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Lag0025687 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025687
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationchr10:17929086..17929466
RNA-Seq ExpressionLag0025687
SyntenyLag0025687
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB4278097.1 unnamed protein product [Prunus armeniaca]4.2e-2242.97Show/hide
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        R+ + L L+P DPEIERT ++L    +   + +  P+P  EEPKP+R Y  P        I +  I+ANNFE++  +I M    + + G P EDPNSH+ 
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        +FL++C T K NG + DV+H+R+FPFSL
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KAF5458895.1 hypothetical protein F2P56_022888 [Juglans regia]2.1e-2144.88Show/hide
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        MR+ R   + PFDPEIERT   LR +    ++ MA+   + + + ++ Y  PV  +    I    INANNFELK  LI+M +   + GSP++DPN H   
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KAG7990634.1 hypothetical protein I3843_02G035100 [Carya illinoinensis]1.0e-2348.03Show/hide
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        MR+ R   ++P DPEIERT   LR   +  ++ MA  + E  P+ ++ Y +PV       I+   INANNFELK  LI M +   + GSP++DPN HL  
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WP_217833153.1 retrotransposon gag domain-containing protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002]5.1e-2858.47Show/hide
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        L+P DPEI+RTY R     +A L Q      E PK IR YFQP     Q GI+   IN NNFELK GLIQM R+ A+RG   EDP+ HL+SFL+ICGTVK
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XP_022843226.1 uncharacterized protein LOC111366761 [Olea europaea var. sylvestris]6.1e-2146.21Show/hide
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        MR+ R L L+  DPE ERT+  LR       E  A     A     + + IR Y +PV  +   GI    I A NFELK GLI M +   + G+ +EDPN
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        +HL SFL+IC TVK+NGV+ED I +RLF FSL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J0ZX64 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC1104129455.0e-2146.81Show/hide
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        M++   L LVPFDP+IERT+ R R EN   A L Q MA  N           PE  + +R Y  P+ Q     I    INANNFE+K   IQM +    +
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         G P +DPNSHL +FL+IC T K NGV++D I +RLFPFSL
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A0A6J0ZYV0 uncharacterized protein LOC1104134136.6e-2146.81Show/hide
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        M++   L LVPFDP+IERT+ R R EN   A L Q MA  N           PE  + +R Y  P+ Q     I    INANNFE+K   IQM +    +
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A0A6J5UQP9 Retrotrans_gag domain-containing protein2.0e-2242.97Show/hide
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        R+ + L L+P DPEIERT ++L    +   + +  P+P  EEPKP+R Y  P        I +  I+ANNFE++  +I M    + + G P EDPNSH+ 
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A0A6P6W382 uncharacterized protein LOC1137297691.2e-1942.96Show/hide
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        R  RE+A  PFDPEIER   R R               +  LI++        N    + +R +  P  Q  Q  I   ++NANNFE+K  LIQM +   
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A0A6P6X8N4 uncharacterized protein LOC1137407884.3e-2044.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGAAAGGTTAGGGAGTTGGCCTTAGTTCCCTTTGACCCGGAGATAGAGAGAACTTATAATAGACTTCGAATGGAGAACCAAGCAAATCTCATCCAAATGGCCAATCC
TAACCCTGAGGAGCCCAAGCCCATTAGGGCCTATTTTCAGCCGGTCTTTCAGGAGCAACAATTGGGGATTGTCTATGCCCTGATCAATGCTAATAATTTTGAGCTGAAAA
CTGGCCTCATTCAGATGACTCGAGACTGCGCTTATAGAGGATCACCCATAGAGGATCCAAATTCTCACCTGAAATCCTTCCTAGACATCTGTGGGACGGTAAAGTTAAAT
GGAGTTTCCGAAGATGTCATTCACATACGTTTATTTCCTTTTTCTTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGAAAGGTTAGGGAGTTGGCCTTAGTTCCCTTTGACCCGGAGATAGAGAGAACTTATAATAGACTTCGAATGGAGAACCAAGCAAATCTCATCCAAATGGCCAATCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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