; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0028058 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0028058
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
Genome locationchr8:12010504..12011857
RNA-Seq ExpressionLag0028058
SyntenyLag0028058
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AEH04468.1 NADH dehydrogenase subunit 5, partial [Klainedoxa gabonensis]1.8e-3495.24Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

AUD38901.1 NADH dehydrogenase subunit 5, partial [Amphidasya ambigua]6.9e-3494.05Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G ASLFPFTYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

AUD38903.1 NADH dehydrogenase subunit 5, partial [Lasianthus sp. Kainulaninen et al. 17]5.3e-3494.05Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FPFTYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

KAG5107114.1 hypothetical protein JHK82_044084 [Glycine max]3.7e-3554.95Show/hide
Query:  MAWGSSAQKSKAPTIRDMILLARAALGRPARILPD--LKGPLWL---------TRGQEIHRPSSAVHRVGLFILL--VSSVFLDSYSDPWAQDVPCV-GF
        +A  S  ++  A    D++       G P  +LP    +   W+         T+  +    +  V+RVG F L   +S   + + SD   QD+  + G 
Subjt:  MAWGSSAQKSKAPTIRDMILLARAALGRPARILPD--LKGPLWL---------TRGQEIHRPSSAVHRVGLFILL--VSSVFLDSYSDPWAQDVPCV-GF

Query:  ASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        AS FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  ASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

QCB20463.1 NADH dehydrogenase subunit 5 [Actinidia chinensis]1.8e-3488.89Show/hide
Query:  QDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        QD+  +GF + FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  QDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2H4WZZ0 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (Fragment)2.6e-3494.05Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FPFTYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

A0A2H4X011 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (Fragment)3.4e-3494.05Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G ASLFPFTYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

A0A4D6FUF3 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 58.8e-3588.89Show/hide
Query:  QDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        QD+  +GF + FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  QDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

A0A4D6J902 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 58.8e-3588.89Show/hide
Query:  QDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        QD+  +GF + FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  QDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

F8TCC3 NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment)8.8e-3595.24Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P10330 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 57.7e-3692.86Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFR LFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

P26849 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.4e-3488.1Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G ASL PFTYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSV  TSYYSFR LFLTFL PTNSF+RD+
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

P29388 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.1e-3490.48Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFR LFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

P50366 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.7e-1953.57Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G   + PFTY M L+GSLSL+GFPFLTGFYSKD+ILE+A+  ++ +G+FA+WLG++    T++YS R LF  FL  TN+++  I
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

Q37680 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.1e-3491.57Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERD
        G AS FP TYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFR LFLTFLVPTNSF RD
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATMG00060.1 NADH dehydrogenase subunit 5C7.9e-3690.48Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFR LFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

ATMG00513.1 NADH dehydrogenase 5A7.9e-3690.48Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFR LFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI

ATMG00665.1 NADH dehydrogenase 5B7.9e-3690.48Show/hide
Query:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI
        G AS FP TYAMML+GSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAY KYTISGNFAFWLGSVSVL TSYYSFR LFLTFLVPTNSF RDI
Subjt:  GFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLFLTFLVPTNSFERDI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCGCTTCCTTACTTCAGTTTGAGGATCCTCGATATGTTGATCCCCTATCAGCTCATGATATTATTTCAGTATGTTCTTGGTCAGAGATACATATATCCTCCAGGCA
ACGAAGCATATTAGGGCTATCGAGTTGGGTTTTTTTCCGCATTGCAGCTTTGTTGGGATGTTGGACGGCAGTCGGGTCCACGTCGAGAATGGCTTGGGGTAGCAGTGCCC
AAAAATCAAAAGCACCTACTATAAGGGACATGATCCTTCTAGCTCGCGCTGCACTAGGTAGACCCGCCAGAATACTTCCCGATTTGAAGGGGCCGCTTTGGCTGACCCGT
GGTCAAGAAATCCATAGGCCAAGCTCGGCAGTCCACCGGGTGGGTTTGTTTATCCTTCTAGTTTCGAGTGTCTTCTTGGATAGTTATAGCGACCCATGGGCGCAAGATGT
ACCTTGTGTGGGGTTTGCCTCCTTGTTCCCTTTTACCTATGCCATGATGCTCATGGGTAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCTTTTCTAACTGGATTCTATTCAAAAGATG
TGATCTTAGAGCTCGCTTACATTAAGTATACCATCAGTGGGAACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTGTCTCTGTCCTTCTCACTTCTTATTACTCTTTTCGTTCACTTTTT
CTAACATTTCTAGTACCAACTAATTCATTCGAGCGAGACATCTGTTGGGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTCGCTTCCTTACTTCAGTTTGAGGATCCTCGATATGTTGATCCCCTATCAGCTCATGATATTATTTCAGTATGTTCTTGGTCAGAGATACATATATCCTCCAGGCA
ACGAAGCATATTAGGGCTATCGAGTTGGGTTTTTTTCCGCATTGCAGCTTTGTTGGGATGTTGGACGGCAGTCGGGTCCACGTCGAGAATGGCTTGGGGTAGCAGTGCCC
AAAAATCAAAAGCACCTACTATAAGGGACATGATCCTTCTAGCTCGCGCTGCACTAGGTAGACCCGCCAGAATACTTCCCGATTTGAAGGGGCCGCTTTGGCTGACCCGT
GGTCAAGAAATCCATAGGCCAAGCTCGGCAGTCCACCGGGTGGGTTTGTTTATCCTTCTAGTTTCGAGTGTCTTCTTGGATAGTTATAGCGACCCATGGGCGCAAGATGT
ACCTTGTGTGGGGTTTGCCTCCTTGTTCCCTTTTACCTATGCCATGATGCTCATGGGTAGCTTATCTCTAATTGGATTTCCTTTTCTAACTGGATTCTATTCAAAAGATG
TGATCTTAGAGCTCGCTTACATTAAGTATACCATCAGTGGGAACTTTGCTTTCTGGTTGGGAAGTGTCTCTGTCCTTCTCACTTCTTATTACTCTTTTCGTTCACTTTTT
CTAACATTTCTAGTACCAACTAATTCATTCGAGCGAGACATCTGTTGGGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLASLLQFEDPRYVDPLSAHDIISVCSWSEIHISSRQRSILGLSSWVFFRIAALLGCWTAVGSTSRMAWGSSAQKSKAPTIRDMILLARAALGRPARILPDLKGPLWLTR
GQEIHRPSSAVHRVGLFILLVSSVFLDSYSDPWAQDVPCVGFASLFPFTYAMMLMGSLSLIGFPFLTGFYSKDVILELAYIKYTISGNFAFWLGSVSVLLTSYYSFRSLF
LTFLVPTNSFERDICWV