; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0024928 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0024928
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionBHLH domain-containing protein
Genome locationchr10:7089082..7090403
RNA-Seq ExpressionLag0024928
SyntenyLag0024928
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0090575 - RNA polymerase II transcription factor complex (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR015660 - Achaete-scute transcription factor-related
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573268.1 Transcription factor basic helix-loop-helix 162, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.6e-5362Show/hide
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        IK RL L+Q++ HQVGSS+E LLTTGSDYH V  Q+L+LLQ+NG +I+ +N S   DRV HKIIA++VGEG   E  + ERICETVKKFVSQYK+ QY +
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KAG6573271.1 Transcription factor basic helix-loop-helix 162, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-5261Show/hide
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        MA+  I+ P S RTD K+IERNRR EM ALLS LHSL+PN SS  EG  T+PDQLENATNYIK+L+  VEKLKEKREKL+G+   EK  I       + E
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         K RL ++Q++ H+VGS +EILLTTGS Y  V  QI++LLQ+NG EI+++NQS   DR  HKIIAQ+VGEG   EG+  ERICETVKKFVS+YK+ QYT+
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XP_004146605.1 transcription factor bHLH162 isoform X1 [Cucumis sativus]2.8e-5260.62Show/hide
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        PI    + +++RK +ERNRR EM AL STL+SL+PN +S  E  +TVPDQLE+ATNYIKELQ  ++KLKEK+EKL+G+   E+           +E KP+
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        LS + +K HQ+GSS+E+ LTTGSDYHF   Q+LRLLQ NGAEILNVNQSMFTDRV HKI AQV GEG    G D ERICETVKK+VS+YK+G+
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XP_008442634.2 PREDICTED: transcription factor bHLH118-like [Cucumis melo]1.3e-5259.9Show/hide
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        PI    + ++DRK +ERNRR EM +L STL+SL+PN +S+ E  +TVPDQLE+ATNYIKELQ  ++KLKEK+E+L+G           GR + R      
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            E KP+L LLQ+K HQ+GSS+E+ LTTGSDYHF+  Q+LRLLQ NGAEILNVNQSMFTDRV HKI AQV GEG  P   D ERIC+TVKKFVSQYK+
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         Q
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XP_022955188.1 uncharacterized protein LOC111457229 [Cucurbita moschata]2.1e-5262Show/hide
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        MAN  IHSPSSA+ DRKLIERNRR EM AL S LHSL+PN SS  E   T+ DQLENATNYIK+L+  VEKLKEK+EKL+ + G E  R        S E
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        IK RL L+Q++ HQVGSS+E LLTT SDYH V  Q+L+LLQ+NG +I+ +N S   DRV HKIIA++VGEG   E  + ERICETVKKFVSQYK+ QY +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LUL3 BHLH domain-containing protein1.3e-5260.62Show/hide
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        PI    + +++RK +ERNRR EM AL STL+SL+PN +S  E  +TVPDQLE+ATNYIKELQ  ++KLKEK+EKL+G+   E+           +E KP+
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        LS + +K HQ+GSS+E+ LTTGSDYHF   Q+LRLLQ NGAEILNVNQSMFTDRV HKI AQV GEG    G D ERICETVKK+VS+YK+G+
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A0A1S3B660 transcription factor bHLH118-like6.1e-5359.9Show/hide
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        PI    + ++DRK +ERNRR EM +L STL+SL+PN +S+ E  +TVPDQLE+ATNYIKELQ  ++KLKEK+E+L+G           GR + R      
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            E KP+L LLQ+K HQ+GSS+E+ LTTGSDYHF+  Q+LRLLQ NGAEILNVNQSMFTDRV HKI AQV GEG  P   D ERIC+TVKKFVSQYK+
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         Q
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A0A6J1GT92 uncharacterized protein LOC1114572291.0e-5262Show/hide
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        MAN  IHSPSSA+ DRKLIERNRR EM AL S LHSL+PN SS  E   T+ DQLENATNYIK+L+  VEKLKEK+EKL+ + G E  R        S E
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        IK RL L+Q++ HQVGSS+E LLTT SDYH V  Q+L+LLQ+NG +I+ +N S   DRV HKIIA++VGEG   E  + ERICETVKKFVSQYK+ QY +
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A0A6J1K2Y3 transcription factor bHLH167-like3.0e-5261Show/hide
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        MAN  IH PSS + DRKLIERNRR EM AL S LHSL+PN SS  E   T+ DQLENATNYIK+L+  VEKLKEKREKL+G R                E
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         K RL L+Q++ HQVGSS+E+LLTTGSDY FV  QIL+LLQ+NG +I+ +N S   DRV HKIIA++VGEG   E +  ERICETVKKFVSQYK+ QY +
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A0A6J1K483 transcription factor bHLH162-like1.8e-5260Show/hide
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        MA+  I+ PSSA+TD+++IERNRR+EM ALLS LHSL+PN +S  EG  T+PDQLENATNYIK+L+  VEKLKEKREKL+G+   EK  I       + E
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         K R+ ++Q++ H VGSS+EILLTTGSDYH V  QI++LLQ+NG EI+++NQS   +R  HKIIAQ+ GEG   EG+  ERICE VKKFVS YK+ QYT+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JIJ7 Transcription factor bHLH1626.1e-1836.53Show/hide
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        P HS +  S   DRK +E+NRR +M +L S L SL+P+ SS E    T+PDQL+ A NYIK+LQ  VEK +E++  L+     EK   + +++ + S ++
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             L +++  + GS   I L T  ++ F+F +I+R+L ++ GAEI +   S+  D V H +  +V
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Q9FLI1 Transcription factor bHLH362.4e-0630.77Show/hide
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        ER RR EM +L ++L SL+P    K  G ++  DQ+  A NYIK LQ K+++L  +R+ L+ + RG       +   + + + K  + ++  K H    Q
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            +EI+L++   G      F+ +L++L + G  +LN   S+  DR+++ I A+V
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Q9LQ08 Transcription factor bHLH1258.5e-0425Show/hide
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        S +   + IER RR E+++L   L +L+P      +G ++  D +  A NYIK+LQ K+++L EKR ++     ++     TTT +  EE    LS    
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Query:  KTHQ-------------------VGSSMEILLTTGSDYHFVFTQILRLLQQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
         T                     VG  + I    G +   + + +  L Q+    +++   +    R +H I++QV
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Q9STJ6 Transcription factor bHLH1269.1e-0623.64Show/hide
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        H     +  +KL    IER RR EM  L +TL + +P    K  G + V D +  A N+IK+ + ++++L  +R++L    G+  +         S+  K
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Query:  PRLSLLQLKTHQVGSSMEILLTTGSDYHFVFTQILRLLQQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
           + + ++ H  G  + +   +        +++L  +Q+ G E+++   +   DR++H I  +V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12540.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein7.9e-0525.9Show/hide
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        P + R   K +ER RR E  +L   L  L+P  S   +G ++  D +  A NYIK+LQ K++++ EKR+++         RG    R + ++T CS    
Subjt:  PSSARTDRKLIERNRRNEMNALLSTLHSLIPNLSSKEEGAKTVPDQLENATNYIKELQTKVEKLKEKREKLL------GIRGREKERIITTTTACSEEIK

Query:  PRLSLLQLKTHQVGSSMEILLTTGSDYHFVFTQILRLL-QQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
          ++++ ++   +G  +EI+++  + +    + +L+LL Q+    I++   +      +H I ++V
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AT1G62975.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.1e-0525Show/hide
Query:  SARTDRKLIERNRRNEMNALLSTLHSLIPNLSSKEEGAKTVPDQLENATNYIKELQTKVEKLKEKREKLLGIRGREKERIITTTTACSEEIKPRLSLLQL
        S +   + IER RR E+++L   L +L+P      +G ++  D +  A NYIK+LQ K+++L EKR ++     ++     TTT +  EE    LS    
Subjt:  SARTDRKLIERNRRNEMNALLSTLHSLIPNLSSKEEGAKTVPDQLENATNYIKELQTKVEKLKEKREKLLGIRGREKERIITTTTACSEEIKPRLSLLQL

Query:  KTHQ-------------------VGSSMEILLTTGSDYHFVFTQILRLLQQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
         T                     VG  + I    G +   + + +  L Q+    +++   +    R +H I++QV
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AT4G20970.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.3e-1936.53Show/hide
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        P HS +  S   DRK +E+NRR +M +L S L SL+P+ SS E    T+PDQL+ A NYIK+LQ  VEK +E++  L+     EK   + +++ + S ++
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Query:  KPRLSLLQLKTHQVGSSMEILLTTGSDYHFVFTQILRLL-QQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
             L +++  + GS   I L T  ++ F+F +I+R+L ++ GAEI +   S+  D V H +  +V
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AT4G25410.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.5e-0723.64Show/hide
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        H     +  +KL    IER RR EM  L +TL + +P    K  G + V D +  A N+IK+ + ++++L  +R++L    G+  +         S+  K
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Query:  PRLSLLQLKTHQVGSSMEILLTTGSDYHFVFTQILRLLQQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
           + + ++ H  G  + +   +        +++L  +Q+ G E+++   +   DR++H I  +V
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AT5G51780.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.7e-0730.77Show/hide
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        ER RR EM +L ++L SL+P    K  G ++  DQ+  A NYIK LQ K+++L  +R+ L+ + RG       +   + + + K  + ++  K H    Q
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Query:  VGSSMEILLTT---GSDYHFVFTQILRLLQQNGAEILNVNQSMFTDRVLHKIIAQV
            +EI+L++   G      F+ +L++L + G  +LN   S+  DR+++ I A+V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAACATCCCAATCCATTCTCCATCATCAGCAAGAACCGACCGAAAACTCATAGAGAGAAATAGAAGAAACGAAATGAATGCCCTTTTGTCCACGCTCCATTCTCT
TATCCCCAACCTAAGTTCAAAGGAAGAAGGTGCTAAAACGGTGCCGGATCAGCTAGAAAACGCCACAAATTACATAAAAGAACTGCAGACGAAGGTGGAGAAGTTGAAAG
AGAAGAGAGAGAAGCTGCTGGGAATTAGGGGAAGAGAAAAAGAAAGAATAATTACAACTACAACAGCATGCAGTGAAGAAATTAAACCAAGATTATCATTGCTGCAACTT
AAAACTCATCAAGTGGGTTCTTCAATGGAGATCCTTTTGACCACTGGATCCGATTACCACTTTGTTTTCACACAGATCCTTCGCCTTCTTCAACAAAATGGAGCTGAAAT
CCTCAATGTCAACCAGTCCATGTTCACTGATCGGGTTCTTCACAAGATCATAGCTCAGGTGGTTGGAGAAGGGAGGGCTCCCGAAGGCAGTGACAGTGAAAGGATTTGTG
AGACTGTGAAGAAGTTTGTTTCACAGTACAAAGAAGGCCAATACACTCTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAACATCCCAATCCATTCTCCATCATCAGCAAGAACCGACCGAAAACTCATAGAGAGAAATAGAAGAAACGAAATGAATGCCCTTTTGTCCACGCTCCATTCTCT
TATCCCCAACCTAAGTTCAAAGGAAGAAGGTGCTAAAACGGTGCCGGATCAGCTAGAAAACGCCACAAATTACATAAAAGAACTGCAGACGAAGGTGGAGAAGTTGAAAG
AGAAGAGAGAGAAGCTGCTGGGAATTAGGGGAAGAGAAAAAGAAAGAATAATTACAACTACAACAGCATGCAGTGAAGAAATTAAACCAAGATTATCATTGCTGCAACTT
AAAACTCATCAAGTGGGTTCTTCAATGGAGATCCTTTTGACCACTGGATCCGATTACCACTTTGTTTTCACACAGATCCTTCGCCTTCTTCAACAAAATGGAGCTGAAAT
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AGACTGTGAAGAAGTTTGTTTCACAGTACAAAGAAGGCCAATACACTCTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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