; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0022327 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0022327
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionrhomboid-like protein 20
Genome locationchr7:24801050..24826107
RNA-Seq ExpressionLag0022327
SyntenyLag0022327
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141121.1 rhomboid-like protein 20 [Cucumis sativus]2.5e-15095.53Show/hide
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XP_023516629.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-14994.5Show/hide
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XP_038904170.1 rhomboid-like protein 20 isoform X1 [Benincasa hispida]1.3e-15196.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG81 UBA domain-containing protein1.2e-15095.53Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 206.3e-15295.88Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 206.3e-15295.88Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 204.4e-15396.92Show/hide
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A0A6J1EXA3 rhomboid-like protein 201.7e-14994.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 28.9e-1825.95Show/hide
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        F+ L +  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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        +    P +++ FFS    P  S   P +                                    R  +G M       P    RQ        ++ P  P
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           E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+NVATN LL+
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Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.4e-1825.81Show/hide
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        G +G   AP++++ ++  +  +I   +  +  +   +Y    +K   + W+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L +   S L
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        F++L +   +       N + SG  G +FA FVPF+  IP     +V G    ++K+ +Y+ GLQLL S     IL  + G+++G  Y  ++  + +   
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         P +++  FS    P   +  A P  ++R  M +            + RQ+                      R +P +                  P  
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        TE  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+NVATN LL+
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Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 22.2e-1626.24Show/hide
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        G SG   AP++++ ++  +  ++   +     +    Y    VK   + W+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S + S L
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        F+ L I  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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        +    P +++ FFS    P  S   P +                                    R  +G M       P    RQ        ++ P  P
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           E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+NVATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 181.3e-10969.86Show/hide
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSRFSLPS+ +    P R      P+ +GRQ  R Y   +P+ TEP E++IATLVSMGFD+N+ARQALV ARND+N ATNILLE+ SH
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 206.0e-12375.43Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        ++SFFSR S PS GN PP AP+R++ G +    GR+ ER+ P  +P++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALV ARND+N ATNILLE+QSH
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein9.2e-11169.86Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K R WKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSRFSLPS+ +    P R      P+ +GRQ  R Y   +P+ TEP E++IATLVSMGFD+N+ARQALV ARND+N ATNILLE+ SH
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein4.2e-12475.43Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        ++SFFSR S PS GN PP AP+R++ G +    GR+ ER+ P  +P++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALV ARND+N ATNILLE+QSH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCTGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGCTCAATTAAGCT
TGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGCTTTTGGAAGTTAGTGATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTTT
ACTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAGATAGGTTCCAACAAATATTCGGTCTTTATCTTGTTCTCTATAATAACCTCCTTACTCTTTGAGGTCCTTGCAATATCATTACTT
AAAGATCCTGCAGCGAATCTAGTCACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTATTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTCGATATTCCTGTTTCCACTCGGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCCTCGTGGAGAAGATCCATCTTACCAGGGATTTGCGGCATTCTTGCTGGTTCCT
TATATCGTTTGAATGTGTTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTCATCAGTTCATTTTTTTCACGATTTTCTTTGCCATCTGTGGGGAATCCTCCAGCTGCCCCA
AATAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCTTTCATGGGCCGCCAGGTTGAGAGAAACTATCCTACCGTGCCAACTGCCACAGAACCACCAGAGGACTCCATTGCCACCCT
TGTTTCAATGGGCTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCCCTTGTGCGGGCGAGAAATGACATTAACGTGGCAACGAACATCCTTCTCGAATCACAATCGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCTGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGCTCAATTAAGCT
TGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGCTTTTGGAAGTTAGTGATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTTT
ACTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAGATAGGTTCCAACAAATATTCGGTCTTTATCTTGTTCTCTATAATAACCTCCTTACTCTTTGAGGTCCTTGCAATATCATTACTT
AAAGATCCTGCAGCGAATCTAGTCACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTATTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTCGATATTCCTGTTTCCACTCGGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCCTCGTGGAGAAGATCCATCTTACCAGGGATTTGCGGCATTCTTGCTGGTTCCT
TATATCGTTTGAATGTGTTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTCATCAGTTCATTTTTTTCACGATTTTCTTTGCCATCTGTGGGGAATCCTCCAGCTGCCCCA
AATAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCTTTCATGGGCCGCCAGGTTGAGAGAAACTATCCTACCGTGCCAACTGCCACAGAACCACCAGAGGACTCCATTGCCACCCT
TGTTTCAATGGGCTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCCCTTGTGCGGGCGAGAAATGACATTAACGTGGCAACGAACATCCTTCTCGAATCACAATCGCACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGGPSGFNNAPVTRTFIIASALFTIFFGIQGRSIKLGLSYQDVIVKLRFWKLVMSVFAFSSTPELMFGLFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIITSLLFEVLAISLL
KDPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFISSFFSRFSLPSVGNPPAAP
NRDVRGNMPSFMGRQVERNYPTVPTATEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVRARNDINVATNILLESQSH