; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0028818 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0028818
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionOmpA-like domain-containing protein
Genome locationchr8:31304892..31305731
RNA-Seq ExpressionLag0028818
SyntenyLag0028818
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAE1298543.1 unnamed protein product [Sepia pharaonis]7.4e-1131.28Show/hide
Query:  PSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPL
        P  L S S  P I         P  L S S    I   F     P  L S S  P I   F     P +L S S  P I         P+ L S S  P+
Subjt:  PSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPL

Query:  IQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHP--PRLASGSDQPLIQVEFRMVTR
        I   F     P  L S S    I       + P HL S S  P I   F     P  L S S  P I   FR+  +P    L S S  P I   F     
Subjt:  IQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHP--PRLASGSDQPLIQVEFRMVTR

Query:  PPHLASKVIHP
        PPHL S    P
Subjt:  PPHLASKVIHP

CAE1322405.1 unnamed protein product [Sepia pharaonis]2.2e-1532.74Show/hide
Query:  SGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEF
        S S  P I         P+ L S S  P I         PS L S S  P I         P+ L S S  P I         PS L S SD P I    
Subjt:  SGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEF

Query:  RMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTH--PPRLA
             P+ L S SD P I         PS L S S  P I  +      PSHL S SD P I         P+ L S S  P I   FR+  H  P  L 
Subjt:  RMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTH--PPRLA

Query:  SGSDQPLIQVEFRMVTRPPHLAS
        S S  P I         P HL S
Subjt:  SGSDQPLIQVEFRMVTRPPHLAS

TKB60813.1 hypothetical protein E8D48_12710 [Nitrospira sp.]8.2e-1030.73Show/hide
Query:  QPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT
        + L QA+ R+     +L +G  Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R VT   +  +G +Q L Q++ R  T   +  +G +Q L Q + R+  
Subjt:  QPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT

Query:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQP
           ++A G +Q L QA+ R VT   +  +  +Q L QA+ R        ASG +Q L QA+ R +T      +G +Q L Q K R  T   +  +  +Q 
Subjt:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQP

Query:  LIQVE
        L Q++
Subjt:  LIQVE

TKB93260.1 hypothetical protein E8D40_03920 [Nitrospira sp.]1.4e-0930.24Show/hide
Query:  QPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT
        + L QA+ ++     +L +G  Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R V    +  +G +Q L Q + R      ++A G +Q L Q + R+  
Subjt:  QPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT

Query:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQP
           ++A G +Q L QA+ R VT   +  +  +Q L QA  R        ASG +Q L QAK R+      +A G +Q L Q + R  T   +  +  +Q 
Subjt:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQP

Query:  LIQAK
        L Q K
Subjt:  LIQAK

XP_036790364.1 proline-rich protein 36-like [Oncorhynchus mykiss]5.0e-1532.36Show/hide
Query:  PSCLALGSDQPLIQAEFKMVTRPSCLASGSDQPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPL
        P  L   S QPL        T P  L + S QPL        T P  L + S QPL       +T P  L + S QPL        T PS L + S QPL
Subjt:  PSCLALGSDQPLIQAEFKMVTRPSCLASGSDQPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPL

Query:  IQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPS
                T P  L + S QPL        T PS L + S QPL        T P  L + S QPL        T P  L + S QPL        T P 
Subjt:  IQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPS

Query:  HLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQPLIQVEFRMVTRPPHLASKVIHP
        +L + S QPL        T P  L + S QPL        T P  L + S QPL  +     T P +L +  + P
Subjt:  HLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQPLIQVEFRMVTRPPHLASKVIHP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1Q3SFW0 Uncharacterized protein5.9e-0623.35Show/hide
Query:  PSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPL
        PS    G+   +  ++      P+  A G+      ++   V+ P+  A+G   P  QA    +T  S  A+ S    +QA  ++VT  S  A+GS   +
Subjt:  PSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPL

Query:  IQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVT
          A  ++V+  S  AS +     QA   ++   S +++G       A  + +   S +A+ +   + QA  + VT  S  A+ +    +QA  + +T
Subjt:  IQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVT

A0A532CB75 OmpA-like domain-containing protein4.0e-1030.73Show/hide
Query:  QPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT
        + L QA+ R+     +L +G  Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R VT   +  +G +Q L Q++ R  T   +  +G +Q L Q + R+  
Subjt:  QPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT

Query:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQP
           ++A G +Q L QA+ R VT   +  +  +Q L QA+ R        ASG +Q L QA+ R +T      +G +Q L Q K R  T   +  +  +Q 
Subjt:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQP

Query:  LIQVE
        L Q++
Subjt:  LIQVE

A0A532D4P0 OmpA-like domain-containing protein7.5e-0930.81Show/hide
Query:  LASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQA
        LAS +++ + QA+ R+     +L +G  Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R +T      +G +Q L QA+ R      ++A G +Q L Q 
Subjt:  LASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQA

Query:  EFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLA
        + R+     ++A G +Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R        ASG DQ L QA+ R +T      +G +Q L Q K R  T   +  
Subjt:  EFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLA

Query:  SGSDQPLIQVE
        +  +Q L Q++
Subjt:  SGSDQPLIQVE

A0A532DWP9 OmpA-like domain-containing protein1.7e-0832.98Show/hide
Query:  LASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQA
        LAS +++ L QA+ R+     +L +G  Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R +T      +G +Q L QA+ R      ++A G +Q L Q 
Subjt:  LASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQA

Query:  EFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQPLIQVEFR
        + R+     ++A G +Q L QAK R        A   +Q L QA  R        ASG DQ L QAK R +T      +G +Q L Q + R
Subjt:  EFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQPLIQVEFR

A0A532EZ47 OmpA-like domain-containing protein6.8e-1030.24Show/hide
Query:  QPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT
        + L QA+ ++     +L +G  Q L QA+ R      + A   +Q L QA+ R V    +  +G +Q L Q + R      ++A G +Q L Q + R+  
Subjt:  QPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVT

Query:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQP
           ++A G +Q L QA+ R VT   +  +  +Q L QA  R        ASG +Q L QAK R+      +A G +Q L Q + R  T   +  +  +Q 
Subjt:  RPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQP

Query:  LIQAK
        L Q K
Subjt:  LIQAK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCACTCGCCCTTCATGTCTTGCCTTAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAAGATGGTCACTCGCCCTTCATGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACC
CCTGATTCAGGCGGAATTCAAGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTC
TTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGG
ATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACC
CCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTC
TTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGAAATTCAGGATGGTCACTTGCCCTTCACATCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTTAGG
ATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGAAATTTAGGATGGTCACTCACCCTCCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACC
CCTGATTCAGGTGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTCCACATCTTGCTTCGAAAGTGATCCATCCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCACTCGCCCTTCATGTCTTGCCTTAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAAGATGGTCACTCGCCCTTCATGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACC
CCTGATTCAGGCGGAATTCAAGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTC
TTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGG
ATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACC
CCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTTCACGTC
TTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGAAATTCAGGATGGTCACTTGCCCTTCACATCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGGAATTTAGG
ATGGTCACTCGCCCTTCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACCCCTGATTCAGGCGAAATTTAGGATGGTCACTCACCCTCCACGTCTTGCCTCAGGCAGTGATCAACC
CCTGATTCAGGTGGAATTCAGGATGGTCACTCGCCCTCCACATCTTGCTTCGAAAGTGATCCATCCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVTRPSCLALGSDQPLIQAEFKMVTRPSCLASGSDQPLIQAEFKMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFR
MVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAEFRMVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTCPSHLASGSDQPLIQAEFR
MVTRPSRLASGSDQPLIQAKFRMVTHPPRLASGSDQPLIQVEFRMVTRPPHLASKVIHP