CuGenDBv2

Gene ID	Lag0024199
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1118)
Genome location	chr10:1153831..1154370
RNA-Seq Expression	Lag0024199
Synteny	Lag0024199
Gene Ontology terms	GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process) GO:0010196 - nonphotochemical quenching (biological process) GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0090391 - granum assembly (biological process) GO:0009515 - granal stacked thylakoid (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009500 - Protein of unknown function DUF1118

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022137623.1 uncharacterized protein LOC111009021 [Momordica charantia]

1.3e-48

89.23

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M  TSFCSSSR  SF+YSYP KTKSR  NPST SPL + SMAAEKP PSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

XP_022954525.1 uncharacterized protein LOC111456768 [Cucurbita moschata]

2.1e-49

87.69

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M   S  SS+R+ASFIYSYP KTKS+ QNPSTFSPLH+H+MAAEKPP SA KT+ SKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

XP_022994700.1 uncharacterized protein LOC111490350 [Cucurbita maxima]

3.2e-50

88.46

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M   S  SS+R+ASFIYSYP KTKS+ QNPSTFSPLH+H+MAAEKPP SA KT+GSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

XP_023541355.1 uncharacterized protein LOC111801557 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

9.3e-50

87.69

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M   S  SS+R+ASFIYSYP KTKS+ QNPSTFSPLH+H+MAAEKPP SA KT+GSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQL+LLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

XP_038893804.1 uncharacterized protein LOC120082623 [Benincasa hispida]

8.7e-48

86.15

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M  +SFCSSSR+ASF++SYP+KT SRK++      LH+HSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPR+SISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BQ40 uncharacterized protein LOC103492437

6.1e-47

86.26

Show/hide

Query:  MAATSFCSSS-RSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        M  TSFCSSS R+ASFIYSYP+ T SR++      PLH+HSMAAEKPPPSA+KTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MAATSFCSSS-RSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

A0A5D3BGQ3 Uncharacterized protein

6.1e-47

86.26

Show/hide

Query:  MAATSFCSSS-RSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
        M  TSFCSSS R+ASFIYSYP+ T SR++      PLH+HSMAAEKPPPSA+KTVGSKKIN+TVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE
Subjt:  MAATSFCSSS-RSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAE

Query:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  KAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

A0A6J1CAU4 uncharacterized protein LOC111009021

6.5e-49

89.23

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M  TSFCSSSR  SF+YSYP KTKSR  NPST SPL + SMAAEKP PSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSP IKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

A0A6J1GSN1 uncharacterized protein LOC111456768

1.0e-49

87.69

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M   S  SS+R+ASFIYSYP KTKS+ QNPSTFSPLH+H+MAAEKPP SA KT+ SKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

A0A6J1K230 uncharacterized protein LOC111490350

1.6e-50

88.46

Show/hide

Query:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
        M   S  SS+R+ASFIYSYP KTKS+ QNPSTFSPLH+H+MAAEKPP SA KT+GSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK
Subjt:  MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEK

Query:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
Subjt:  AGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G74730.1 Protein of unknown function (DUF1118)

6.7e-06

54.17

Show/hide

Query:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG
        + +  ++E+ K+LS  EK+GLLS AE  GL+LSS+EKL + SKAE+LG
Subjt:  IKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELG

AT5G08050.1 Protein of unknown function (DUF1118)

1.5e-18

54.55

Show/hide

Query:  SPLHIHSMAAEKPPPSAA-KTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGFY
        S L +HSMA +KP PSAA +T+ SKK  +T                  P +KLLTRVEQLKLL+KAEKAGLLS AEK+G SLS+IE+LGLL+KAEE G  
Subjt:  SPLHIHSMAAEKPPPSAA-KTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKAGLSLSSIEKLGLLSKAEELGFY

Query:  RRRRIRELPG
              E PG
Subjt:  RRRRIRELPG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGCCACATCTTTCTGCAGCAGCAGCAGATCAGCTTCATTCATCTACTCTTATCCAACCAAAACCAAATCAAGAAAGCAAAATCCTTCCACCTTTTCGCCTCTTCA
TATCCACTCCATGGCCGCCGAGAAACCTCCCCCTTCCGCTGCTAAAACCGTCGGCTCCAAGAAGATAAACTCGACGGTGTTTCCTCTCGGCGAGAAAGGGCCGAGGAGCA
GCATCTCGCTGTCGACCTCGCCGCCGATCAAGCTACTGACGAGAGTGGAGCAATTGAAGCTTCTGAGCAAGGCGGAGAAGGCCGGGCTGCTGTCTGCGGCGGAGAAGGCT
GGGTTGTCTCTGTCGTCGATTGAGAAATTAGGGCTTCTGTCGAAGGCGGAGGAATTGGGGTTCTATCGGCGGCGACGGATCCGGGAACTCCCGGGGCGCTGCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAATSFCSSSRSASFIYSYPTKTKSRKQNPSTFSPLHIHSMAAEKPPPSAAKTVGSKKINSTVFPLGEKGPRSSISLSTSPPIKLLTRVEQLKLLSKAEKAGLLSAAEKA
GLSLSSIEKLGLLSKAEELGFYRRRRIRELPGRC

Lag0024199 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome