| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6583479.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 0.0e+00 | 95.82 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSG PLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSK DATPE GCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSW TLL DNESDVGK IG SEND+ +IRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAK+ISTPIVTAALK +DNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMS+RSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQD DRSKLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVP LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| XP_004148776.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X1 [Cucumis sativus] | 0.0e+00 | 95.99 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCP DGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDA+PECGCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL DNES V K I S+ND+ VIRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAAL DDNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADR+KLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR SVPQ LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| XP_022964790.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 [Cucurbita moschata] | 0.0e+00 | 95.82 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSG PLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSK DATPE GCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSW TLL DNESDVGK IG SEND+ +IRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAK+ISTPIVTAALK +DNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMS+RSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQD DRSKLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVP LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| XP_023519826.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 0.0e+00 | 95.99 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSG PLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSK DATPE GCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSW TLL DNESDVGK IG SEND+T+IRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAK+ISTPIVTAALK +DNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMS+RSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQD DRSKLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVP LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| XP_031736287.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 isoform X2 [Cucumis sativus] | 0.0e+00 | 95.99 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCP DGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDA+PECGCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL DNES V K I S+ND+ VIRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAAL DDNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADR+KLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR SVPQ LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3CNX9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 2.6e-309 | 95.12 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSI+YDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCP DGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDA+PECGCSPAFIGSLKIFLNKY+EAQKKSW TLL DNE+ V K I S+ND+ VIRN VVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAAL DDNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADR+KLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQR SVP+ LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| A0A2I4DDG5 DNA-directed RNA polymerase subunit | 5.0e-241 | 74.52 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSR+LIKALEDLSI YD++VRNA GCIVQF YGDDGMDPA ME KSG+PLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
KATCP G + LSPSE SE VE R S+ D TPE GCS AF S K FL++Y ++ +K+ T E+ + EN + I+ K+V+NI+G+T +QL
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
Query: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
+VFL+TC+SRYH KKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEI+NGAK+ISTPI+TAAL DDNVN ARMV+ RIEKTNLG
Subjt: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
Query: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
Q+AK I++VM+SRSA + +KLDME+IRD +L +DAN+VK++I+ TPKLKLKHEHI VLD KL +L + D+SK+HF+LH LKN+LP V+VKGIKTV RA
Subjt: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
Query: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
+IK+E++K K+SLLVEG GLQ VMGTEG+DGC T SNH+IEVQQ LGIEAARKCIIEEIKYTMESHGM+IDIRHMMLL DLMTFRGEVLGITRFGI
Subjt: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
Query: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
QKMDKS+LMLASFEKTADHLFNAS+NGRDD+IEGVSE +IMGIPM +GTGMLKVRQR S+P L GP ILS
Subjt: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| A0A6J1DR19 DNA-directed RNA polymerase | 0.0e+00 | 95.99 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSK+DATPE GCS AFI SLKIFLNKYVE QK++W LL DNESD GK IG SEND+ VIR KVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALK DDNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELY+DANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGC+TKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| A0A6J1HLT9 DNA-directed RNA polymerase subunit | 0.0e+00 | 95.82 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSG PLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSK DATPE GCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSW TLL DNESDVGK IG SEND+ +IRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAK+ISTPIVTAALK +DNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMS+RSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQD DRSKLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVP LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| A0A6J1I0L0 DNA-directed RNA polymerase subunit | 0.0e+00 | 95.64 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSG PLNFERLFLKA
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSK DA+PECGCSPAF+GSLKIFLNKYVEAQKKSW TLL DNES+VGK IG SEND+ +IRNKVVQNIAGVT RQ
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLL-DNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAK+ISTPIVTAALK +DNVNIARMVKARIEKTNL
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQIAKCIQIVMS+RSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAIL+TPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQD DRSKLHFNLHFLKNMLP VVVKGIKTVGR
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
AVIKEEKDK RNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFG
Query: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVP LPYGP AILS
Subjt: IQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A4IF62 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 1.1e-149 | 52.11 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLT TEFFFHTM GREGLVDTAVKTA+TGYM RRL+K+LEDL YD +VR++ G I+QF YG DG+DPA MEGK PL F+R+
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
KA P LS +E + E + K++ C C +F+ +K F+ + E KK+ + G ++N T +V+ + +T Q+
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
Query: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
+ FL+TC +Y ++E G+A+GA+ AQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMN+TLGVPRIKEIIN +K ISTPI+TA L +DD+ + AR+VK RIEKT LG
Subjt: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
Query: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
+I++ I+ V I +KL +E+IR L V+A V+ +I ++ KL++K + V + + V P++ +S +++ L FLK LP VVV+GI V RA
Subjt: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
Query: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
VI D+ +K+ LLVEG L+AVM T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT++GEVLGITRFG+
Subjt: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
Query: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP
KM +SVLMLASFEKTADHLF+A+ G+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+ +A+ P P
Subjt: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP
|
|
| F4JXF9 DNA-directed RNA polymerase III subunit 1 | 2.7e-175 | 58.75 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTA TGYMSRRL+KALEDL +HYD++VRNA GCI+QF YGDDGMDPA MEGK GAPLNF RLFLK
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATC-PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
+ATC P + LS E S+ E+ L + D + C+ AF+ SL+ F+ S +G K+ + V+ +GVT +Q
Subjt: KATC-PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
L+VF+ C+ RY KKIEAGTAIG IGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMN+T GVPRI EIIN +K ISTP+++A L+ + AR VK RIEKT L
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQ+A+ I+++M+S SA + I LD + I +A L + VK +IL TP++KL I VL D L + P D+S+ HFNLH LKN+LP ++V GIKTV R
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDK---VRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGIT
V+ E+ DK + K+ L VEGT L AVMGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+RGEVLGI
Subjt: AVIKEEKDK---VRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGIT
Query: RFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
R GIQKMDKSVLM ASFE+T DHLF+A+ +G+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR L YGP I+S
Subjt: RFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| O14802 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 5.1e-150 | 52.46 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLT TEFFFHTM GREGLVDTAVKTA+TGYM RRL+K+LEDL YD +VR++ G I+QF YG DG+DPA MEGK PL F+R+
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
KA P LS +E T E + K + C C +F+ +K F+ E KK+ + G ++N T +V+ + +T Q+
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
Query: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
+ FL+TC +Y ++E G+A+GA+ AQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMN+TLGVPRIKEIIN +K ISTPI+TA L +DD+ + AR+VK RIEKT LG
Subjt: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
Query: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
+I++ I+ V I +KL +E+IR L V+A V+ +I T KL++K + V + + V P++ +S +++ L FLK LP VVV+GI V RA
Subjt: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
Query: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
VI D+ +K+ LLVEG L+AVM T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT++GEVLGITRFG+
Subjt: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
Query: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP
KM +SVLMLASFEKTADHLF+A+ G+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+ +A + P P
Subjt: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP
|
|
| Q5ZL98 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 | 1.6e-148 | 52.11 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLT TEFFFHTM GREGLVDTAVKTA+TGYM RRL+K+LEDL YD +VR++ G I+QF YG DG+DPA MEGK PL F+R+
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
+A P LS +E T E + K++ C C +F+ +K F+ E KK+ + G ++N T +V+ + +T QL
Subjt: KATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQL
Query: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
+ FL+TC +Y ++E G+A+GA+ AQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMN+TLGVPRIKEIIN +K ISTPI+TA L +DD+ + AR+VK RIEKT LG
Subjt: QVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLG
Query: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
+I++ I+ V I +KL +E+IR L V+A V+ +I ++ KL++K + V + + V P++ +S +++ L LK LP VVV+GI V RA
Subjt: QIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRA
Query: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
VI D+ +K+ LLVEG L+AVM T GV G T SN+ EV++ LGIEAAR II EI+YTM +HGMSID RH+MLL DLMT++GEVLGITRFG+
Subjt: VIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGI
Query: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP
KM +SVLMLASFEKTADHLF+A+ G+ D + GVSEC+IMGIPM +GTG+ K+ +A P P
Subjt: QKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGP
|
|
| Q86AQ5 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc1 | 2.8e-148 | 48.09 | Show/hide |
Query: QAKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLK
++KGFV+NSFY+G+ TEFFFHTMGGREGLVDTAVKTA+TGYM RRL+KALEDLS HYD +VR++ G IVQF YGDDG+DPA ME K P++F R +
Subjt: QAKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLK
Query: AKATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLN------KYVEAQ-------KKSWGTLLDNE--------------------
K+T + P E + VE + D++ C+ F +++F N Y++ K S L DNE
Subjt: AKATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLN------KYVEAQ-------KKSWGTLLDNE--------------------
Query: ---------------SDVGKKTIGGSEND--------------------DTVIRNKVVQNIAGVTQRQLQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIG
+D+ END + VV I +T+ Q+++FLD CL +Y +IE GTA+GAIGAQSIG
Subjt: ---------------SDVGKKTIGGSEND--------------------DTVIRNKVVQNIAGVTQRQLQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIG
Query: EPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLGQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAEL
EPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIIN AK ISTPI+TA+L D ++ AR+V RIEKT LG +A I+ V+ + IK+D + +L
Subjt: EPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNLGQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAEL
Query: YVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRAVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTE
+++ + Q+I T LKLK E I D KLR++P R + L FLKN LPAV+VKGI TV R VI + +K +++ LLVEG L+AVM T
Subjt: YVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRAVIKEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTE
Query: GVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDK
G+ G +T SNHI+E + LGIE AR I+ EI M SHGMSIDIRH+MLL DLM+F+GE+LGITRFGI KM +SVLMLASFEKT DHLF+A+V+ R D
Subjt: GVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDK
Query: IEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRAS
I GVSEC+IMG+ +PLGTG+ K+ ++++
Subjt: IEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRAS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G57660.1 nuclear RNA polymerase A1 | 6.1e-42 | 23.82 | Show/hide |
Query: QAKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLK
+A GF+++ F SGL E++FH M GREGLVDTAVKT+ +GY+ R L+K LE L ++YD +VR+A G I+QF YG+DG+D + F++
Subjt: QAKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLK
Query: AKATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFL----NKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGV
I+ + +L + ED LS G S ++I L I L K+VEA + + IA
Subjt: AKATCPIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFL----NKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGV
Query: TQRQLQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEII-NGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARI
RQ + L S++ + G +G + AQS+GEP TQMTL TFH AG MNVTLG+PR++EI+ A I TPI+T L + A + R+
Subjt: TQRQLQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEII-NGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARI
Query: EKTNLGQIAKCIQIVM-------SSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDAN------------VVKQAILLTPKLKLKH-----------------------
K + I K +++ + + ++ ++K+++ K + D + K + +K+ H
Subjt: EKTNLGQIAKCIQIVM-------SSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDAN------------VVKQAILLTPKLKLKH-----------------------
Query: --------------------------------------------------EHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRAVI
I+ ++D ++ +D + SK ++M P VKG+K V
Subjt: --------------------------------------------------EHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGRAVI
Query: KEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQ---------------------------AVMGTEGVDGC---------------NTK---------------------
K+ + VR + V+G G + + + ++ C N K
Subjt: KEEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQ---------------------------AVMGTEGVDGC---------------NTK---------------------
Query: ------------------SNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
SN I ++ + G+EAAR+ II EI + +S+G+S+ IRH+ L+ D MTF G ++R G S +FE +
Subjt: ------------------SNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLF
Query: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASV
A+ G D +E S + +G+P GTG + QR +
Subjt: NASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASV
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 1.3e-76 | 32.1 | Show/hide |
Query: QAKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPL--------
+++GFV NS+ GLT EFFFH MGGREGL+DTAVKT++TGY+ RRL+KA+ED+ + YD +VRN+ G ++QF YG+DGMD +E + L
Subjt: QAKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPL--------
Query: ----------NFERLFLKAKATCPIDGNKILS---PSEFSETVEDR--LSKDDATPECGCSPAFIG----------SLKIFLNK--------YVEAQKKS
N+ +L + + G + L +E+S+ DR L + AT P + + KI L K V+A K
Subjt: ----------NFERLFLKAKATCPIDGNKILS---PSEFSETVEDR--LSKDDATPECGCSPAFIG----------SLKIFLNK--------YVEAQKKS
Query: WGTLLDNESDVGKKTIGGSENDD--------TVIRNKVVQNIAGVTQRQLQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASM
LL D ++ +N + + +K V +++ + + SR+ + G IG + AQSIGEP TQMTL TFH+AGV++
Subjt: WGTLLDNESDVGKKTIGGSENDD--------TVIRNKVVQNIAGVTQRQLQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASM
Query: NVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNI--ARMVKARIEKTNLGQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANV-----------
NVTLGVPR++EIIN AKRI TP ++ L + + + A+ V+ +E T L + + ++ I+ D E +R D +V
Subjt: NVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNI--ARMVKARIEKTNLGQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANV-----------
Query: --VKQAILLTPKLKLKH--EHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLH--------------------FLK----NMLPAVVVKGIKTVGRAVIK------
+ + +++ KL + E IN+ D L + D + KL + FLK NML + ++GI + + IK
Subjt: --VKQAILLTPKLKLKH--EHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLH--------------------FLK----NMLPAVVVKGIKTVGRAVIK------
Query: -EEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQK
+E+ + ++++ L EG L AVM E VD T SNH+IE+ +VLGIEA R+ +++E++ + G ++ RH+ +L D MT+RG ++ ITR GI +
Subjt: -EEKDKVRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGITRFGIQK
Query: MDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTG
D LM SFE+T D L +A+ D + GV+E +++G P+GTG
Subjt: MDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTG
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 1.9e-176 | 58.75 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTA TGYMSRRL+KALEDL +HYD++VRNA GCI+QF YGDDGMDPA MEGK GAPLNF RLFLK
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATC-PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
+ATC P + LS E S+ E+ L + D + C+ AF+ SL+ F+ S +G K+ + V+ +GVT +Q
Subjt: KATC-PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
L+VF+ C+ RY KKIEAGTAIG IGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMN+T GVPRI EIIN +K ISTP+++A L+ + AR VK RIEKT L
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQ+A+ I+++M+S SA + I LD + I +A L + VK +IL TP++KL I VL D L + P D+S+ HFNLH LKN+LP ++V GIKTV R
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDK---VRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGIT
V+ E+ DK + K+ L VEGT L AVMGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+RGEVLGI
Subjt: AVIKEEKDK---VRNAKKFSLLVEGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLGIT
Query: RFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
R GIQKMDKSVLM ASFE+T DHLF+A+ +G+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR L YGP I+S
Subjt: RFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 6.3e-172 | 57.86 | Show/hide |
Query: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTA TGYMSRRL+KALEDL +HYD++VRNA GCI+QF YGDDGMDPA MEGK GAPLNF RLFLK
Subjt: AKGFVANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKA
Query: KATC-PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
+ATC P + LS E S+ E+ L + D + C+ AF+ SL+ F+ S +G K+ + V+ +GVT +Q
Subjt: KATC-PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGTLLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQ
Query: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
L+VF+ C+ RY KKIEAGTAIG IGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMN+T GVPRI EIIN +K ISTP+++A L+ + AR VK RIEKT L
Subjt: LQVFLDTCLSRYHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINGAKRISTPIVTAALKQDDNVNIARMVKARIEKTNL
Query: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
GQ+A+ I+++M+S SA + I LD + I +A L + VK +IL TP++KL I VL D L + P D+S+ HFNLH LKN+LP ++V GIKTV R
Subjt: GQIAKCIQIVMSSRSALIEIKLDMEKIRDAELYVDANVVKQAILLTPKLKLKHEHINVLDDRKLRVLPQDADRSKLHFNLHFLKNMLPAVVVKGIKTVGR
Query: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLV-----EGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLG
V+ E+ DK+ L++ T L AVMGT G++G T SN+++EV + LGIEAAR II+EI M +HGMSIDIRHMMLL D+MT+RGEVLG
Subjt: AVIKEEKDKVRNAKKFSLLV-----EGTGLQAVMGTEGVDGCNTKSNHIIEVQQVLGIEAARKCIIEEIKYTMESHGMSIDIRHMMLLGDLMTFRGEVLG
Query: ITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
I R GIQKMDKSVLM ASFE+T DHLF+A+ +G+ D IEGV+ECVIMGIPM LGTG+LKV QR L YGP I+S
Subjt: ITRFGIQKMDKSVLMLASFEKTADHLFNASVNGRDDKIEGVSECVIMGIPMPLGTGMLKVRQRASVPQHLPYGPAAILS
|
|
| ATCG00170.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 3.5e-13 | 27.24 | Show/hide |
Query: VANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKAKATC
+ ++ GL+ TE+ G R+G+VDTAV+T+D GY++RRL++ ++ + + D + G S +P N
Subjt: VANSFYSGLTATEFFFHTMGGREGLVDTAVKTADTGYMSRRLIKALEDLSIHYDSSVRNAGGCIVQFCYGDDGMDPAQMEGKSGAPLNFERLFLKAKATC
Query: PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGT-LLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQLQVF
N+++S F +T+ R+ DD +IGS + V + + G L++ G ++I IR T R
Subjt: PIDGNKILSPSEFSETVEDRLSKDDATPECGCSPAFIGSLKIFLNKYVEAQKKSWGT-LLDNESDVGKKTIGGSENDDTVIRNKVVQNIAGVTQRQLQVF
Query: LDTCLSR--YHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGV
C R H +E G A+G I QSIGEPGTQ+TL+TFH GV
Subjt: LDTCLSR--YHTKKIEAGTAIGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGV
|
|
