| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0034095.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-14 | 38.06 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------GACTDEKFLV-KYNPLFELN------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P T S S E++ +D ++ I Q G E + +YN L E + +I++VM+T+ T ++RMAE+++++N+LM+A
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------GACTDEKFLV-KYNPLFELN------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+++ ES HTH +KN +K K ++Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| KAA0051994.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.7e-15 | 35.48 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDE-KFLVKYNPLFELN-------------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P T S S +++ +D + I Q + + ++K NP + + +I++VM+T+ T ++RMAE+++++N+LM+A
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDE-KFLVKYNPLFELN-------------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+++ +ES HTH++KN +K K ++Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| KAA0061610.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.5e-15 | 38.06 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------------GACTDEKFLVKYNPLFEL-NADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P THSCS E++ +D ++ I Q DE + E+ + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------------GACTDEKFLVKYNPLFEL-NADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+ + ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| TYK03695.1 retrotransposon gag protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.7e-15 | 40.52 | Show/hide |
Query: SYTG--PTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------GACTDEKFLV-KYNPLFELN------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRAIE
SY G P THSCS E++ +D ++ I Q G E V ++N L E + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+ +E
Subjt: SYTG--PTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------GACTDEKFLV-KYNPLFELN------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRAIE
Query: EKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
E+D +I LK+HIE+++ ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: EKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| TYK14321.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-14 | 37.42 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDEK-FLVKYNPLFE-------------LNADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P THS S E++ +D ++ I Q + + ++K NP + + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDEK-FLVKYNPLFE-------------LNADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+++ ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7STX4 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 4.9e-15 | 37.42 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDEK-FLVKYNPLFE-------------LNADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P THS S E++ +D ++ I Q + + ++K NP + + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDEK-FLVKYNPLFE-------------LNADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+ + ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| A0A5A7U9H0 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 3.7e-15 | 35.48 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDE-KFLVKYNPLFELN-------------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P T S S +++ +D + I Q + + ++K NP + + +I++VM+T+ T ++RMAE+++++N+LM+A
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDE-KFLVKYNPLFELN-------------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+++ +ES HTH++KN +K K ++Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| A0A5A7V2W9 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 2.2e-15 | 38.06 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------------GACTDEKFLVKYNPLFEL-NADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P THSCS E++ +D ++ I Q DE + E+ + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------------GACTDEKFLVKYNPLFEL-NADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+ + ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| A0A5D3BX77 Retrotransposon gag protein | 1.3e-15 | 40.52 | Show/hide |
Query: SYTG--PTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------GACTDEKFLV-KYNPLFELN------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRAIE
SY G P THSCS E++ +D ++ I Q G E V ++N L E + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+ +E
Subjt: SYTG--PTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQ-------GACTDEKFLV-KYNPLFELN------ADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRAIE
Query: EKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
E+D +I LK+HIE+++ ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: EKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
| A0A5D3CRB1 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 4.9e-15 | 37.42 | Show/hide |
Query: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDEK-FLVKYNPLFE-------------LNADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
A+SD P THS S E++ +D ++ I Q + + ++K NP + + +I++VM+T T + RMAE+++++N+LM+
Subjt: AMSDSYTGPTTHSCSDELKLQDDKALIITSEEITLQGACTDEK-FLVKYNPLFE-------------LNADIVTVMMTETKTMKERMAEMQEQINILMRA
Query: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
+EE+D +I LK+HIE+++ ES H H VKN DK K V+Q+ QPQ S SIASLS+
Subjt: IEEKDSQIKHLKSHIENQNIVESIHTHVVKNQDKEKTVVQDDQPQCSASIASLSI
|
|
