; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0022449 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0022449
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr7:29336022..29340979
RNA-Seq ExpressionLag0022449
SyntenyLag0022449
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EPR63240.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii GT1]2.8e-0551.65Show/hide
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KAF4638977.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii]2.8e-0551.65Show/hide
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KAF6734224.1 hypothetical protein FQA47_013229 [Oryzias melastigma]3.9e-0728.52Show/hide
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        + ++ NKPTD+   Q +RP    N+   R  K +  ++ T   ++Q +RP  Q+       ++++ TN Q N+L  Q+ NKPT+ ++ + T+QQ    ++
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        QQ N+P  +  NRP    + Q N P +        ++++ N+P+ + +  R T+QQ D P + T       ++  KP +R + +  KPT R + R ++QQ
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        TD P   T+QQ + P    ++Q + P+++  Q      + +KPT R +++  K+ +
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XP_018635152.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii ME49]3.3e-0652.75Show/hide
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XP_043123828.1 uncharacterized protein Aspvir_004669 [Aspergillus viridinutans]4.8e-0541.96Show/hide
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        SS +PS     S  PSPSS A+ S+ P PSS  ++S TPSPSS A  S++P PSS  ++S TPSPSS A+ S+ P+PSS  ++      S+P+   +P+ 
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         S      +P++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A086LPQ4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.1e-0450.55Show/hide
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A0A425HVQ0 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.4e-0551.65Show/hide
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A0A7J6JVT9 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.4e-0551.65Show/hide
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S7UZX5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.4e-0551.65Show/hide
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S8G1F0 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.6e-0652.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTGCAATTCCTTCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCACTTCGCTACAGTTCCTTCCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTG
CAATTTCTTCTCCCTAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGATGCAGTTCCTTCCTCCCAAATTCGAAGGTTCTCACTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAATTCGA
AGGTTTCGAAGGTTCTCAAGCGCTGTGATTCGTTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACG
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TCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCTTTT
TGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACGTCCTCGTTCCGCTTCATCTTCAAATGT
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AGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGGTGGTGAAATCACTGCAAGTGAAAGCTGATGACGACCGTGGTGGTGAAATCACTGCAAGTGAAAAGCTGATGACGACCGTGGT
GACCACCCCTACAGGAAACTACAGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGACAGGTGGTGAAATCACTGCAAGTGAAAAGCTGGTGACGACCGTGGTGACCACCCCTGCAG
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ACCATGGTGACCACCCCTGCAGGAAACTACAGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGATCAACAAGTCAGTAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACCGATCG
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CAGCAGACCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGTCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAGGCCAACAGGCCGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCTCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTACTTCGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RFSRASLCNSFPQVRRFSRTSLQFLPPKFEGSHALRCNFFSLSSKVLTRFDAVPSSQIRRFSLASLQFLPPNSKVSKVLKRCDSLQFLPPSSKVLMRFVAPSSKFEGSLT
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TMVTTPAGNYSHQSDWSRQINKSVGRSSKKINKPTDRTDHQANRPIKKINKSVGRSSKKRLASQLTDQEDQQVSRPIIQEEISKPTDRSRRSTNHQANRLIQEINKPTDR
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