; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0025486 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025486
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionphosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C
Genome locationchr10:13774714..13776570
RNA-Seq ExpressionLag0025486
SyntenyLag0025486
Gene Ontology termsGO:0006506 - GPI anchor biosynthetic process (biological process)
GO:0009846 - pollen germination (biological process)
GO:0009860 - pollen tube growth (biological process)
GO:0000506 - glycosylphosphatidylinositol-N-acetylglucosaminyltransferase (GPI-GnT) complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016757 - transferase activity, transferring glycosyl groups (molecular function)
InterPro domainsIPR009450 - Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012630.1 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-10793.75Show/hide
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XP_022142664.1 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C [Momordica charantia]3.0e-10793.75Show/hide
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XP_022925309.1 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C [Cucurbita moschata]7.8e-10894.2Show/hide
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XP_023521105.1 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-10793.75Show/hide
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XP_038894273.1 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C [Benincasa hispida]5.9e-10889.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTI6 Uncharacterized protein2.4e-10793.3Show/hide
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A0A1S4E2Z6 putative phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C1.0e-10587.82Show/hide
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        RLPSR HVFAIMLFSLQ+FLFAPL +    Y  +  SL
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A0A6J1CM44 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C1.4e-10793.75Show/hide
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A0A6J1EBS9 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C3.8e-10894.2Show/hide
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A0A6J1K0F6 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C3.8e-10894.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64761 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C2.4e-8880.66Show/hide
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        PKWRKVAYGGMQ G+DDN+TDESFLE++VMNANVV+RD+LKVM DS+SIS+YLCIV LV LVW +TL S+L+ENSLL LD+ LL SGFLILL TE+  LS
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        LSLLL Y +NISFFTTGLY+LAPIYQTLTRSISSDSIWA+TVSL++LHLFLHDYSGST+RAPG LK P+LTSCIS+NASIVASV +ASRLPSRLHVFA+M
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        LFSLQ+FLFAPL
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Q54M40 Putative phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C2.2e-2835.75Show/hide
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        + N  + +   KW+K  Y   QP + DN+TDE+FL  +V NAN +K D   V+LDS ++S+ +  V L  +++ ++L+ TL    L+ +  G L  G++ 
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Query:  LLFTEDTLSLSLLLHYFLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLP
        ++  + + +   +   FL+I      +Y L+P+ +TLT S S D+IWALT  L++ HLF HDY G T     + ++   ++ +SLNA+I ASVL+ SRLP
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Query:  SRLHVFAIMLFSLQIFLFAPL
        S +HVF ++ ++++ F   P+
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Q5PQQ4 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C2.3e-1431.8Show/hide
Query:  TQPKWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDIVMNANVVKRDILKVMLDSISISEYLCIVTLVGLVWTYTLRSTLNENSLL--CLDVGLLGSGFLILLFTED
        ++ KW+KV Y   QP F DN+ D+ FLE++  N    K     V+ +S  + + LC V +  ++W Y     L    L    L   L+G     L+   D
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Query:  TLSLSLLLHY--FLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLH
            S    +    +   F T  Y  +P+ +TLT S+S+D+I+A++V +++ HL   DY  +            ++S +SLN +I ASV +ASRLP  LH
Subjt:  TLSLSLLLHY--FLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLH

Query:  VFAIMLFSLQIFLFAPL
         F ++ F++QIF   P+
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Q92535 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C1.4e-1432.24Show/hide
Query:  KWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDIVMNANVVKRDILKVMLDSISISEYLCIVTLVGLVWTYTLRSTLNENSLL--CLDVGLLGSGFLILLFTEDTLS
        KW+KV Y   QP F DN+ D  FLE++  N +  K     V+ +S  + + LC V +  ++W Y     L  + LL   L   L+G     L+   +   
Subjt:  KWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDIVMNANVVKRDILKVMLDSISISEYLCIVTLVGLVWTYTLRSTLNENSLL--CLDVGLLGSGFLILLFTEDTLS

Query:  LSLLLHY--FLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLHVFA
         S    +    +   F T  Y  +P+ +TLT S+S+D+I+A++V +++ HL   DY  +            ++S +SLN +I ASV +ASRLP  LH F 
Subjt:  LSLLLHY--FLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLHVFA

Query:  IMLFSLQIFLFAPL
        ++ F++QIF   P+
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Q9CXR4 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit C4.0e-1432.24Show/hide
Query:  KWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDIVMNANVVKRDILKVMLDSISISEYLCIVTLVGLVWTYTLRSTLNENSLL--CLDVGLLGSGFLILLFTEDTLS
        KW+KV Y   QP F DN+ D+ FLE++  N    K     V+ +S  + + LC V +  ++W Y     L    L    L   L+G     L+   D   
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Query:  LSLLLHY--FLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLHVFA
         S    +    +   F T  Y  +P+ +TLT S+S+D+I+A+ V +++ HL   DY  +            ++S +SLN +I ASV +ASRLP  LH F 
Subjt:  LSLLLHY--FLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLHVFA

Query:  IMLFSLQIFLFAPL
        ++ F++QIF   P+
Subjt:  IMLFSLQIFLFAPL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34980.1 phosphatidylinositolglycan synthase family protein1.7e-8980.66Show/hide
Query:  PKWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDIVMNANVVKRDILKVMLDSISISEYLCIVTLVGLVWTYTLRSTLNENSLLCLDVGLLGSGFLILLFTED-TLS
        PKWRKVAYGGMQ G+DDN+TDESFLE++VMNANVV+RD+LKVM DS+SIS+YLCIV LV LVW +TL S+L+ENSLL LD+ LL SGFLILL TE+  LS
Subjt:  PKWRKVAYGGMQPGFDDNHTDESFLEDIVMNANVVKRDILKVMLDSISISEYLCIVTLVGLVWTYTLRSTLNENSLLCLDVGLLGSGFLILLFTED-TLS

Query:  LSLLLHYFLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLHVFAIM
        LSLLL Y +NISFFTTGLY+LAPIYQTLTRSISSDSIWA+TVSL++LHLFLHDYSGST+RAPG LK P+LTSCIS+NASIVASV +ASRLPSRLHVFA+M
Subjt:  LSLLLHYFLNISFFTTGLYVLAPIYQTLTRSISSDSIWALTVSLIILHLFLHDYSGSTVRAPGDLKNPSLTSCISLNASIVASVLIASRLPSRLHVFAIM

Query:  LFSLQIFLFAPL
        LFSLQ+FLFAPL
Subjt:  LFSLQIFLFAPL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTTTAGCACTAATGAAGGCAGTTATCACACTCAACCCAAGTGGAGAAAAGTGGCATATGGAGGGATGCAACCTGGGTTTGATGACAACCATACCGATGAGTCTTT
TCTTGAAGATATTGTCATGAATGCCAATGTCGTCAAGAGAGATATCCTAAAGGTGATGTTGGACTCAATTTCTATCTCCGAATATCTGTGTATTGTCACCCTTGTTGGCC
TGGTTTGGACATACACACTTAGATCGACTCTTAATGAGAATTCCCTCTTATGTCTCGACGTTGGTCTTCTTGGTTCAGGATTTCTAATTCTTCTTTTCACTGAAGACACT
CTCTCATTGAGCCTTCTCTTGCACTATTTTCTCAATATATCCTTTTTCACAACTGGGTTGTATGTCTTGGCTCCCATCTACCAAACTCTCACTAGATCCATTAGCTCAGA
TTCCATTTGGGCATTGACTGTTTCGCTCATTATCCTCCATCTCTTCCTACATGACTACTCAGGTTCCACTGTTAGGGCTCCTGGGGATCTTAAGAATCCAAGCTTAACCA
GTTGCATTTCTTTAAATGCTTCTATTGTGGCCTCTGTTCTTATTGCTTCACGTCTTCCATCTCGGTTGCATGTGTTCGCCATAATGTTGTTCTCCTTACAAATTTTCCTT
TTTGCTCCACTGTCTGTCCTTGTTGGCTCATACGAATTCAGGAATTTAAGTTTGAGATCAATGGTCCCTGGGATGAGGCCAAGCTTTGTTTTGATATCAGAGATTGAGAT
TCTGTATAGAAAGGCCAAAGTTCAACCATACTGTTGCTCCCCTCCTTTGAAGCTTCATCTTGCTGTTGAAGCTTCGATTTCCCTCTTCTCCCTCATAGTTAAAGTCAAAC
CCACGTTGTTGCTCACCTCCATTGAAGCTTTGATTCGTCGTACCACTCCTCTCCGTTGTGTCATCGCTTCAGTCATGTCGTCATCGTTGCTTCAGTCGTGTCGTTCCTTT
CCCTTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTTTAGCACTAATGAAGGCAGTTATCACACTCAACCCAAGTGGAGAAAAGTGGCATATGGAGGGATGCAACCTGGGTTTGATGACAACCATACCGATGAGTCTTT
TCTTGAAGATATTGTCATGAATGCCAATGTCGTCAAGAGAGATATCCTAAAGGTGATGTTGGACTCAATTTCTATCTCCGAATATCTGTGTATTGTCACCCTTGTTGGCC
TGGTTTGGACATACACACTTAGATCGACTCTTAATGAGAATTCCCTCTTATGTCTCGACGTTGGTCTTCTTGGTTCAGGATTTCTAATTCTTCTTTTCACTGAAGACACT
CTCTCATTGAGCCTTCTCTTGCACTATTTTCTCAATATATCCTTTTTCACAACTGGGTTGTATGTCTTGGCTCCCATCTACCAAACTCTCACTAGATCCATTAGCTCAGA
TTCCATTTGGGCATTGACTGTTTCGCTCATTATCCTCCATCTCTTCCTACATGACTACTCAGGTTCCACTGTTAGGGCTCCTGGGGATCTTAAGAATCCAAGCTTAACCA
GTTGCATTTCTTTAAATGCTTCTATTGTGGCCTCTGTTCTTATTGCTTCACGTCTTCCATCTCGGTTGCATGTGTTCGCCATAATGTTGTTCTCCTTACAAATTTTCCTT
TTTGCTCCACTGTCTGTCCTTGTTGGCTCATACGAATTCAGGAATTTAAGTTTGAGATCAATGGTCCCTGGGATGAGGCCAAGCTTTGTTTTGATATCAGAGATTGAGAT
TCTGTATAGAAAGGCCAAAGTTCAACCATACTGTTGCTCCCCTCCTTTGAAGCTTCATCTTGCTGTTGAAGCTTCGATTTCCCTCTTCTCCCTCATAGTTAAAGTCAAAC
CCACGTTGTTGCTCACCTCCATTGAAGCTTTGATTCGTCGTACCACTCCTCTCCGTTGTGTCATCGCTTCAGTCATGTCGTCATCGTTGCTTCAGTCGTGTCGTTCCTTT
CCCTTCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PF