CuGenDBv2

Gene ID	Lag0023389
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
Genome location	chr7:47851197..47855042
RNA-Seq Expression	Lag0023389
Synteny	Lag0023389
Gene Ontology terms	GO:0006413 - translational initiation (biological process) GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function) GO:0004497 - monooxygenase activity (molecular function) GO:0005506 - iron ion binding (molecular function) GO:0016705 - oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (molecular function) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000504 - RNA recognition motif domain IPR001876 - Zinc finger, RanBP2-type IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily IPR035979 - RNA-binding domain superfamily IPR036443 - Zinc finger, RanBP2-type superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7037015.1 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.9e-212

91.55

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRG---GGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQ
        MSGMYDQGGDAAPSSYGAP           GGGGGGYGGGGYGGGGG GYGGKGGDGGYGGGGRG   GGGGGRGYGGRGGGGG   YGGR GGGGGGYQ
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRG---GGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQ

Query:  GGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS---GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRN
        GGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCAN+NFARRVECNKCGTPSPGGASDRS   GGGGYNRGG+DGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR 
Subjt:  GGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS---GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRN

Query:  EGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDG
        EGGNRGGNSYGGHQGGEDSGY+QVPPSSAPPSGGVGGSYPPSY GGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYG DG+GDGRSA GRGGPSAGYDG
Subjt:  EGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDG

Query:  GYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIK
         YNAGG+GGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCD++CDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIK
Subjt:  GYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIK

Query:  IYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY--GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSR
        IYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG+SINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGY  GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSR
Subjt:  IYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY--GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSR

XP_008457317.1 PREDICTED: transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1 [Cucumis melo]

8.5e-212

91.62

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR-GGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGG--------
        MSGMYDQGGDAAP SYGAPGGGGGYGGGGGGGG G       GGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR GGGGGGRGYGGRGGGGGGG YGGRGGG        
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR-GGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGG--------

Query:  GGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDR--SGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHD
        GGGYQGGDRGGRG GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGC NLNFARRVECNKCG PSPGGASDR   GGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHD
Subjt:  GGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDR--SGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHD

Query:  GGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSA
        GGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAP SGG+ GSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYGGD LGDGR AAGRGGPS 
Subjt:  GGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSA

Query:  GYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWP
        GYDGGYNAGGR GGYNAGGR GGSYNA GGRGGGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWP
Subjt:  GYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWP

Query:  WNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRP
        WNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRP
Subjt:  WNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRP

Query:  Y
        Y
Subjt:  Y

XP_022948284.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like [Cucurbita moschata]

1.7e-215

92.14

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAAPSSYGAP           GGGGGGYGGGGYGGGGG GYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGG   YGGR GGGGGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD

Query:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG---GGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCAN+NFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG   GGYNRGG+DGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGG
Subjt:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG---GGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN
        NRGGNSYGGHQGGEDSGY+QVPPSSAPPSGGVGGSYPPSY GGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYG DG+GDGRSA GRGGPSAGYDG YN
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN

Query:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
        AGG+GGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCD++CDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY--GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG+SINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGY  GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY--GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_022997960.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b [Cucurbita maxima]

1.7e-212

90.91

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAAPSSYGAP           GGGGGGYGGGGYGG    GYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGG G  G GG GGGG YGGR GGGGGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD

Query:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS---GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCAN+NFARRVECNKCGTPSPGGASDRS   GGGGYNRGG+DGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGG
Subjt:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS---GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN
        NRGGNSYGGHQGGEDSGY+QVPPSSAPPSGGVGGSYPPS+HGGSA+YGTDAVPPPASYSG+TYP TYGGPTGGYGGDG+GDGRSA GRGGPSAGYDG YN
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN

Query:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
        AGG+GGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCD++CDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY-GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG+SINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY-GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_023523000.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

4.5e-213

91.73

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAAPSSYGAP           GGGGGGYGGGGYGGGGG GYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGG G  G GG GGGG YGGR GGGGGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD

Query:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS----GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEG
        RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCAN+NFARRVECNKCGTPSPGGASDRS    GGGGYNRGG+DGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EG
Subjt:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS----GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEG

Query:  GNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGY
        GNRGGNSYGGHQGGEDSG++QVPPSSAPPSGGVGGSYPPSY GGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYGGDGLGDGRSA GRGGPSAGYDG Y
Subjt:  GNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGY

Query:  NAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY
        NAGG+GGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCD++CDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY
Subjt:  NAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY

Query:  TDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY-GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        TDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG+SINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  TDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY-GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LYC4 Uncharacterized protein

2.3e-210

90.04

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGG--------G
        MSGMYDQGGDAAP SYGAPGGGGGYGGGG        GGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGG G  G GG GGGG YGGRGGG        G
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGG--------G

Query:  GGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS----GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTH
        GGYQGGDRGGRG GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGC NLNFARRVECNKCG PSPGGASDRS    GGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTH
Subjt:  GGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS----GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTH

Query:  DGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPS
        DGGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAP SGG+ GSYPPSYHGGS+DYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYGGD LGDGR AA RGGPS
Subjt:  DGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPS

Query:  AGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQW
        AGYDGGYNAGGR GGYNAGGR GGSYNA GGR GGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVT DELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQW
Subjt:  AGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQW

Query:  PWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSR
        PWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAP  YNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSR
Subjt:  PWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSR

Query:  PY
        PY
Subjt:  PY

A0A1S3C4S9 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1

4.1e-212

91.62

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR-GGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGG--------
        MSGMYDQGGDAAP SYGAPGGGGGYGGGGGGGG G       GGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR GGGGGGRGYGGRGGGGGGG YGGRGGG        
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR-GGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGG--------

Query:  GGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDR--SGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHD
        GGGYQGGDRGGRG GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGC NLNFARRVECNKCG PSPGGASDR   GGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGSFHGGRSGTHD
Subjt:  GGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDR--SGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHD

Query:  GGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSA
        GGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAP SGG+ GSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYGGD LGDGR AAGRGGPS 
Subjt:  GGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSA

Query:  GYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWP
        GYDGGYNAGGR GGYNAGGR GGSYNA GGRGGGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWP
Subjt:  GYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWP

Query:  WNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRP
        WNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRP
Subjt:  WNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRP

Query:  Y
        Y
Subjt:  Y

A0A6J1G9F8 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like

8.0e-216

92.14

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAAPSSYGAP           GGGGGGYGGGGYGGGGG GYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGG   YGGR GGGGGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD

Query:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG---GGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCAN+NFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG   GGYNRGG+DGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGG
Subjt:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG---GGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN
        NRGGNSYGGHQGGEDSGY+QVPPSSAPPSGGVGGSYPPSY GGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGPTGGYG DG+GDGRSA GRGGPSAGYDG YN
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN

Query:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
        AGG+GGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCD++CDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY--GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG+SINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGY  GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY--GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A6J1HM15 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like

3.3e-209

86.16

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGG-GGGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAAP SYGAPGGGGGYGGG                    GYGGKGGDGGYGGGGR GGGGGRGYGGRGGGGGGG YGGRGG GGGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGG-GGGGYQGGD

Query:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG----------------------GGYNRGGSDGGYGGNRNGRG
        RGGRG GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGC NLNFARRVECNKCG PSPGGAS   GG                      GGYNRGG DGGYGGNRNGRG
Subjt:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGG----------------------GGYNRGGSDGGYGGNRNGRG

Query:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGD
        GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGY+QVPPSSAP SGG+ GSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYP TYGGP+GGY GD LGD
Subjt:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGD

Query:  GRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGR
        GRS+AGRGGPSAGYDGGYNAGGR GGYN+GGRGGGSYN GGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGR
Subjt:  GRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGR

Query:  IKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGP
        IKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDP AAHSAGGFYNNYDLRGY+I+VAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDG SGP
Subjt:  IKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGP

Query:  DRHQHGGNRSRPY
        DRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DRHQHGGNRSRPY

A0A6J1KBD1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b

8.3e-213

90.91

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAAPSSYGAP           GGGGGGYGGGGYGG    GYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGG G  G GG GGGG YGGR GGGGGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGR-GGGGGGYQGGD

Query:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS---GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCAN+NFARRVECNKCGTPSPGGASDRS   GGGGYNRGG+DGGYGGNRNGRGGS+HGGRSG HDGGR EGG
Subjt:  RGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRS---GGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN
        NRGGNSYGGHQGGEDSGY+QVPPSSAPPSGGVGGSYPPS+HGGSA+YGTDAVPPPASYSG+TYP TYGGPTGGYGGDG+GDGRSA GRGGPSAGYDG YN
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPSSAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYN

Query:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
        AGG+GGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCD++CDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  AGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY-GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRG+SINVAMAEKSAPRAP TYNHGGGGRGGY GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGGY-GGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q94KD0 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b

1.4e-92

59.83

Show/hide

Query:  GGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNP
        GGGG     YGG GYGGGGG G    GGD GYGG G  GGG    YGGRGG GGGG  G RGGGGGGYQGGDRGGRG         GG GRDGDW CPNP
Subjt:  GGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNP

Query:  GCANLNFARRVECNKCGTPSP----GGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQV-PPSSA
         C N+NFARRVECNKCG  +P     GA+DR GGGGY+RGG D   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG+R G SYG     E+  Y Q  PP++A
Subjt:  GCANLNFARRVECNKCGTPSP----GGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQV-PPSSA

Query:  PPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGG
         PS    GSYPP        YG +AVPPP SYSG   P +YGGP GGYG     D  S  GRGG S GYDGG          +A  R   SY        
Subjt:  PPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGG

Query:  GYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGF
               A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLPPDVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYTDE GN KGDAC++YEDPSAAHSAGGF
Subjt:  GYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGF

Query:  YNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        +NNY++RG  I+V MAEKSAPRAP T++  GGGRGG      GGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  YNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G58470.1 TBP-associated factor 15B

1.0e-93

59.83

Show/hide

Query:  GGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNP
        GGGG     YGG GYGGGGG G    GGD GYGG G  GGG    YGGRGG GGGG  G RGGGGGGYQGGDRGGRG         GG GRDGDW CPNP
Subjt:  GGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNP

Query:  GCANLNFARRVECNKCGTPSP----GGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQV-PPSSA
         C N+NFARRVECNKCG  +P     GA+DR GGGGY+RGG D   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG+R G SYG     E+  Y Q  PP++A
Subjt:  GCANLNFARRVECNKCGTPSP----GGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQV-PPSSA

Query:  PPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGG
         PS    GSYPP        YG +AVPPP SYSG   P +YGGP GGYG     D  S  GRGG S GYDGG          +A  R   SY        
Subjt:  PPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGG

Query:  GYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGF
               A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLPPDVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYTDE GN KGDAC++YEDPSAAHSAGGF
Subjt:  GYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGF

Query:  YNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        +NNY++RG  I+V MAEKSAPRAP T++  GGGRGG      GGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  YNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

AT5G58470.2 TBP-associated factor 15B

1.0e-93

59.83

Show/hide

Query:  GGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNP
        GGGG     YGG GYGGGGG G    GGD GYGG G  GGG    YGGRGG GGGG  G RGGGGGGYQGGDRGGRG         GG GRDGDW CPNP
Subjt:  GGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNP

Query:  GCANLNFARRVECNKCGTPSP----GGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQV-PPSSA
         C N+NFARRVECNKCG  +P     GA+DR GGGGY+RGG D   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG+R G SYG     E+  Y Q  PP++A
Subjt:  GCANLNFARRVECNKCGTPSP----GGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQV-PPSSA

Query:  PPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGG
         PS    GSYPP        YG +AVPPP SYSG   P +YGGP GGYG     D  S  GRGG S GYDGG          +A  R   SY        
Subjt:  PPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGG

Query:  GYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGF
               A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLPPDVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYTDE GN KGDAC++YEDPSAAHSAGGF
Subjt:  GYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGF

Query:  YNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        +NNY++RG  I+V MAEKSAPRAP T++  GGGRGG      GGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  YNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPSTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCTGGTATGTACGATCAAGGAGGAGACGCCGCTCCTTCGTCTTACGGAGCCCCTGGCGGCGGTGGAGGATACGGCGGCGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGATA
TGGTGGTGGAGGTTATGGAGGCGGTGGTGGTGCAGGTTATGGTGGAAAGGGCGGTGATGGTGGATATGGCGGCGGAGGCCGAGGCGGCGGCGGTGGTGGTAGAGGTTATG
GAGGACGAGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGAAGCTACGGTGGCCGAGGAGGCGGCGGCGGTGGTTATCAAGGAGGGGATCGCGGAGGGCGTGGTGGTGGACGTGGTGGCGGA
GGTGGTCGTGGCGGAAGCGGGAGAGATGGCGATTGGGTCTGCCCCAATCCTGGCTGTGCCAATTTGAACTTTGCTAGAAGAGTGGAGTGTAACAAGTGTGGTACACCATC
ACCTGGAGGTGCTAGTGACCGAAGTGGTGGTGGTGGTTATAATAGAGGTGGATCGGATGGGGGATATGGTGGTAATCGTAATGGCAGAGGCGGTAGTTTCCATGGTGGTA
GAAGTGGAACTCATGATGGAGGTCGAAATGAAGGAGGTAACAGAGGTGGCAATTCTTACGGTGGTCACCAGGGAGGAGAAGATAGTGGGTACAATCAGGTTCCCCCATCA
TCAGCACCCCCATCTGGTGGTGTTGGTGGCTCTTATCCACCATCTTACCATGGTGGAAGTGCTGATTACGGGACAGATGCAGTTCCTCCTCCTGCAAGCTACAGTGGAAC
TACATACCCTTCAACTTATGGTGGACCCACTGGTGGCTATGGTGGTGATGGTCTAGGTGATGGGCGGAGTGCTGCTGGTCGTGGTGGGCCATCAGCTGGATATGATGGTG
GCTATAATGCAGGTGGTAGAGGTGGTGGCTATAATGCTGGTGGTAGAGGAGGAGGAAGCTATAATGCCGGTGGTGGTAGAGGTGGTGGTTATGGAAGTACACCAGCAGCA
GAGCCAGCACAGGTGAAACAGTGCGATGATAATTGTGATGATTCGTGTGATAACTCTAGAATCTATGTCTCTAATTTGCCACCAGATGTGACCATTGATGAATTGAGAGA
ACTATTTGGTGGAATTGGTCAAATTGGAAGAATCAAGCAGAAGAGGGGCTACAAGGATCAGTGGCCTTGGAACATAAAAATCTATACAGATGAGATGGGAAATAACAAAG
GCGATGCATGTGTATCATATGAAGATCCCTCAGCGGCACATTCTGCTGGCGGTTTCTATAACAATTACGATTTGAGAGGTTATAGCATCAATGTTGCAATGGCTGAGAAG
TCTGCCCCGAGGGCTCCATCTACATACAACCATGGTGGTGGTGGTAGAGGTGGATATGGAGGTGGTGGAGATAGGCGTAGAGATAGCTATAGGGATGGAGGCTCTGGTCC
CGATAGACATCAGCATGGTGGAAATCGATCTCGTCCTTACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGMYDQGGDAAPSSYGAPGGGGGYGGGGGGGGGGGYGGGGYGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGRGYGGRGGGGGGGSYGGRGGGGGGYQGGDRGGRGGGRGGG
GGRGGSGRDGDWVCPNPGCANLNFARRVECNKCGTPSPGGASDRSGGGGYNRGGSDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYNQVPPS
SAPPSGGVGGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPSTYGGPTGGYGGDGLGDGRSAAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGGYNAGGRGGGSYNAGGGRGGGYGSTPAA
EPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEK
SAPRAPSTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Lag0023389 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome