CuGenDBv2

Gene ID	Lag0021694
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr7:10841669..10842763
RNA-Seq Expression	Lag0021694
Synteny	Lag0021694
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6597642.1 hypothetical protein SDJN03_10822, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.9e-118

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XP_022972101.1 uncharacterized protein LOC111470737 isoform X1 [Cucurbita maxima]

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XP_022972102.1 uncharacterized protein LOC111470737 isoform X2 [Cucurbita maxima]

1.8e-116

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XP_023539149.1 uncharacterized protein LOC111799886 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.3e-116

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XP_038885186.1 uncharacterized protein LOC120075661 [Benincasa hispida]

2.9e-122

80.13

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TrEMBL top hits

e value

%identity

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A0A6J1EWV7 uncharacterized protein LOC111439130 isoform X2

7.4e-116

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A0A6J1F2A1 uncharacterized protein LOC111439130 isoform X3

7.4e-116

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A0A6J1F2P4 uncharacterized protein LOC111439130 isoform X1

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A0A6J1I3V3 uncharacterized protein LOC111470737 isoform X2

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A0A6J1I516 uncharacterized protein LOC111470737 isoform X1

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G43235.1 unknown protein

3.0e-32

35.82

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        P   F+T    +PR R  RK+  + +  T   L      S S   D  L   +++ +++  A+            +F+ FL S  DAF DL+TLI+ DD 
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Query:  NRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVRAIIGIGSRFRNKFGSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTERSVVTRDKAMAKKSNLFGLLDSPLSTAPRTS
        NR + VSC++ST++FVG +V+L FV  F +R ++ +GS  +  F S     VVRRDRSLGG+EVVV  +     R  +   KS +     S  ++ PR  
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          +           LPKWWP ++  ++ D  ++++YQ EANR+VRA+VDNR SG+D  +DDI+ +  V
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGACACCGCACCCACTCTCTGCCACTTTCCTCCATATCCATTCACTCCCCATCGCCATAACCACCACCTCCTCTACCGCCTCTCCTCGCCGGAGCCTCGACAACGCTT
CACCACTCTCTCCTGCTTCAAACCACGCCGTCGAACTCGCCGCAAAAACAAGCTCGCCAAGTTCCGCACCACCCACTCGCCCCTCGATTCTTCCTCCTCTTTCTCGGACT
CCAAGCTCCAAACTGTGATTGAACTCGACCAATTAACCGCCGAAGCCTCCTCTCTCTTCTACTCCGTCTACTACTCCTCCCGTTCCCAATTTCGCCAGTTTCTGTCCTCG
GGATTGGACGCTTTCGATGACTTGCGGACGTTGATTGCCTTCGATGACCAGAATCGCACACTGACCGTCTCGTGTCGGCGTTCCACTGTGGAATTCGTTGGTCAGTTGGT
CCTCCTGAGCTTCGTTGTGGTCTTTGTAGTTAGGGCTATAATTGGGATTGGATCTCGTTTTCGCAATAAATTTGGTTCCGGGTATACTGCTCCTGTGGTGAGAAGGGACC
GGAGTCTCGGTGGACGAGAGGTTGTTGTTGGGACGGAGAGGAGTGTTGTAACGCGAGATAAGGCTATGGCGAAGAAGAGCAATCTTTTTGGGTTATTGGATAGTCCTCTG
TCCACGGCTCCAAGGACTTCAACTGATGAAGTTTCGAAGACTTGGGCTTGGGGTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTTCCCAGACGGACTGACACAGC
GAATAGGCAGGAATATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTACGAGCCCTCGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGATGATATTCTTGATGTGAGTGCCG
TTCTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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GLDAFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFVGQLVLLSFVVVFVVRAIIGIGSRFRNKFGSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTERSVVTRDKAMAKKSNLFGLLDSPL
STAPRTSTDEVSKTWAWGGERLPKWWPPAVPRRTDTANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDILDVSAVL

Lag0021694 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome