| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6579070.1 hypothetical protein SDJN03_23518, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 7.3e-83 | 93.29 | Show/hide |
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V+GATMFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLR+NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIEN+GKGLI DGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEI+EA+VTMVNKM
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GFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| KAG7032688.1 hypothetical protein SDJN02_06738, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.5e-83 | 94.51 | Show/hide |
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V+GATMFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLR+NLV+KLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIEN+GKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEI+EAVVTMVNKM
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GFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| XP_022939214.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 isoform X1 [Cucurbita moschata] | 5.6e-83 | 92.73 | Show/hide |
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|
|
| XP_038906688.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 [Benincasa hispida] | 8.0e-82 | 96.23 | Show/hide |
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|
|
| XP_038906991.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like [Benincasa hispida] | 1.4e-81 | 95.6 | Show/hide |
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A061H000 DNA-directed RNA polymerase II isoform 4 | 1.5e-81 | 96.18 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLR+NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGE++EAVVTMVNKMGFFAE
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|
|
| A0A0A0KPS4 Uncharacterized protein | 1.1e-81 | 95.6 | Show/hide |
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| A0A2P5BKN9 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase | 1.5e-81 | 94.97 | Show/hide |
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| A0A2P5BPN1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase | 1.5e-81 | 94.97 | Show/hide |
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| A0A6J1FGH6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 isoform X1 | 2.7e-83 | 92.73 | Show/hide |
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+V+GATMFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLR+NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIEN+GKGLI DGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEI+EA+VTMVNK
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MGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P38421 DNA-directed RNA polymerase II subunit 7 | 3.9e-79 | 90.57 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPR FGRNL++NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGI+ +GKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEI+EAVVT+VNKMGFFAE
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Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
AGPVQIFVS HLIPDDMEFQAGD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT I V
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|
|
| P46279 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.5e-83 | 94.34 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPR+FGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVA+TGIEN+GKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEI+EAVVTMVNKMGFFAE
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Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEI +
Subjt: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
|
|
| P62487 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 2.3e-47 | 54.37 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAE
MF+HI LE + LHPR+FG NL + + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+N+G G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+V+AVVT VNK+G F E
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Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQA-GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
GP+ F+S H IP +MEF + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +I ++
Subjt: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQA-GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
|
|
| Q5E9B8 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 2.3e-47 | 54.37 | Show/hide |
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MF+HI LE + LHPR+FG NL + + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+N+G G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+V+AVVT VNK+G F E
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GP+ F+S H IP +MEF + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +I ++
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|
|
| Q7ZW41 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 2.3e-47 | 55 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAE
MF+HI LE + LHPR+FG NL + + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+N+G G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+V+AVVT VNK+G F E
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Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQA-GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
GP+ F+S H IP +MEF + P Y T D V IQ+D E+RLKI+GTRVD +I ++
Subjt: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQA-GDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06790.1 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 8.5e-05 | 32.18 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEA
MF+ LE ++++ P L D + S L G V+I I++V G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
Subjt: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEA
|
|
| AT1G06790.2 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 8.5e-05 | 32.18 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEA
MF+ LE ++++ P L D + S L G V+I I++V G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
Subjt: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEA
|
|
| AT3G22900.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 3.8e-13 | 36.45 | Show/hide |
Query: GFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
G+++ T +EN+G+G I++ TG + FPV + + F+ FKGEIV VV V+K G F ++GP +I +H+ EF G+ P + S +IQ + V
Subjt: GFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
Query: RLKIIGT
R ++ T
Subjt: RLKIIGT
|
|
| AT4G14660.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 1.1e-12 | 35.19 | Show/hide |
Query: GFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
G+ VA+T ++ +G+G IR+ TG V FPV + + F+ FKGEI+ VV V K G F GP++ ++ D ++ G+ P + S +IQ ++ V
Subjt: GFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
Query: RLKIIGTR
R+ +IG +
Subjt: RLKIIGTR
|
|
| AT5G59180.1 DNA-directed RNA polymerase II | 2.7e-80 | 90.57 | Show/hide |
Query: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAE
MFFHIVLERNMQLHPR FGRNL++NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGI+ +GKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEI+EAVVT+VNKMGFFAE
Subjt: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRDNLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENVGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIVEAVVTMVNKMGFFAE
Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
AGPVQIFVS HLIPDDMEFQAGD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT I V
Subjt: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQAGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIISV
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