CuGenDBv2

Gene ID	Lag0024200
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr10:1157541..1157921
RNA-Seq Expression	Lag0024200
Synteny	Lag0024200
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6572909.1 hypothetical protein SDJN03_26796, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_022954424.1 uncharacterized protein LOC111456682 [Cucurbita moschata]

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XP_023541320.1 uncharacterized protein LOC111801530, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0LVM5 Uncharacterized protein

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A0A6J1E7N6 uncharacterized protein LOC111431390

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A0A6J1GSY9 uncharacterized protein LOC111456682

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A0A6J1K4A0 uncharacterized protein LOC111489956

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A0A6J1KK07 uncharacterized protein LOC111495303

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT5G08060.1 unknown protein

1.1e-44

66.14

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        ++ AASSL Q L+RYIKKPW+ITGPCA PEY  AVP A EYR+ CPAT  E+ IVP+S+PETV++I Y+ RDQRRNRPPIRR +L K +V QMM E K F
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        D +DFPKVYLT T+EED++  GGGY+K
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Sequences

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CDS sequence

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ATGGCCAAAGCTGCCTCCTCCCTCTTTCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAGCCATGGGAGATCACTGGCCCCTGTGCAGATCCAGAGTACAGATTAGCCGTCCCGAA
CGCCTTAGAGTACAGGGTCTTTTGCCCCGCCACCACAAAGGAGAAGCCCATTGTCCCTACCTCCAATCCCGAAACCGTCTTCGACATCAAGTATTACAGCCGCGACCAGC
GTCGCAATCGCCCTCCAATTCGGCGCACAATCCTCAAGAAACCCGACGTCGAGCAGATGATGAAGGAGAACAAATTCGACCCTGCCGACTTCCCCAAGGTTTATCTCACT
GCCACGATCGAGGAGGATATGAATGCCCATGGAGGTGGTTATCAGAAGTAG

mRNA sequence

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Protein sequence

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MAKAASSLFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRLAVPNALEYRVFCPATTKEKPIVPTSNPETVFDIKYYSRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEQMMKENKFDPADFPKVYLT
ATIEEDMNAHGGGYQK

Lag0024200 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome