTTGTTATCGGGTGGTCAAATTGCCTCTAAC
AGTTGCCGGTTTATCCAATACGGAGGTCGTAGATGTAGAAGAGATGGTTGCCATGTTCTTGCACATTGTAGCCCACGACGTTAAGAACCAAGTAGTTCGTACGCAGTTCG
CTAGGTCTGATGAGACAGTTTCTAGGCATTTCAACACCATCCTTCATGCGGTGTTACGATTGCATGATGTTCTCTTAAAAAAACCTGAGCCAGTCACAGCCTCTTGTACG
GATCCAAGGTGGAAATGGTTTCAGAATTGCCTCGGTGCGTTAGATGGAACATACATCAAGGTGAATGTTTCTGTTGTTGATCGTCCGAGGTATAGAACAAGGAAAGGTGA
AATTGCAACGAACATGCTTGCTGTCTGTGATACAAAAGGAGACTTCACATTCGTCTTACCAGGGTGGGAAGGGTCTGCCGCTGATTCCCGGGTTCTTAGAGATGCAATAT
CAAAGACCAAACGGACTCACAGCTATTATTATCTGTGCAATGCTGGGTACCCTAACGCAGAGGGTTTCCTGGCACCGTATAGAGGGGAACGTTACCACCTCTCTGAATGG
CGTGGTGCAGGGAATGCACCAACTTCTCCAAAAGAATTCTTTAACATGAAGCATTCATCTGCGAGGAACGTGATTGAGAGGGCATTTGGTTTGTTGAAAGGAAGGTGGGC
TATCCTCCGAGGGAAATCGTACTATCCAGTTCGAATTCAAGGGCGGACCATCGCAACATGCTGCTTACTTCACAATCTTATTAATAGAGAGATGGGTGACCGTGAAATTC
CTGATGAGCTGGATGAGGTGGATTCTGCTTCTATTACAACTGATGGTGAGAATATCAATTTCATTGAGACTTCCGACGAATGGAGGCGGTGGAGGGATGAGTTGGCAATA
CAGATGTTTTCGAATTGGGAGTTACGTAATAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGGTTCGATTTTCGGTTTTCAGATCGGTGTTTTTCACCAGATCTGAAACCCTCTTTTCTTTTATTCTCCCTCACCGCTCCGAAACATTGTTCCTCCTCTTGCGCATT
CCTATTCATCTATTTGATGCTGCATGTTGGATTCGATGGGTTAATTTGCTTGGTAGGGGTTAATGGAGCATGTCGCGAGCCTGGTGGGGGAAGGCAGCCTCATCTCTTCT
TCCCTTCATCTACCTACAAGTGGGTTAGTCTCTTCTCTCTACCTCCCTTTTCCTCAACTACTTCTAAAGATGAGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAGACAGTAAACCTGCAC
ACCGGTGTGGTGCTCGCCACACCGGCTCCGATGCTTAAGTCAGCAAACAGAACGGTAGGGAGTGGAAAAGTAGGAGCAAGAGGAGAGAGTAGAGAATATAGAATAGTGCT
TAGGGATAGAATTCGGAGTCCCCTCTTCAGTGGCGAAGAGGGATATAAATACCTGCTCATCCTCCTCGGGTTTTTAGGGATTCGGAGGCGTTTTAGGTCAAACCAGGCGA
ATCGAGGCGGCAAAGGCGGTGGGACAACGCATCGAATGGACTCGGCCGCGCGAGCGGCCGAGGCGACCATGTGCTCGCCTCGCCCTGTCGGGCCAAAAACCGACCCCTTC
GATCTTGGCCCGTCCATTTGCCGGTTTTGCCTCCTTGGTCCATCTTTCAGTCCGATTTCTCCCGGTTATCTCGTCAGCTCTTGTTATCGGGTGGTCAAATTGCCTCTAAC
AGTTGCCGGTTTATCCAATACGGAGGTCGTAGATGTAGAAGAGATGGTTGCCATGTTCTTGCACATTGTAGCCCACGACGTTAAGAACCAAGTAGTTCGTACGCAGTTCG
CTAGGTCTGATGAGACAGTTTCTAGGCATTTCAACACCATCCTTCATGCGGTGTTACGATTGCATGATGTTCTCTTAAAAAAACCTGAGCCAGTCACAGCCTCTTGTACG
GATCCAAGGTGGAAATGGTTTCAGAATTGCCTCGGTGCGTTAGATGGAACATACATCAAGGTGAATGTTTCTGTTGTTGATCGTCCGAGGTATAGAACAAGGAAAGGTGA
AATTGCAACGAACATGCTTGCTGTCTGTGATACAAAAGGAGACTTCACATTCGTCTTACCAGGGTGGGAAGGGTCTGCCGCTGATTCCCGGGTTCTTAGAGATGCAATAT
CAAAGACCAAACGGACTCACAGCTATTATTATCTGTGCAATGCTGGGTACCCTAACGCAGAGGGTTTCCTGGCACCGTATAGAGGGGAACGTTACCACCTCTCTGAATGG
CGTGGTGCAGGGAATGCACCAACTTCTCCAAAAGAATTCTTTAACATGAAGCATTCATCTGCGAGGAACGTGATTGAGAGGGCATTTGGTTTGTTGAAAGGAAGGTGGGC
TATCCTCCGAGGGAAATCGTACTATCCAGTTCGAATTCAAGGGCGGACCATCGCAACATGCTGCTTACTTCACAATCTTATTAATAGAGAGATGGGTGACCGTGAAATTC
CTGATGAGCTGGATGAGGTGGATTCTGCTTCTATTACAACTGATGGTGAGAATATCAATTTCATTGAGACTTCCGACGAATGGAGGCGGTGGAGGGATGAGTTGGCAATA
CAGATGTTTTCGAATTGGGAGTTACGTAATAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWFDFRFSDRCFSPDLKPSFLLFSLTAPKHCSSSCAFLFIYLMLHVGFDGLICLVGVNGACREPGGGRQPHLFFPSSTYKWVSLFSLPPFSSTTSKDEGEDVACKTVNLH
TGVVLATPAPMLKSANRTVGSGKVGARGESREYRIVLRDRIRSPLFSGEEGYKYLLILLGFLGIRRRFRSNQANRGGKGGGTTHRMDSAARAAEATMCSPRPVGPKTDPF
DLGPSICRFCLLGPSFSPISPGYLVSSCYRVVKLPLTVAGLSNTEVVDVEEMVAMFLHIVAHDVKNQVVRTQFARSDETVSRHFNTILHAVLRLHDVLLKKPEPVTASCT
DPRWKWFQNCLGALDGTYIKVNVSVVDRPRYRTRKGEIATNMLAVCDTKGDFTFVLPGWEGSAADSRVLRDAISKTKRTHSYYYLCNAGYPNAEGFLAPYRGERYHLSEW
RGAGNAPTSPKEFFNMKHSSARNVIERAFGLLKGRWAILRGKSYYPVRIQGRTIATCCLLHNLINREMGDREIPDELDEVDSASITTDGENINFIETSDEWRRWRDELAI
QMFSNWELRNS