; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0026077 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0026077
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationchr10:28791012..28792155
RNA-Seq ExpressionLag0026077
SyntenyLag0026077
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005162 - Retrotransposon gag domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6734747.1 hypothetical protein I3842_01G285500 [Carya illinoinensis]2.7e-8455.88Show/hide
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        MA++++   PR ++DY +PV  G  S I+  PINANNFELK  LI M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVKINGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR 
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        WLQS+ PGSI +W  + + FL KFFPPAKT +LR+EIG F+Q   E L+EAWER+K+L+R+CPQHG PDWLQVQ+FYNGL   T+TIVDAA+GGTL+SKT
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KAG7947748.1 hypothetical protein I3843_14G109500 [Carya illinoinensis]2.7e-8455.88Show/hide
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        MA++++   PR ++DY +PV  G  S I+  PINANNFELK  LI M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVKINGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR 
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        WLQS+ PGSI +W  + + FL KFFPPAKT +LR+EIG F+Q   E L+EAWER+K+L+R+CPQHG PDWLQVQ+FYNGL   T+TIVDAA+GGTL+SKT
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         E A  LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+A G+ E++ + AL A + +L++   + S     +  +  +YV++
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KAG7990634.1 hypothetical protein I3843_02G035100 [Carya illinoinensis]9.5e-9052.8Show/hide
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        MRR +   + P+DPEIERT+  LRR   +   MA++++   PR ++DY +PV  G  S I+  PINANNFELK  LI M +   + GSP +DPN HL  F
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Query:  LDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYP
        L+IC TVKINGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR WLQS+ PGSI +W  + + FL KFFPPAKT +LR+EIG F+Q   E L+EAWER+K+L+R+CPQHG P
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Query:  DWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSGTMKMKR-----
        DWLQVQ+FYNGL   T+TIVDAA+GGTL+SKT E A  LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+A G+ +++ + AL A + +L++     + T ++ +     
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Query:  -------------MEQVQYVSN
                      EQVQYV+N
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WP_217833153.1 retrotransposon gag domain-containing protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002]1.9e-9862.77Show/hide
Query:  LAPLDPEIERTVHR-LRRKTRENFQMADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTV
        L PLDPEI+RT  R LR    +  +MA+    E P+ IRDYFQP     Q GI+  PIN NNFELK GLIQMAR+ A+RG   EDP+ HL+SFL+ICGTV
Subjt:  LAPLDPEIERTVHR-LRRKTRENFQMADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTV

Query:  KINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQL
        K+NGVS D I+LRLFPFSLQD+A+DWL++I P SITTW+ L QAFL K+FPPAK+ +LRTEIGTF+Q  DEQL+EAWER+K+LLR+CPQHGYPDWLQ+QL
Subjt:  KINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQL

Query:  FYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPK-KIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFS
        FYNGL  STK+I+DA AGG++ SK  + A T+LED+AT SY WP ER++P    A G++EVD+VN+L+A M SL NA  K +
Subjt:  FYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPK-KIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFS

XP_023903214.1 uncharacterized protein LOC112015077 [Quercus suber]2.3e-8354.33Show/hide
Query:  MADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARD
        MA+  Q  +PR ++DY +P+     SGI    INANNFELK  LI M +   + GSP +DPN HL  FL+IC TVK+NGV+ED IRLRLFPFSL+DKAR 
Subjt:  MADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARD

Query:  WLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKT
        WLQS+ PGSIT+W  + + FL KFFPPAKT +LR+EIG F+Q   E L+EAWER+K+L+R CPQHG PDWLQVQ+FYNGL   T+TIVDAA+GGTL+SKT
Subjt:  WLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKT

Query:  VENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLAN-----------------AFMKFSGTMKMKRMEQVQYVSN
         E A +LLE+MA+N+YQWP+ER+  KK+A G+ E++   AL A + SL++                 A    +  M     EQVQY++N
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A3S3N117 Retrotrans_gag domain-containing protein8.1e-7949.68Show/hide
Query:  MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLR--RKTRENFQMADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQM-ARDCAYRGSPTEDPNSHL
        MRRN++L L PLDPEIERT+ RL+  +K +  F++ +  + +  R + DY  P+  G  S I    I ANNFE+K  +IQM A    + G P +DPN+H+
Subjt:  MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLR--RKTRENFQMADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQM-ARDCAYRGSPTEDPNSHL

Query:  KSFLDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQH
         +FL++C T K NGV++D +RLRL PFSL+DKA+ WL S+   +ITTWD L + FL KFFPP KTVK+R +I TF Q   E L+EAWER+KELLRKCP H
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Query:  GYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSGTMKMKRME
        G P W+QVQ FYNGL  +T+T +DAA GGTL+ K+ E A  L+E+MATN+YQWPS+    KKI  GV E+D ++AL A + +L+        +MK+  ++
Subjt:  GYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSGTMKMKRME

Query:  QVQYVSNF
            V  F
Subjt:  QVQYVSNF

A0A6J0ZX64 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC1104129452.1e-8254.52Show/hide
Query:  MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLRRKTRENFQMADQNQ-----------------PEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDC
        M+R  +L L P DP+IERT    RR  REN Q+A  NQ                 PE  R +RDY  P+ QG    I    INANNFE+K   IQM +  
Subjt:  MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLRRKTRENFQMADQNQ-----------------PEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDC

Query:  A-YRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFE
          + G P++DPNSHL +FL+IC T K NGV++D IRLRLFPFSL+DKA+ WL S+  GSITTW+ L Q FL KFFPPAKT K+R +I +F Q   E L+E
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Query:  AWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLA
        AWERFKELLR+CP HG PDWLQVQ FYNGL  S KTI+DAAAGG L+SK   +A  LLE+MA+N+YQWPSERS  +K AVG +E+D +  L   + +L+
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A0A6J0ZYV0 uncharacterized protein LOC1104134132.7e-8254.52Show/hide
Query:  MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLRRKTRENFQMADQNQ-----------------PEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDC
        M+R  +L L P DP+IERT    RR  REN Q+A  NQ                 PE  R +RDY  P+ QG    I    INANNFE+K   IQM +  
Subjt:  MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLRRKTRENFQMADQNQ-----------------PEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDC

Query:  A-YRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFE
          + G P++DPNSHL +FL+IC T K NGV++D IRLRLFPFSL+DKA+ WL S+  GSITTW+ L Q FL KFFPPAKT K+R +I +F Q   E L+E
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Query:  AWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLA
        AWERFKELLR+CP HG PDWLQVQ FYNGL  S KTI+DAAAGG L+SK   +A  LLE+MA+N+YQWPSERS  +K AVG +E+D +  L   + +L+
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A0A6J1DU19 uncharacterized protein LOC1110243613.2e-7558.24Show/hide
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        E  Q+   NQ      IRDY QP F     GI+  PINANN ELK GLIQM R+  +RG+ TEDPN+HL  FLD+CGTVK+NGV +D IRLRLFP SLQD
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Query:  KARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTL
        K                  +VQAFL  FFPPAKT +LRTEI +F++   EQLFE WER+KELLRKCPQHG  +WLQ+Q+FYNGL   T+TI+DAAAGGTL
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Query:  LSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSG
        LS+T ENA  LL+DMA NS+QWPSERS  KK+A G++E+D++++L+A + +L NA  K SG
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A0A6P6XAQ1 Reverse transcriptase2.4e-7851.19Show/hide
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        R +RD+  P  QG Q+ IV   +NANNFE+K  LIQM +   Y G+ TEDPNSHL +FL+IC T+K NGVSED I+LRLFPFSL+DKA+ WLQS  P + 
Subjt:  RPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKINGVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSI

Query:  TTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLED
        TTWD L +AFL KFFPP KT KLR +I +F QQ  E L+EAWER++EL R+CP HG PDWL VQ FYNGLT  TKT VDAAAGG L+ KT E A+ L+E+
Subjt:  TTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIVDAAAGGTLLSKTVENARTLLED

Query:  MATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSGTMKMKRM--------------------EQVQYVSNFKLWPSSPPFA
        MA N+YQW +ER   ++ A G+ EVD +N L A M ++     +  G+   + +                    EQVQY++N+   P + P++
Subjt:  MATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSGTMKMKRM--------------------EQVQYVSNFKLWPSSPPFA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGTAGGAATAAAGATTTAATTTTAGCACCTTTGGATCCCGAGATAGAAAGAACCGTCCATAGGCTTCGAAGGAAAACTAGAGAAAATTTTCAAATGGCTGACCAAAA
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GGAGTGTCTGAGGATGTTATTCGCTTACGTTTATTTCCCTTTTCTTTGCAGGATAAAGCACGAGATTGGTTGCAGTCTATTACCCCTGGGAGCATCACCACTTGGGATGC
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GGGAGCGATTCAAAGAGCTACTGAGGAAGTGTCCTCAGCATGGTTACCCCGATTGGCTCCAGGTACAATTATTTTATAATGGTTTAACTCCTAGTACAAAAACGATTGTT
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TAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRNKDLILAPLDPEIERTVHRLRRKTRENFQMADQNQPEEPRPIRDYFQPVFQGQQSGIVYAPINANNFELKIGLIQMARDCAYRGSPTEDPNSHLKSFLDICGTVKIN
GVSEDVIRLRLFPFSLQDKARDWLQSITPGSITTWDALVQAFLKKFFPPAKTVKLRTEIGTFQQQYDEQLFEAWERFKELLRKCPQHGYPDWLQVQLFYNGLTPSTKTIV
DAAAGGTLLSKTVENARTLLEDMATNSYQWPSERSTPKKIAVGVFEVDKVNALQAHMTSLANAFMKFSGTMKMKRMEQVQYVSNFKLWPSSPPFAVSRRRPATGVEEEAT