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Lag0028090 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0028090
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionCCHC-type domain-containing protein
Genome locationchr8:12719830..12721518
RNA-Seq ExpressionLag0028090
SyntenyLag0028090
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036691 - Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAF4351405.1 hypothetical protein F8388_001025, partial [Cannabis sativa]6.5e-2345.31Show/hide
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KAF4381998.1 hypothetical protein G4B88_006630 [Cannabis sativa]2.4e-2548.44Show/hide
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KAF4383622.1 hypothetical protein F8388_014122 [Cannabis sativa]2.4e-2548.44Show/hide
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KAF4391101.1 hypothetical protein F8388_009523 [Cannabis sativa]2.2e-2347.97Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A7J6DPD3 CCHC-type domain-containing protein1.2e-2548.44Show/hide
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A0A7J6DZ24 CCHC-type domain-containing protein3.1e-2345.31Show/hide
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A0A7J6GGL8 CCHC-type domain-containing protein1.2e-2548.44Show/hide
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A0A7J6GL46 CCHC-type domain-containing protein1.2e-2548.44Show/hide
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A0A7J6H857 Uncharacterized protein1.1e-2347.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGTCGTTATCGTAAGGAGTGAAGCGAAAATTCCTAGGGAGAACGATTTTACTAGGGATGTCAGAGGCAAACAGGATAAGGACAGAAAGGACAAGTCTGATGGTCAGCTGG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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