; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0025451 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025451
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionChitinase
Genome locationchr10:13181223..13183037
RNA-Seq ExpressionLag0025451
SyntenyLag0025451
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_023813558.1 soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D isoform X1 [Oryzias latipes]3.7e-0648.84Show/hide
Query:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL
        PPS+K   PS  V    S A SPS+K  LS AP  S +  LS  PSP      S APSPS+K  LS  PSPS+      APS S+K  LST PSPS+   
Subjt:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL

Query:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP
        LST PSPS+   LS  P PS+  L S  P
Subjt:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP

XP_023813559.1 soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D isoform X2 [Oryzias latipes]3.7e-0648.84Show/hide
Query:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL
        PPS+K   PS  V    S A SPS+K  LS AP  S +  LS  PSP      S APSPS+K  LS  PSPS+      APS S+K  LST PSPS+   
Subjt:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL

Query:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP
        LST PSPS+   LS  P PS+  L S  P
Subjt:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP

XP_023813560.1 early nodulin-like protein 2 isoform X3 [Oryzias latipes]3.7e-0648.84Show/hide
Query:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL
        PPS+K   PS  V    S A SPS+K  LS AP  S +  LS  PSP      S APSPS+K  LS  PSPS+      APS S+K  LST PSPS+   
Subjt:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL

Query:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP
        LST PSPS+   LS  P PS+  L S  P
Subjt:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP

XP_023813561.1 proline-rich receptor-like protein kinase PERK9 isoform X4 [Oryzias latipes]3.7e-0648.84Show/hide
Query:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL
        PPS+K   PS  V    S A SPS+K  LS AP  S +  LS  PSP      S APSPS+K  LS  PSPS+      APS S+K  LST PSPS+   
Subjt:  PPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKAL

Query:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP
        LST PSPS+   LS  P PS+  L S  P
Subjt:  LSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPP

XP_031027822.1 uncharacterized protein SmJEL517_g00105 [Synchytrium microbalum]4.4e-0747.37Show/hide
Query:  SPSSKALLSAAPSPSLKAL-LSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPS
        SP +  + SAAPSP    +  SAAPSP +  L S APSP +  L SAAPSP    L SAAPSP +  L S APSP +  L S APSP +  L S  P P 
Subjt:  SPSSKALLSAAPSPSLKAL-LSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPS

Query:  SKVLLSTPPFEGSP
        +  L S  P   +P
Subjt:  SKVLLSTPPFEGSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0F7V8R5 RNA helicase, putative2.6e-0551.97Show/hide
Query:  PSSKFLPPSSKVPSRASL--ALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKA
        P+S    P+S   S  SL  A SPSS   LS A SPS    LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPS    LS A SPSS   LS A SPSS  
Subjt:  PSSKFLPPSSKVPSRASL--ALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKA

Query:  LLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLS
         LS A SPSS   LS    PSS   LS
Subjt:  LLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLS

A0A507CAM6 Uncharacterized protein2.1e-0747.37Show/hide
Query:  SPSSKALLSAAPSPSLKAL-LSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPS
        SP +  + SAAPSP    +  SAAPSP +  L S APSP +  L SAAPSP    L SAAPSP +  L S APSP +  L S APSP +  L S  P P 
Subjt:  SPSSKALLSAAPSPSLKAL-LSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPS

Query:  SKVLLSTPPFEGSP
        +  L S  P   +P
Subjt:  SKVLLSTPPFEGSP

A0A7C8H5H8 Chitinase5.2e-0638.35Show/hide
Query:  SSFSPSTKVLSSKSKVLSRCFAAFLPPSSKVFMRFAAVPSLQVQRFSRASVKFLPPKLKVLTRFAAVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFAAVPSSL
        SS S S+   SS S   S   ++    SS V       P+      S +S         V +   AV SS    + +   +  S +S  ++   A  SS 
Subjt:  SSFSPSTKVLSSKSKVLSRCFAAFLPPSSKVFMRFAAVPSLQVQRFSRASVKFLPPKLKVLTRFAAVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFAAVPSSL

Query:  SLKVLTRCASLQFLP-PSSKVLRRFAAQFLPPSSKFLPPSS----KVPSRASLAL----SPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK
        +++  TR +  +  P PSS  +    +   P       PSS      PS +S A+    SPSS A++S  PSPS  A++S  PSPSS A++ST PSPSS 
Subjt:  SLKVLTRCASLQFLP-PSSKVLRRFAAQFLPPSSKFLPPSS----KVPSRASLAL----SPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSK

Query:  ALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTP
        A++S  PSPS  A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++ST PSPSS A++ST P PSS  ++STP
Subjt:  ALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTP

S8G1F0 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase7.5e-0534.93Show/hide
Query:  PSLQVQRFSRASVKFLPPKLKVLTRFAAVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFAAVPSSL----SLKVLTRCASLQFLPPSSKVLRRFAAQFLPPSSK
        PSL    + R+S    P +     R++  P S    S   R   F    +     +   SS     SL+ + R  S+     SS +    A+   PP   
Subjt:  PSLQVQRFSRASVKFLPPKLKVLTRFAAVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFAAVPSSL----SLKVLTRCASLQFLPPSSKVLRRFAAQFLPPSSK

Query:  F----LPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSA---------APSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTA
        F    L  SS +P     ++SP + A L +         +PS S  +  S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPS  A  S++PSPSS A  S++
Subjt:  F----LPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSA---------APSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTA

Query:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPSS
        PSPSS A  S++PSPSS A  S+ PF SS
Subjt:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPSS

V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)2.6e-0551.97Show/hide
Query:  PSSKFLPPSSKVPSRASL--ALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKA
        P+S    P+S   S  SL  A SPSS   LS A SPS    LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPS    LS A SPSS   LS A SPSS  
Subjt:  PSSKFLPPSSKVPSRASL--ALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKA

Query:  LLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLS
         LS A SPSS   LS    PSS   LS
Subjt:  LLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACAACTTGGAGTTGAAACTTTTCGATGAAGTAAACAGTGACAAGAAGCTTCATAGTAGCATCCCGTCACGTATGAAGAGGAAGTTTTCTGTTCTCATAAATACGGA
AGGTTCCTTGAAGGATCTGATCAAGACCATGACAAAGATAAGAGCTTTTAAATGTAAAAGCTCCTTATCGCAAGAGCCTAAACTGCATGATGCTCCTAGCCCACACGAGC
TTAAAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGCTGCGATGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGTGTTCCGCTACAGTTCCTTCTCTCCA
AGTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCTCACGTTGCTTCGCTGCATTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGCGCTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCA
AGTTCAAAGGTTCTCACGTGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCCAAGTTGAAGGTTCTTACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTC
GCTGCAGTTTCTTCTCCCTAACTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCCTAAGTTTGAAGGTTCTCACGCGCTGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCT
CCAAGTTCGAAGGTTCTCAGGCGCTTCGCTGCGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCCCTCACGGGCTTCGCTCGCTCTTTCTCC
AAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAA
GTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGT
TCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGTTCCTTTTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCCTTTTGAAGGTTC
GCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCATTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCTCGTTCCACTCCATCTTCAAATGTTGGCAGTTG
ACGGCGTCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACAACTTGGAGTTGAAACTTTTCGATGAAGTAAACAGTGACAAGAAGCTTCATAGTAGCATCCCGTCACGTATGAAGAGGAAGTTTTCTGTTCTCATAAATACGGA
AGGTTCCTTGAAGGATCTGATCAAGACCATGACAAAGATAAGAGCTTTTAAATGTAAAAGCTCCTTATCGCAAGAGCCTAAACTGCATGATGCTCCTAGCCCACACGAGC
TTAAAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGCTGCGATGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGTGTTCCGCTACAGTTCCTTCTCTCCA
AGTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCTCACGTTGCTTCGCTGCATTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGCGCTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCA
AGTTCAAAGGTTCTCACGTGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCCAAGTTGAAGGTTCTTACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTC
GCTGCAGTTTCTTCTCCCTAACTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCCTAAGTTTGAAGGTTCTCACGCGCTGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCT
CCAAGTTCGAAGGTTCTCAGGCGCTTCGCTGCGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCCCTCACGGGCTTCGCTCGCTCTTTCTCC
AAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAA
GTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGT
TCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTACTGTTCCTTTTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCCTTTTGAAGGTTC
GCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCATTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCTCGTTCCACTCCATCTTCAAATGTTGGCAGTTG
ACGGCGTCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNNLELKLFDEVNSDKKLHSSIPSRMKRKFSVLINTEGSLKDLIKTMTKIRAFKCKSSLSQEPKLHDAPSPHELKRCSFSKFEGSYIAAMQFLLSKFKGSHVFRYSSFSP
STKVLSSKSKVLSRCFAAFLPPSSKVFMRFAAVPSLQVQRFSRASVKFLPPKLKVLTRFAAVPSSKFEGSHTLRCSFFSLTSKVLTRFAAVPSSLSLKVLTRCASLQFLP
PSSKVLRRFAAQFLPPSSKFLPPSSKVPSRASLALSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSLKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPS
SKALLSTAPSPSSKALLSTVPFPSSKVLLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLIFKCLAAVDSLVPLHLQMLAVDGVRCASSSNVGS