; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0025056 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025056
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationchr10:8153485..8154676
RNA-Seq ExpressionLag0025056
SyntenyLag0025056
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]1.0e-7393.08Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKSIATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLT+LAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_022140126.1 uncharacterized protein LOC111010860 [Momordica charantia]9.6e-7291.82Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLT+LAMGFACKEI LDFR+TRLITMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_023001482.1 uncharacterized protein LOC111495604 [Cucurbita maxima]4.7e-7193.51Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LT+LAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_023519488.1 membrane protein PM19L-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-7092.86Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK IATLLLLLNFCM+AVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAAS+ISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
         AW+LT+LAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]6.0e-7493.71Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKS+ATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        S+AAVFAWTLT+LAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYI+AIHGAVSTR
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein1.1e-7090.57Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKS ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLT+LAMGFA KEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108604.6e-7291.82Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLT+LAMGFACKEI LDFR+TRLITMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1EI31 uncharacterized protein LOC1114342861.6e-6992.21Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIR WSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LT+LAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAV  R
Subjt:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956042.3e-7193.51Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LT+LAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A5Y734 AWPM19-like protein4.9e-7493.08Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA TQMKSIATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLT+LAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L3.2e-2243.45Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTLTV
        LL+LN  MY +++G   W +N  I +G    PG+             GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A SL A +++A+ AW +T 
Subjt:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTLTV

Query:  LAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        LA G ACKEI +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +HG +
Subjt:  LAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein1.9e-2544.72Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA T  ++IA  LL LN  MY ++LG   W +N  I+       G      F       GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVSTR
         ++++ AW +T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+M IH G++S++
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVSTR

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein1.2e-5673.38Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA  Q+K +A+ LL+LNFCMY ++LGIGGWAMN AIDHGF +GP L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  SL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
        ++AA  AWTLTVLAMGFA KEI L  RN +L TMEAF IILS TQL+YI A+HG
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein6.9e-2844.87Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA    KS A +LL+LN  +Y VI  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        +++++ +W+LT+LAMG ACKEI + +    L T+E   II+SATQL+   AIH  V
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein1.6e-5368.18Show/hide
Query:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        M + QMK +A+ LL+LNFCMYA++LGIG W+MN AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  SL AA
Subjt:  MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
         SAA  AW+LT+LAMGF CKEI L  RN RL TMEAF IILSATQL+YI AI+G
Subjt:  SSAAVFAWTLTVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGATACACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTTATTTTGGGCATTGGTGGCTGGGCCATGAACACTGCAATTGA
TCATGGATTCATCATTGGTCCCGGGCTTCGACTACCGGCGCATTTTTCACCGATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGGACTGAACCATATTCGCTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGTGCTGCTTCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTGTCCTTGCCATGGGGTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTGGATTTCAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCTTTCTTCATTATTCTCTCAGCTACACAGCTTGT
TTACATCATGGCCATCCATGGTGCTGTTTCCACAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGATACACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTTATTTTGGGCATTGGTGGCTGGGCCATGAACACTGCAATTGA
TCATGGATTCATCATTGGTCCCGGGCTTCGACTACCGGCGCATTTTTCACCGATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGGACTGAACCATATTCGCTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGTGCTGCTTCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTGTCCTTGCCATGGGGTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTGGATTTCAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCTTTCTTCATTATTCTCTCAGCTACACAGCTTGT
TTACATCATGGCCATCCATGGTGCTGTTTCCACAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTL
TVLAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR