; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0023064 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0023064
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionE3 SUMO-protein ligase SIZ1
Genome locationchr7:43643465..43655864
RNA-Seq ExpressionLag0023064
SyntenyLag0023064
Gene Ontology termsGO:0016925 - protein sumoylation (biological process)
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InterPro domainsIPR001965 - Zinc finger, PHD-type
IPR003034 - SAP domain
IPR011011 - Zinc finger, FYVE/PHD-type
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IPR019786 - Zinc finger, PHD-type, conserved site
IPR031141 - E3 SUMO-protein ligase SIZ1, plant
IPR036361 - SAP domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583498.1 E3 SUMO-protein ligase SIZ1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.4e-21590.95Show/hide
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A0A6J1I0I8 E3 SUMO-protein ligase SIZ1-like isoform X11.2e-20294.84Show/hide
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Q680Q4 E3 SUMO-protein ligase SIZ16.8e-16373.57Show/hide
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Q6ASW7 E3 SUMO-protein ligase SIZ21.2e-11955.53Show/hide
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        + K ++DDS QLD KVRC CG ++  +SMIKCE P+C   QH+ CVI+ EKP +  PP  P HFYC++CR+ RADPFWV+V HP+ PV +  T   + +D
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        G+  +Q  ++TF L+RA+ +++ K EYD+Q WC+L ND VPFRMQWP ++D+QING+ +R +NR  +Q LG NGRDDGP++T + ++G NKI L+  D+R
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        TFCLGVRI KRR+V+Q+L ++PKE DGE F +ALARV RC+GGG  ADNADSDSD+EVVAD   VNLRCP+
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Q6L4L4 E3 SUMO-protein ligase SIZ16.7e-13461.31Show/hide
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        DLV++CKDKLAYFRIKELKDIL QLGL KQGKKQDL++R+LA+L+DEQ  +   W +KN++ K+ VAK+VDDTYRKMQ+  A DLA++   GSD S   +
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        + E  DS Q + KVRC+C + +  +SMI+CED RCQVWQH++CV++P+KP E +   P  FYCE+CRL+RADPFWV+  +PL PVK +  S+ +  DGT+
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          QSV+++FQL+R+D++ + +QEYD+Q WCMLLNDKV FRMQWPQYA+L +NG++VR + RPGSQLLG NGRDDGP+IT  +++G+NKI L+  D RTFC
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         GVRI KRRTV Q+L ++PKE +GE F+ ALARV RC+GGG+TA+NADSDSDLEVVA+   VNLRCP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G60410.1 DNA-binding protein with MIZ/SP-RING zinc finger, PHD-finger and SAP domain4.8e-16473.57Show/hide
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        GE +D  Q + KVRC+CGN+L+T+SMI+CEDPRC VWQH+ CVI+P+KP +GNPP PE FYCEICRL RADPFWV+VAHPL PV+L  T+T IP DG + 
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        GVR+VKRRT+QQ+L +IP+E  GE F+DALARV RCIGGG   DNADSDSD+EVVAD+FGVNLRCP+
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AT5G60410.2 DNA-binding protein with MIZ/SP-RING zinc finger, PHD-finger and SAP domain4.8e-16473.57Show/hide
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AT5G60410.3 DNA-binding protein with MIZ/SP-RING zinc finger, PHD-finger and SAP domain4.8e-16473.57Show/hide
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AT5G60410.5 DNA-binding protein with MIZ/SP-RING zinc finger, PHD-finger and SAP domain4.8e-16473.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTTCTGATGAACAAGTTTCAAAAATGTGGGCAAAGAAAAATGCTGTTGGAAAGGATCAAGTGGCAAAACTAGTTGATGATACATACAGAAAGATGCAGGTTTCTGGGGC
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CCATACCCTGAACACTTCTATTGTGAGATCTGTCGACTCAATCGTGCTGACCCTTTTTGGGTTTCAGTTGCACATCCTCTGTTTCCCGTAAAGCTGATGACCACATCCAC
AAACATCCCAACGGATGGTACAAATCCTATGCAGAGCGTGGATAGAACGTTTCAACTCACAAGGGCAGATAAGGACTTAATTTCTAAACAGGAATACGATGTTCAGGCCT
GGTGTATGCTTTTGAATGATAAGGTTCCATTTAGGATGCAATGGCCTCAGTATGCAGATTTACAAATTAATGGTTTGGCCGTTCGTGCCATTAATAGGCCTGGCTCTCAA
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GGTTCGAATTGTGAAAAGGCGCACTGTTCAACAGATTCTAGGCATGATCCCCAAGGAGTTAGATGGTGAACGTTTTCAAGATGCTCTTGCTCGAGTTTGCCGTTGCATTG
GTGGTGGGAACACTGCAGATAATGCTGATAGTGACAGTGACTTGGAGGTTGTTGCAGACTATTTTGGGGTTAATCTACGCTGTCCTATTCTTTTTCTTTTTTGGAAAAGA
TAA
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CCATACCCTGAACACTTCTATTGTGAGATCTGTCGACTCAATCGTGCTGACCCTTTTTGGGTTTCAGTTGCACATCCTCTGTTTCCCGTAAAGCTGATGACCACATCCAC
AAACATCCCAACGGATGGTACAAATCCTATGCAGAGCGTGGATAGAACGTTTCAACTCACAAGGGCAGATAAGGACTTAATTTCTAAACAGGAATACGATGTTCAGGCCT
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CTTTTGGGGGCAAATGGTCGTGATGATGGCCCAATTATCACACCTTTCACGAAAGATGGAATGAATAAGATAACATTAACAGGATGCGATACTCGTACTTTTTGTTTAGG
GGTTCGAATTGTGAAAAGGCGCACTGTTCAACAGATTCTAGGCATGATCCCCAAGGAGTTAGATGGTGAACGTTTTCAAGATGCTCTTGCTCGAGTTTGCCGTTGCATTG
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TAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSVDKPEWIIGDRSELCNWRGLVLVGVSINRSSEDHALVACLGLLLKSSFCHTIVRDFAGCYLEGMDLVANCKDKLAYFRIKELKDILTQLGLSKQGKKQDLVERILAI
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LLGANGRDDGPIITPFTKDGMNKITLTGCDTRTFCLGVRIVKRRTVQQILGMIPKELDGERFQDALARVCRCIGGGNTADNADSDSDLEVVADYFGVNLRCPILFLFWKR