; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0024934 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0024934
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionVQ motif containing protein
Genome locationchr10:7119944..7120732
RNA-Seq ExpressionLag0024934
SyntenyLag0024934
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-10883.33Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.1e-10882.95Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]9.8e-11487.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X21.7e-10883.27Show/hide
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A0A6J1CGC6 VQ motif-containing protein 4-like isoform X16.6e-11689.69Show/hide
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A0A6J1CHL5 VQ motif-containing protein 4-like isoform X25.6e-11589.31Show/hide
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like6.6e-10882.58Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like2.3e-10882.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 137.0e-3047.72Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P        S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         +S
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        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  S
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Q5M750 VQ motif-containing protein 43.4e-6157.2Show/hide
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        ME S  + E    ++L+PSP    + NS   SSS+ ++        PP TP   +         TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K
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          S+ KP       D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLI
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        PDPFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 334.4e-3244.8Show/hide
Query:  SSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQ-QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP
        S+S+ +S   Q+  PPP    P+ Q Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTG S +T      +  S  +N++  S   IPPIK   
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Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPLIPVFASTGNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  + GNS       FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
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Query:  SYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 318.6e-1234.78Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLN-KLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILS
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG P     A+A P +      +V K+ I        +++   KL+ERR  +  KL+I      F  TG +  S      L 
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Query:  PSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPG
         S +  P+   S ++ +  +P               +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 192.1e-3446.15Show/hide
Query:  ITTNSSSSSSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPP
        I+TN  SSSSS+ +S+ +                LH    ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P +  S   +     IPP
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Query:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN
        IK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN L+      G+  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+           
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Query:  GNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
                 EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein2.4e-6257.2Show/hide
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        ME S  + E    ++L+PSP    + NS   SSS+ ++        PP TP   +         TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K
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Query:  QASA-KPASGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLI
          S+ KP       D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLI
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Query:  PDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSTS
        PDPFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein3.0e-6056.82Show/hide
Query:  METSSIHHENPSPSSLLPSPTSRITTNSSSSSSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAK
        ME S  + E    ++L+PSP    + NS   SSS+ ++        PP TP   +         TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K
Subjt:  METSSIHHENPSPSSLLPSPTSRITTNSSSSSSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAK

Query:  QASA-KPASGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLI
          S+ KP       D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLI
Subjt:  QASA-KPASGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLI

Query:  PDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        PDPFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  PDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein4.9e-3147.72Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPLIPVFASTGNS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P        S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         +S
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPLIPVFASTGNS

Query:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSS
        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  S
Subjt:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein1.5e-3546.15Show/hide
Query:  ITTNSSSSSSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPP
        I+TN  SSSSS+ +S+ +                LH    ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P +  S   +     IPP
Subjt:  ITTNSSSSSSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPP

Query:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN
        IK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN L+      G+  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+           
Subjt:  IKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKN

Query:  GNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
                 EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  GNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein3.1e-3344.8Show/hide
Query:  SSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQ-QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP
        S+S+ +S   Q+  PPP    P+ Q Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTG S +T      +  S  +N++  S   IPPIK   
Subjt:  SSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQ-QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPASGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP

Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPLIPVFASTGNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  + GNS       FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPLIPVFASTGNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  SYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCGATTCACCATGAAAACCCATCTCCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAACCAGCCGCATCACCACCAACAGCAGTAGCAGTAGCAGCAGCACCAGCAC
CAGCAATGGAGTCCAACTCATGCCTCCACCGCCCCCGACTCCGCCGCCTCAATTGCAGCAATTGCACTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAGTCCGTCAACCCTTACC
CCACTACCTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCTTTCAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCCGCCAAGCCAGCTTCCGGTGGT
TCCAACTCTGATTCCGTCTCCAAATCGCACATTCCGCCCATTAAATCCTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAGCT
TAAAATTAACCCGTTGATTCCGGTTTTTGCTTCGACTGGTAATTCCGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAGATTCTTTCTCCGAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTC
TCAGTCCGGTCACACCGCTAATTCCCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCGAAGATGGATGCTGAGGCGGAAGAGAAA
GCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGGGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCTCTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTTCCAGG
TTCATCTTCCACTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACCTCTTCGATTCACCATGAAAACCCATCTCCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAACCAGCCGCATCACCACCAACAGCAGTAGCAGTAGCAGCAGCACCAGCAC
CAGCAATGGAGTCCAACTCATGCCTCCACCGCCCCCGACTCCGCCGCCTCAATTGCAGCAATTGCACTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAGTCCGTCAACCCTTACC
CCACTACCTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCTTTCAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCCGCCAAGCCAGCTTCCGGTGGT
TCCAACTCTGATTCCGTCTCCAAATCGCACATTCCGCCCATTAAATCCTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAGCT
TAAAATTAACCCGTTGATTCCGGTTTTTGCTTCGACTGGTAATTCCGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAGATTCTTTCTCCGAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTC
TCAGTCCGGTCACACCGCTAATTCCCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCGAAGATGGATGCTGAGGCGGAAGAGAAA
GCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGGGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCTCTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTTCCAGG
TTCATCTTCCACTTCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSIHHENPSPSSLLPSPTSRITTNSSSSSSSTSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPASGG
SNSDSVSKSHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEK
AIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSTS