; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0028107 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0028107
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr8:13329045..13330271
RNA-Seq ExpressionLag0028107
SyntenyLag0028107
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
No hits found
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A7N8YI77 Uncharacterized protein2.1e-0431.47Show/hide
Query:  TLGVHFP-RSSYRTVGRTLIVLVPQSGVRTVGETLIFSAPLSSVRMVGRT----LGIFVPRTSGRSGDVDFLGTSVQFTHGREDAWGLFSTIKLRNGRED
        T  V+ P R+  +TVGRT +  V ++ V+T G T + SA  + V+  GRT     G    +T GR+ DV   G +   T GR D   +  T     GR D
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              T   T GR DV            S GR+          +VGRT +     + V + G T + SA R++V+  GRT   +  R+ V++ R N
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACGCATGGCCGGGAGGACGCTCGGGTTCTCTGTTCCAGGAACAAGTGTACGGAACGGTCTGGAGGAGGCTAATTGTCCCTGTTCCACGATCCAGTGTACGGACGGT
CAAGGGGACGTTGATTTTCTCGGCTCCTCGGTCCAGTTTACGCATGGCTGGGAAGACGCTCGGGGTCCATTTTCCACGATCAAGTTACCGAACGGTCGGGAGGACGCTCA
TTGTCCTTGTTCCACAATCTGGTGTACGGACGGTCGGGGAGACGTTGATTTTCTCGGCTCCTCTGTCCAGTGTACGCATGGTCGGGAGGACGCTCGGGATCTTTGTTCCA
CGAACAAGTGGACGGTCGGGGGATGTTGATTTTCTCGGCACCTCGGTCCAGTTTACGCATGGCCGGGAAGACGCTTGGGGTCTATTTTCCACGATCAAGTTACGGAACGG
TCGGGAGGACGCTCATTGTCCTTGTTCCACAATCTGGTGTACGGACGGTCGGTTGGACGTTGATTTTCTCGGCTCCTCTGTCCAATTGTACGCATGGTCGAGAGGACGCT
CGGGTTCTTTGTTCCACGAACAAGTGTATGGAACAGTCGGGAGGACACTCATTGTCCTTGTTCCACTCTCCGGTGTAGGGACGGTCGGGGGGACGTTGATTTTCTCGGCT
CCTCGGTCCAATGTACGCATGGACGGGAGGACGTTGGGGGTCTCTTTTCCACGATCAAGTGTACGGAACGGTCGGGAGAACGCTCATTGTCCCTTTTCCACGATCTGGTG
TACGGACGGTCGCTGGACGTTGAATTTCTCGGCTCCTCGGTCTAGTGTACGCATAGCCGAGAGAACGCTCGGGTTACCTGTTCCACGAACAAGTTTACAGAACGGTCGGG
AGGACACACATTGTCCTTATTCCACTCCCCGGTGTATGGACGGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CAAGGGGACGTTGATTTTCTCGGCTCCTCGGTCCAGTTTACGCATGGCTGGGAAGACGCTCGGGGTCCATTTTCCACGATCAAGTTACCGAACGGTCGGGAGGACGCTCA
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TCGGGAGGACGCTCATTGTCCTTGTTCCACAATCTGGTGTACGGACGGTCGGTTGGACGTTGATTTTCTCGGCTCCTCTGTCCAATTGTACGCATGGTCGAGAGGACGCT
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AGGACACACATTGTCCTTATTCCACTCCCCGGTGTATGGACGGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYAWPGGRSGSLFQEQVYGTVWRRLIVPVPRSSVRTVKGTLIFSAPRSSLRMAGKTLGVHFPRSSYRTVGRTLIVLVPQSGVRTVGETLIFSAPLSSVRMVGRTLGIFVP
RTSGRSGDVDFLGTSVQFTHGREDAWGLFSTIKLRNGREDAHCPCSTIWCTDGRLDVDFLGSSVQLYAWSRGRSGSLFHEQVYGTVGRTLIVLVPLSGVGTVGGTLIFSA
PRSNVRMDGRTLGVSFPRSSVRNGRENAHCPFSTIWCTDGRWTLNFSAPRSSVRIAERTLGLPVPRTSLQNGREDTHCPYSTPRCMDG