; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0025673 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025673
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr10:17606993..17608581
RNA-Seq ExpressionLag0025673
SyntenyLag0025673
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG9328199.1 hypothetical protein JZ751_015864, partial [Albula glossodonta]2.3e-0430.91Show/hide
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        R  S R A   +  F G H  R  S  P   +  G  +  S  P V  F  TH    A+PS   F G+H+ RSA+PS P F  +H+ R A+PS+  F G+
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        HA R     +         R++L  +P      +   A+PS   F G+H+ R +      FP +    ++L   P   F G+H+ RSA+PS P F G+H+
Subjt:  HALR----YSSFLQIRRFSRASLQFLPPCLKVLTRFVAVPS-SQFEGSHALRCS-----SFPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRSAIPS-PKFEGSHA

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         R A+PS+  F  +H++R        + L  L P S       A+PS +   S        PP    L +   +P
Subjt:  LR-AVPSSK-FEGSHAFRCI------SFLQFLPPSSKVLTRFVAVPSSKFEGSHAFRCSSFPPSLKVLTRFVAVP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
No hits found
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCCGCTGCTGCAGTTCATTCTTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTC
CAAGTTCGAAGGTTATCACGTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGGTCGAAGGTTCTCACGGGCTGCGTTGCAGTTCTTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCACGCACT
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GCTTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGCTATACTGCTACGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTAAATTGTCCCTGCACTCATGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GCTTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGTCCTCATGCTACGCTCGGCTATACTGCTACGCTACTTCCTAAAGTCCAAAGACGTAAATTGTCCCTGCACTCATGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQFLLSKFEGPYTVRYCVVPSPSSKVLRCILLHCSFSKFEGSQLYNCYVVPPPSAKDLMCFAGVSSPQVRRFSRAPLQFLLSKVEGSHSFSPSSKVHALRCSSFSQIRRF
SRASLQFLPPSSKVLRCCSSFFQVRRFSRRFAAVPSSKFEGYHVLRCSSFSPRSKVLTGCVAVLSPQVRRFTHFVAVPSPKFEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAVPSSK
FEGSHALRYSSFLQIRRFSRASLQFLPPCLKVLTRFVAVPSSQFEGSHALRCSSFPPSLKVLTSLRCDPSSKFEGSHALRSAIPSPKFEGSHALRAVPSSKFEGSHAFRC
ISFLQFLPPSSKVLTRFVAVPSSKFEGSHAFRCSSFPPSLKVLTRFVAVPSSKFKSSHALRCSSFPPSSKVLTNFAAVSFSKFEGPHATLGYTAALLPKVQRRQLSSRCA
ASFSKFEGPHATLGYTATLLPKVQRRKLSLHSC