; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0025338 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025338
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationchr10:11556082..11560792
RNA-Seq ExpressionLag0025338
SyntenyLag0025338
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-14697.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein5.4e-14596.35Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like1.7e-14697.08Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like1.7e-14697.08Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 568.4e-14696.36Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like6.4e-14697.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B4.5e-1125.11Show/hide
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        L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST++AI  S +S+Y +++++   +   +      +S +S FI      YF+ D  +  +    L     ++
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        HH+++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L    +K    Y++NG++IF  +++ R+     T + V     HY  +    +I + + F
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          P +  ++NL W   I K + K
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A2.6e-1124.4Show/hide
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        D  + Y  V G  L  +L++  ++  +   Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ GY
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         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  RS    LLNG+ +   + + RI +    +  
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        V+  +  +  I++ +   V       VL ++N+ W  KI +G  K +  +
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B9.6e-1428.37Show/hide
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        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LII+ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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Query:  FGKIVKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 41.9e-1426.98Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNL
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A ++NGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKIVKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
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Q96MV1 TLC domain-containing protein 47.3e-1428.76Show/hide
Query:  FYFKSYLGLTKI----------QRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLY-FVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGM
        FYF SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY F+F     +D    G       +L+   + I+ GY ++DL +II  +  +G  
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Query:  EYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLLNGIVIFFAWLVARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGY
         +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A ++NGI++   + + RI  +L  Y F +     +  I++ V+  
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Query:  VLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        +       VL +MN+MW  KI KG +K IS  R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.3e-11473.8Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
Subjt:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ

Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLL
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
Subjt:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLL

Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GYVLVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.3e-11473.8Show/hide
Query:  SLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQ
        SL+T+ AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLL
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GYVLVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-6550.42Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY LNGI +F  WLVAR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK +
Subjt:  KMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein4.4e-10771.64Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein4.4e-10771.64Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GY+LVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTGATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTGGTAAAGAACTACTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACCTCTGT
CCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCGGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCATCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTAGCCTATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGCTTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATGTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACCT
GATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATTTCGAAGAGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGTCTTTGAAGACTGTGATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTGGTAAAGAACTACTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACCTCTGT
CCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGATACTTCTTGGCGGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCATCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTAGCCTATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATCTGCTTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGTTACACATTCTATCATGTTTACCTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATGTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACCT
GATGTGGTTCGGGAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATTTCGAAGAGGCGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLKTVMAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLLNGIVIFFAWLVARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYVLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKRR