; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0025797 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0025797
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationchr10:20779760..20783078
RNA-Seq ExpressionLag0025797
SyntenyLag0025797
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005162 - Retrotransposon gag domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6734747.1 hypothetical protein I3842_01G285500 [Carya illinoinensis]1.5e-5347.92Show/hide
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        M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVKINGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR WLQS+ PGSI +W  + + FL K FPPAKT +LR+EIG F+Q   E
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         L+E WER+K+L+R+CPQH                         A+GGTL+SKT E A  LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+ AG+ E++ ++AL AQ+ 
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        +L++       + L T+R P     V S S ++ S +  Q
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KAG7947748.1 hypothetical protein I3843_14G109500 [Carya illinoinensis]1.5e-5347.92Show/hide
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        M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVKINGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR WLQS+ PGSI +W  + + FL K FPPAKT +LR+EIG F+Q   E
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         L+E WER+K+L+R+CPQH                         A+GGTL+SKT E A  LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+ AG+ E++ ++AL AQ+ 
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Query:  SLANAFMKFSANKLQTKRSPPPIS-VHSVSTMMSSRKKQQ
        +L++       + L T+R P     V S S ++ S +  Q
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WP_217833153.1 retrotransposon gag domain-containing protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002]2.2e-6054.67Show/hide
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        MAR+ A+RG   EDP+ HL+SFL+ICGTVK+NGVS DAI+LRLFPFSLQD+A+DWL++I P SITTW+ L QAFL K FPPAK+ +LRTEIGTF+Q  DE
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        QL+E WER+K+LLR+CPQH                           GG++ SK  + A T+LED+AT SY WP ER S     AAG++EVD+V++L+AQM
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Query:  TSLANAFMKFSANKLQTKRSPPPIS
         SL NA  K +A   Q + +PP I+
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XP_023874613.1 uncharacterized protein LOC111987139 [Quercus suber]2.6e-5348.48Show/hide
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        M +   + GSP +DPN HL  FL+IC T+K+NGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR WLQS+ PGSIT+W  + + FL K FPPAKT +LR+EIG F+Q   E
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         L+E WER+K+L+R CPQH                         A+GGTL+SKT E A +LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+ AG+ E++  +AL AQ+ 
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Query:  SLANAFMKFSANKLQTKRSPPPISVHSVSTM
        SL++       + L T+R P      + S+M
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XP_023903214.1 uncharacterized protein LOC112015077 [Quercus suber]1.2e-5346.86Show/hide
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        M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVK+NGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR WLQS+ PGSIT+W  + + FL K FPPAKT +LR+EIG F+Q   E
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Query:  QLFEGWERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMT
         L+E WER+K+L+R CPQH                         A+GGTL+SKT E A +LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+ AG+ E++  +AL AQ+ 
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Query:  SLANAFMKFSANKLQTKRSPPPISVHSVSTMMSSRKKQQ
        SL++     S  ++   +S   ++  S++  M+   ++Q
Subjt:  SLANAFMKFSANKLQTKRSPPPISVHSVSTMMSSRKKQQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2I4G4Q3 uncharacterized protein LOC1090047127.2e-4944.81Show/hide
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        M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVKINGV+ED IRLRLFPFSL+D+AR WLQS+ P SIT+W  + + F  K FPPAKT +LR+EIG F+Q   E
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         L+E WE +K+L+R+CPQH                          +GGTL+ KT+E A  LLE+MA+N+YQWP ER+  KK+A  + E++ ++AL AQ+ 
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Query:  SLANAFMKFSANKLQTKRSPPPIS--VHSVSTMMSSRKKQQ
        +L++       + L T+R P      V +  T++S+   Q+
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A0A3S3N117 Retrotrans_gag domain-containing protein3.2e-4946.76Show/hide
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        +A    + G P +DPN+H+ +FL++C T K NGV++DA+RLRL PFSL+DKA+ WL S+   +ITTWD L + FL K FPP KTVK+R +I TF Q   E
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Query:  QLFEGWERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMT
         L+E WER+KELLRKCP H                         ATGGTL+ K+ E A  L+E+MATN+YQWPS+   +KKI  GV E+D +SAL AQ+ 
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Query:  SLANAFMKFSANKLQT
        +L+        + +Q+
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A0A6J0ZYV0 uncharacterized protein LOC1104134132.1e-4848.8Show/hide
Query:  YRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDAIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKIFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEGW
        + G P++DPNSHL +FL+IC T K NGV++DAIRLRLFPFSL+DKA+ WL S+  GSITTW+ L Q FL K FPPAKT K+R +I +F Q   E L+E W
Subjt:  YRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDAIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKIFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEGW

Query:  ERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMTSLANAF
        ERFKELLR+CP H                         A GG L+SK   +A  LLE+MA+N+YQWPSERS  +K A G +E+D +  L  Q+ +L+   
Subjt:  ERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMTSLANAF

Query:  MKFSANKLQ
             + +Q
Subjt:  MKFSANKLQ

A0A6J1DU19 uncharacterized protein LOC1110243615.5e-4952.86Show/hide
Query:  MARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDAIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKIFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDE
        M R+  +RG+ TEDPN+HL  FLD+CGTVK+NGV +DAIRLRLFP SLQDK                  +VQAFL   FPPAKT +LRTEI +F++   E
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Query:  QLFEGWERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMT
        QLFE WER+KELLRKCPQH                         A GGTLLS+T ENA  LL+DMA NS+QWPSERS  KK+ AG++E+D++S+L+AQ+ 
Subjt:  QLFEGWERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMT

Query:  SLANAFMKFS
        +L NA  K S
Subjt:  SLANAFMKFS

A0A6P6XAQ1 Reverse transcriptase4.2e-4949.5Show/hide
Query:  MARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDAIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKIFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDE
        M +   Y G+ TEDPNSHL +FL+IC T+K NGVSEDAI+LRLFPFSL+DKA+ WLQS  P + TTWD L +AFL K FPP KT KLR +I +F QQ  E
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Query:  QLFEGWERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMT
         L+E WER++EL R+CP H                         A GG L+ KT E A+ L+E+MA N+YQW +ER   ++  AG+ EVD ++ L A+M 
Subjt:  QLFEGWERFKELLRKCPQH-------------------------ATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMT

Query:  SL
        ++
Subjt:  SL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCGAGATTGTGCTTATAGAGGATCGCCCACCGAGGATCCAAATTCTCATCTTAAATCATTTTTAGATATTTGTGGGACGGTAAAGATTAATGGAGTGTCTGAGGA
TGCTATTCGCTTACGTTTATTTCCCTTTTCTTTGCAGGATAAAGCACGAGATTGGTTGCAGTCTATTACTCCTGGGAGCATCACCACCTGGGATGCTTTGGTCCAGGCCT
TTTTAAAGAAAATTTTCCCTCCTGCAAAGACGGTCAAGCTGAGGACCGAGATTGGGACATTCCAACAACAATATGATGAGCAGTTGTTCGAAGGTTGGGAGCGATTCAAA
GAGCTACTGAGGAAGTGTCCTCAGCATGCTACAGGTGGGACTCTGTTGTCCAAGACCGTGGAAAACGCTCGCACACTTTTAGAGGATATGGCCACCAACAGCTATCAGTG
GCCATCTGAGCGGTCTACACGTAAAAAGATTGCTGCTGGAGTATTTGAGGTTGATAAAGTAAGTGCACTCCAGGCCCAAATGACCTCCCTTGCTAATGCTTTTATGAAAT
TTTCAGCGAACAAACTTCAAACCAAAAGGTCTCCTCCTCCCATTTCGGTGCATTCAGTTAGTACGATGATGTCATCTAGGAAAAAACAGCAACCTCCAAGGATCTTTCTT
GCTGAAATTTGTGAACACGACAACAAGAACTGCACTGATATTCTCATGGGGAAAAACTTGTTGATTGCTTGTGGGAGCAAGGTAAAATCTAGGGAATTTCTTGGGAGTTT
TGATCTCTGTATTGCTAGAGAGAAAATGCAGAGATTTCTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCGAGATTGTGCTTATAGAGGATCGCCCACCGAGGATCCAAATTCTCATCTTAAATCATTTTTAGATATTTGTGGGACGGTAAAGATTAATGGAGTGTCTGAGGA
TGCTATTCGCTTACGTTTATTTCCCTTTTCTTTGCAGGATAAAGCACGAGATTGGTTGCAGTCTATTACTCCTGGGAGCATCACCACCTGGGATGCTTTGGTCCAGGCCT
TTTTAAAGAAAATTTTCCCTCCTGCAAAGACGGTCAAGCTGAGGACCGAGATTGGGACATTCCAACAACAATATGATGAGCAGTTGTTCGAAGGTTGGGAGCGATTCAAA
GAGCTACTGAGGAAGTGTCCTCAGCATGCTACAGGTGGGACTCTGTTGTCCAAGACCGTGGAAAACGCTCGCACACTTTTAGAGGATATGGCCACCAACAGCTATCAGTG
GCCATCTGAGCGGTCTACACGTAAAAAGATTGCTGCTGGAGTATTTGAGGTTGATAAAGTAAGTGCACTCCAGGCCCAAATGACCTCCCTTGCTAATGCTTTTATGAAAT
TTTCAGCGAACAAACTTCAAACCAAAAGGTCTCCTCCTCCCATTTCGGTGCATTCAGTTAGTACGATGATGTCATCTAGGAAAAAACAGCAACCTCCAAGGATCTTTCTT
GCTGAAATTTGTGAACACGACAACAAGAACTGCACTGATATTCTCATGGGGAAAAACTTGTTGATTGCTTGTGGGAGCAAGGTAAAATCTAGGGAATTTCTTGGGAGTTT
TGATCTCTGTATTGCTAGAGAGAAAATGCAGAGATTTCTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDAIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKIFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEGWERFK
ELLRKCPQHATGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTRKKIAAGVFEVDKVSALQAQMTSLANAFMKFSANKLQTKRSPPPISVHSVSTMMSSRKKQQPPRIFL
AEICEHDNKNCTDILMGKNLLIACGSKVKSREFLGSFDLCIAREKMQRFL