; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0021753 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0021753
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionActin-related protein 2/3 complex subunit 5
Genome locationchr7:11480961..11483150
RNA-Seq ExpressionLag0021753
SyntenyLag0021753
Gene Ontology termsGO:0030833 - regulation of actin filament polymerization (biological process)
GO:0034314 - Arp2/3 complex-mediated actin nucleation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005885 - Arp2/3 protein complex (cellular component)
GO:0051015 - actin filament binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006789 - Actin-related protein 2/3 complex subunit 5
IPR036743 - Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056599.1 actin-related protein 2/3 complex subunit 5A [Cucumis melo var. makuwa]5.0e-4197.8Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
XP_008441367.1 PREDICTED: actin-related protein 2/3 complex subunit 5A [Cucumis melo]5.0e-4197.8Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
XP_010089302.1 actin-related protein 2/3 complex subunit 5A [Morus notabilis]1.5e-4096.7Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MA TD FVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
XP_038683274.1 actin-related protein 2/3 complex subunit 5A [Tripterygium wilfordii]5.6e-4093.41Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT+EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRA+MAIKDVD +FS+LDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
XP_038884940.1 actin-related protein 2/3 complex subunit 5A [Benincasa hispida]6.6e-4196.7Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQS+P+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KD59 Actin-related protein 2/3 complex subunit 52.7e-4095.6Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT +FVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQ KP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
A0A1S3B407 Actin-related protein 2/3 complex subunit 52.4e-4197.8Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
A0A5A7USU9 Actin-related protein 2/3 complex subunit 52.4e-4197.8Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
A0A7J7CD05 Actin-related protein 2/3 complex subunit 52.7e-4093.41Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MATT+EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRA+MAIKDVD +FS+LDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
W9R3V7 Actin-related protein 2/3 complex subunit 57.1e-4196.7Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MA TD FVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKP+EALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3H6Y2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5B4.9e-3174.73Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MA    FVEADNAE I+ RIE KS+KIESLLK  K +EALKTAL+GSPP T DERCKSANWIVVHRA+MAIKD++GM +SL  EYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Q9M117 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5A1.9e-3587.21Show/hide
Query:  EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        EFVEADNAEAII RIE KSRKIESLLKQ K +EALKTALEGSPP TRDERCKSANWIVVHRALMAIKD+DGM ++LD EYYDILMK
Subjt:  EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G01710.1 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)1.4e-3687.21Show/hide
Query:  EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        EFVEADNAEAII RIE KSRKIESLLKQ K +EALKTALEGSPP TRDERCKSANWIVVHRALMAIKD+DGM ++LD EYYDILMK
Subjt:  EFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
AT5G65274.1 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)3.5e-3274.73Show/hide
Query:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK
        MA    FVEADNAE I+ RIE KS+KIESLLK  K +EALKTAL+GSPP T DERCKSANWIVVHRA+MAIKD++GM +SL  EYYDILMK
Subjt:  MATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMK

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAAATGGCGACTACCGATGAATTTGTGGAAGCAGATAATGCAGAAGCCATAATCACCAGAATTGAGCACAAATCTCGAAAGATCGAGAGCTTACTTAAACAGTC
TAAACCAATCGAAGCTCTTAAAACTGCTCTTGAAGGTTCCCCTCCAAATACCCGAGATGAGCGTTGCAAGTCAGCAAATTGGATTGTGGTGCATAGGGCTCTCATGGCTA
TAAAGGATGTAGATGGGATGTTTTCTTCCTTGGATCCGGAGTACTATGATATTCTAATGAAGGGAGGATTAGGGTTTCAAGCTTGGACTTTTATCTTGGGTACTAATACC
ACCATGGAGAAGCTCTCACATGATCCAGGAGAGTGGGGAAACTTTGTGGGAGTCATTGAGACATTTCATAGTGAAAGTTCTGGACCTATCGTTGCACTAAGACCAGAAAC
CATCCCCATTTTCCGAAGAGAAACCATTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAAATGGCGACTACCGATGAATTTGTGGAAGCAGATAATGCAGAAGCCATAATCACCAGAATTGAGCACAAATCTCGAAAGATCGAGAGCTTACTTAAACAGTC
TAAACCAATCGAAGCTCTTAAAACTGCTCTTGAAGGTTCCCCTCCAAATACCCGAGATGAGCGTTGCAAGTCAGCAAATTGGATTGTGGTGCATAGGGCTCTCATGGCTA
TAAAGGATGTAGATGGGATGTTTTCTTCCTTGGATCCGGAGTACTATGATATTCTAATGAAGGGAGGATTAGGGTTTCAAGCTTGGACTTTTATCTTGGGTACTAATACC
ACCATGGAGAAGCTCTCACATGATCCAGGAGAGTGGGGAAACTTTGTGGGAGTCATTGAGACATTTCATAGTGAAAGTTCTGGACCTATCGTTGCACTAAGACCAGAAAC
CATCCCCATTTTCCGAAGAGAAACCATTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKMATTDEFVEADNAEAIITRIEHKSRKIESLLKQSKPIEALKTALEGSPPNTRDERCKSANWIVVHRALMAIKDVDGMFSSLDPEYYDILMKGGLGFQAWTFILGTNT
TMEKLSHDPGEWGNFVGVIETFHSESSGPIVALRPETIPIFRRETI